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【中文期刊】 王凡 徐世明 等 《国际检验医学杂志》 2023年44卷24期 2963-2969页 ISTICCA
【摘要】 目的 分析斑马鱼E3泛素蛋白连接酶1(MIB1)基因启动子区转录因子结合位点(TFBS),MIB1互作基因和互作蛋白的种类及其在信号通路中的作用,探讨MIB1基因的调控方式及潜在功能.方法 利用国家基因组科学数据中心(NGDC)预测非编码R...
【关键词】 生物信息学; E3泛素蛋白连接酶1; 启动子;
【中文期刊】 《基因组蛋白质组与生物信息学报(英文版)》 2009年7卷4期 155-162页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 Transcription factor (TF) binding to its DNA target site plays an essential role in gene regulation.The location,orienta...
【关键词】 gene regulation; nucleosome; transcription factor binding site;
【中文期刊】 翟亚男 许泉 等 《遗传》 2016年38卷4期 323-336页 MEDLINEISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 哺乳动物中原钙粘蛋白(Protocadherin,Pcdh)基因簇包含50多个串联排列的基因,这些基因形成3个紧密相连的基因簇(Pcdhα、Pcdhβ和 Pcdhγ),所编码的原钙粘蛋白质群在神经元多样性(Neuronal diversit...
【中文期刊】 《分子植物(英文版)》 2019年12卷6期 743-763页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 Transcription factors (TFs) are key cellular components that control gene expression.They recognize specific DNA sequenc...
【关键词】 Transcription factor binding site; Gene regulation; flower development;
【中文期刊】 《基因组蛋白质组与生物信息学报(英文版)》 2008年6卷3期 129-143页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 A systematic phylogenetic footprinting approach was performed to identify conserved transcription factor binding sites (...
【关键词】 phylogenetic footprinting; phosphoenolpyruvate carboxykinase; transcription factor binding sites;
【中文期刊】 《遗传学报》 2018年45卷7期 373-379页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 Understanding the functional effects of genetic variants is crucial in modern genomics and genetics.Transcription factor...
【关键词】 Compound effect; Transcription factor binding site; Variant annotation;
【中文期刊】 《生物化学与生物物理学报(英文版)》 2004年36卷4期 250-258页 SCISCIEMEDLINEISTICCSCDBP
【摘要】 Several discriminate functions for predicting core promoters that based on the potential cooperation between transcripti...
【关键词】 promoter; transcription factor binding site; transcription start site;
【中文期刊】 丁承强 常忠原 等 《植物学报》 2017年52卷1期 70-76页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 FLORICAULA/LEAFY是植物特有的转录因子,其可以通过调控下游基因的表达对植物的发育起到调控作用.水稻(Oryza sativa)中的同源基因RFL (Rice FLORICAULA/LEAFY)能够调控多个发育过程,包括开花、叶...
【中文期刊】 张宁波 程酩 等 《基因组学与应用生物学》 2016年35卷11期 2867-2871页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 增强子控制着多能性相关基因的转录,在细胞分化中起重要作用.数以千计的GWAS研究结果表明,一定数量疾病相关的SNP位于增强子区域,且近来的研究发现SNP通过影响增强子的功能引起对疾病的易感性,因此有必要对增强子区域的SNP进行整合和分析.我...
【中文期刊】 别延红 李纳 等 《山东医药》 2017年57卷2期 5-9页 ISTICCA
【摘要】 目的:观察内源性转录因子增强子结合蛋白-4(AP-4)沉默对子宫内膜癌细胞凋亡的影响,并探讨其可能的作用机制。方法将人子宫内膜癌细胞(HEC-1-A 和 RL95-2)分为 NC 组、si#1组、si#2组,si#1组转染 si-TFAP4...
【关键词】 转录因子增强子结合蛋白-4; 子宫内膜癌; 存活素;
【中文期刊】 靳昌忠 李杰 等 《中华微生物学和免疫学杂志》 2009年29卷12期 1075-1079页 ISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 目的 研究AP-1和ETS-1转录因子结合位点(TFBS)缺失对树突状细胞特异性胞间黏附分子-3结合非整合素(DC-SIGN)启动子活性的影响,探讨DC-SIGN表达的机制.方法 从人外周血中提取全基因组DNA,设计DC-SIGN启动子序列...
【中文期刊】 Sujit Nair Celine Liew 等 《中国药学(英文版)》 2014年23卷8期 511-524页 ISTICCSCDCA
【关键词】 Prostate cancer; Signaling network; Target hub;
【中文期刊】 虞梅芳 王进城 等 《生物物理学报》 2014年30卷5期 336-348页 MEDLINEISTICCA
【摘要】 RGS(regulators of G protein signaling)是G蛋白偶联信号通路中一类重要的调节蛋白,通过加速Gα结合的GTP水解,即GAP (GTPase activating protein)活性,来中止G蛋白信号通路....
【关键词】 Gαq; RGS4蛋白表达; ICE转录因子结合区;
【中文期刊】 《中国免疫学杂志(英文版)》 2004年1卷6期 425-435页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 The molecular mechanisms for NF-κB signaling transduction and transcription have been the most attractive subjects for b...
【关键词】 transcription factor; NF-κB; signaling pathway;
【中文期刊】 张娟娟 刘宗霞 等 《中国病理生理杂志》 2015年6期 1026-1031页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的:探讨转录因子c-Jun对Mepe基因的转录调控作用,并寻找c-Jun在Mepe启动子上的特异性结合位点。方法:利用免疫组织化学方法定位c-Jun与Mepe在小鼠骨组织的表达;采用real-time PCR的方法检测c-Jun的表达量改...
【关键词】 转录因子c-Jun; 细胞外基质磷酸化糖蛋白; 成骨细胞;
【中文期刊】 王丹 《江苏大学学报(医学版)》 2015年4期 311-316页 ISTICCA
【摘要】 目的:研究miRNA-145(miR-145)抑制肺癌A549细胞增殖活性的机制。方法:应用生物信息学方法预测Sp1基因3′-UTR区与miR-145的结合位点并通过荧光素酶报告基因法进行验证;转染miRNA-145拟似物和阻遏物到A549...
【中文期刊】 《基因组蛋白质组与生物信息学报(英文版)》 2018年16卷5期 342-353页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 Transcriptional regulation is critical to cellular processes of all organisms. Regulatory mechanisms often involve more ...
【关键词】 Transcription factors; Coregulation; Protein–protein interactions;
【中文期刊】 《分子植物(英文版)》 2019年12卷6期 822-832页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 Auxin is a key hormone performing a wealth of functions throughout the life cycle of plants.It acts largely by regulatin...
【关键词】 Auxin; Auxin Response Factor; DAP-seq;
【中文期刊】 熊思敏 赵娜 等 《南方医科大学学报》 2015年6期 888-893页 MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的:探讨血浆甘露聚糖结合凝集素(MBL)相关丝氨酸蛋白酶2(MASP2)水平在儿童上呼吸道感染(上感)中的意义。方法取103例上感患儿和35例健康体检儿童作为研究对象,测定其血浆MASP2和C反应蛋白(CRP)浓度并进行白细胞计数(WBC...
【关键词】 甘露聚糖结合凝集素相关丝氨酸蛋白酶2; 上呼吸道感染; C反应蛋白;
【中文期刊】 《中国免疫学杂志(英文版)》 2010年07卷4期 288-295页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 Nucleotide-binding and oligomerization domain 2(NOD2),a member of the NOD protein family,plays an important role in inna...
【关键词】 innate immunity; NF-κB binding site; NOD2;
【中文期刊】 郇蕾 王旭旭 等 《植物生理学报》 2017年53卷7期 1259-1266页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 脱落酸(ABA)在植物的生长发育中起着重要的作用,ABI5是响应ABA信号的关键基因,研究调控ABI5基因表达的转录因子对进一步阐述ABA信号转导及调控具有重要意义.本研究中,将3-AF1、Box I和Sp1三次重复串联后连接到pAbAi诱...
【中文期刊】 李明阳 马春霞 等 《生物技术通讯》 2017年28卷5期 590-594页 ISTICCA
【摘要】 目的:分析富含丝氨酸和精氨酸的剪接因子2(SRSF2)基因序列和表达产物的特征.方法:运用生物信息学相关软件分析和预测人类和小鼠SRSF2基因的同源区段、开放读框、启动子区域、转录因子结合位点、CpG岛分布情况,分析预测小鼠SRSF2基因蛋...
【关键词】 富含丝氨酸和精氨酸的剪接因子2(SRSF2); 生物信息学; 蛋白质相互作用;
【中文期刊】 高晓宁 于力 《中华血液学杂志》 2008年29卷12期 806-810页 MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 研究转录因子E2F1对KIR3DL1基因启动子转录活性的影响,明确其调控KIR3DL1基因表达的分子机制.方法 采用PCR方法 从K562细胞基因组DNA中扩增突变型KIR3DL1基因启动子序列,将产物连接到pGL3-Basic荧光素...
【关键词】 基因,KIR3DL1; 转录因子,E2F1; 基因表达;
【中文期刊】 许利军 常秀春 等 《生物化学与生物物理进展》 2008年35卷1期 50-55页 SCIISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 树突状细胞表面特异的胞间黏附分子3捕获非整合素(DC-specific intercellular adhesion molecule-3-grabbing nonintegrin,DC-SIGN)是树突状细胞表面特异的蛋白,在抗原呈递过程...
【关键词】 核转录因子κBp50; 树突状细胞表面特异的胞间黏附分子3捕获非整合素; 白细胞介素4;
【中文期刊】 《临床肿瘤与癌症研究(英文版)》 2010年7卷1期 12-17页 SCIMEDLINEISTICCSCDCABP
【摘要】 OBJECTIVE To examine the effect of Pin1 on the expression and bioactivity of MMP-9 through NF-κB in human colorectal car...
【关键词】 colorectal cancer; Pin1; RNAi;
【中文期刊】 侯琳 钱敏平 等 《遗传》 2009年31卷4期 365-373页 MEDLINEISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 转录因子结合位点(Transcription factor binding site,TFBS)是与转录因子结合的DNA序列,它们与转录因子相互作用调控基因的转录过程.确定TFBS是理解转录调控机制,建立转录调控网络的关键问题.随着高通量实...
【中文期刊】 吴文君 时俊锋 等 《中华糖尿病杂志》 2015年7卷12期 754-758页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 探讨固醇调节元件结合蛋白1c(SREBP-1c)抑制骨骼肌细胞胰岛素受体底物1 (IRS-1)基因转录的具体分子机制.方法 将SREBP-1c表达质粒、IRS-1启动子荧光素酶报告质粒及海肾质粒胸腺嘧啶核苷激酶启动子(pRL-TK)采...
【关键词】 固醇调节元件结合蛋白1c; 棕榈酸; 骨骼肌;
【中文期刊】 查郎 彭旭东 等 《基础医学与临床》 2017年37卷5期 643-647页 ISTICCA
【摘要】 目的 探讨纺锤菌素(netropsin)对胃癌细胞侵袭和转移能力的影响及其分子机制.方法 用Transwell检测胃癌细胞侵袭和转移能力,用Western blot检测EMT相关标志物E-cadherin和vimentin表达,用免疫荧光检...
【中文期刊】 张俊珍 范瑞文 等 《中国兽医杂志》 2013年49卷6期 7-9,13页
【摘要】 哺乳动物皮肤具有多种功能,这些功能是由基因决定的,而基因的表达要受到转录因子的调节.本研究通过参照人皮肤基因的转录因子分析羊驼皮肤的EST库,发现了8个转录因子和6个转录因子结合位点,它们调控着羊驼生活适应性、皮肤生理特征以及皮肤衍生物的生...
【外文期刊】 Mark S,Hill ; Max,Reuter ; 等 《Proceedings. Biological sciences》 2019年286卷1904期 20190660页 SCIMEDLINEBP
【外文期刊】 Michael,Rose ; Claudia,Schubert ; 等 《Epigenetics》 2014年9卷12期 1626-40页 SCIMEDLINEBP
【关键词】 ATCC, American Type Culture Collection; BMP-2, bone morphogenetic protein 2; CA, California;
【外文期刊】 Tao,Ma ; Zhenqing,Ye ; 等 《Current medicinal chemistry》 2019年26卷42期 7641-7654页 SCIMEDLINECABP
【外文期刊】 Przemyslaw,Szafranski ; Justyna A,Karolak ; 等 《Mammalian genome : official journal of the International Mammalian Genome Society》 2017年28卷7-8期 275-282页 SCIMEDLINEBP
【关键词】 Deletion Allele; Genome Editing; Transcription Factor Binding Site;
【外文期刊】 Shicai,Liu ; Jian,Wu ; 等 《Computational and structural biotechnology journal》 2020年18卷 1891-1903页 SCIMEDLINE
【关键词】 ATAC-seq, Assay for Transposase-Accessible Chromatin-sequencing and high-throughput sequencing; AUC, Area Under Curve; Biomarkers;
【外文期刊】 Tomasz,Kolenda ; Kacper,Guglas ; 等 《Reports of practical oncology and radiotherapy : journal of Greatpoland Cancer Center in Poznan and Polish Society of Radiation Oncology》 808-819页
【关键词】 5-FU, 5-fluorouracyl; ACVR2A, activin A receptor type 2A; AKT, AKT serine/threonine kinase;
【外文期刊】 Yonathan,Zehavi ; Adi,Kedmi ; 等 《Transcription》 2015年6卷1期 1-6页 MEDLINE
【关键词】 BREd, downstream TFIIB recognition element; BREu, upstream TFIIB recognition element; ChIP, Chromatin immunoprecipitation;
【外文期刊】 Abdolvahab Ebrahimpour,Gorji ; Zahra,Roudbari ; 等 《Microbial pathogenesis》 2019年137卷 103801页 SCIMEDLINEBP
【关键词】 Gene expression; Gene ontology; Mastitis;
【外文期刊】 Sinaeda,Anderssen ; Aymeric,Naômé ; 等 《Biochimica et biophysica acta. Gene regulatory mechanisms》 2022年1865卷5期 194847页
【关键词】 Autoregulation; Regulon prediction; Transcription control;
【外文期刊】 Tatiana,Subkhankulova ; Fedor,Naumenko ; 等 《Briefings in bioinformatics》 2021年22卷4期 SCIMEDLINEBP
【关键词】 ChIP-seq; ChIP-seq modelling/simulation; binding site/domain;
【外文期刊】 Yong-Zhen,Huang ; Zhao-Yang,Zhan ; 等 《Gene》 2014年534卷2期 356-61页 SCIMEDLINECABP
【外文期刊】 Louis T,Dang ; Markus,Tondl ; 等 《BMC genomics》 2018年19卷1期 238页 SCIMEDLINEBP
【关键词】 Chromatin immunoprecipitation; Motif conservation; Motif discovery;
【外文期刊】 Skyler D,Hebdon ; Alida T,Gerritsen ; 等 《Frontiers in microbiology》 2021年12卷 695517页
【关键词】 Clostridium thermocellum DSM 1313; DNA binding site; bioinformatics;
【外文期刊】 Delfina,Popiel ; Adam,Dawidziuk ; 等 《Journal of applied genetics》 2019年60卷3-4期 405-416页 SCIMEDLINEBP
【关键词】 Fusarium oxysporum; Transcription factor binding site; Tri12;
【外文期刊】 Lin,Jin ; Pran K,Datta ; 《Cell cycle (Georgetown, Tex.)》 2014年13卷24期 3909-20页 SCIMEDLINECABP
【关键词】 CDK2, cyclin-dependent kinase 2; CDK4, cyclin-dependent kinase 4; HDAC1, histone deacetylase 1;
【外文期刊】 Alexander,Kaplun ; Mathias,Krull ; 等 《BMC genomics》 2016年17 Suppl 2卷 393页 SCIMEDLINEBP
【关键词】 Annotation; Promoter; Regulatory variants;
【外文期刊】 Selina,Klees ; Felix,Heinrich ; 等 《Biology》 2021年10卷8期 SCIMEDLINEBP
【关键词】 agricultural animal species; database; gene regulation;
【外文期刊】 Jin-Ik,Kim ; Randal J,Kaufman ; 等 《Molecules and cells》 2019年42卷11期 783-793页 SCIMEDLINECABP
【关键词】 ER stress; GAL4 binding site; activating transcription factor 6;
【外文期刊】 Francesca,Chiovaro ; Ruth,Chiquet-Ehrismann ; 等 《Cell adhesion & migration》 2015年9卷1-2期 34-47页 SCIMEDLINEBP
【关键词】 AKT, v-akt murine thymoma viral oncogene homolog; ALK, anaplastic lymphoma kinase; AP-1, activator protein-1;