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【学位论文】 作者：杨朋硕导师：宁康 华中科技大学 生物学 生物信息技术（博士） 2022年
【摘要】 从微生物组数据中搜集蛋白质家族的同源序列，补充其分子进化信息，进而预测可靠的三维结构与功能，是一个微生物基因挖掘领域中的新兴交叉学科。基于已有研究的结果，理论上搜集越多的微生物组数据能够预测出更多的蛋白家族的结构和功能，展现出巨大的科研与应...
- 概要：
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【学位论文】 作者：梁丽娜导师：王擎 华中科技大学 生物学 生物信息技术（博士） 2022年
【摘要】 KCNMA1 基因编码一种大电导钙离子敏感的钾离子通道(简称 BK 通道),该通道受到细胞膜去极化和细胞内钙离子的双重调节.BK 通道在神经系统和平滑肌细胞表达丰富,参与神经递质释放以及平滑肌收缩和舒张.2005 年首次将KCNAM1基因功...
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【学位论文】 作者：林少峰导师：薛宇 华中科技大学 生物学 生物信息技术（博士） 2022年
【摘要】 蛋白质翻译后修饰（Post-translational modification，PTM）是细胞内生物学过程的最重要调控机制之一，修饰系统的异常与人类疾病高度相关。蛋白质磷酸化（Phosphorylation）和泛素化（Ubiquitina...
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【学位论文】 作者：苗亚茹导师：郭安源 华中科技大学 生物学 生物信息技术（博士） 2022年
【摘要】 免疫系统由各种蛋白质、免疫细胞以及组织组成，主要负责在机体中抵御外来入侵及清除自身有害成分。免疫系统中的免疫细胞分为先天性免疫细胞和获得性免疫细胞，并且有许多具有特定功能的亚群，这些免疫细胞亚群的分布可以为免疫状态、疾病进展、预后以及治疗提...
- 概要：
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【学位论文】 作者：陈思义导师：郭安源 华中科技大学 生物学 生物信息技术（博士） 2022年
【摘要】 T细胞受体（T-cellreceptor,TCR）是T细胞表面的特异性受体，负责识别由主要组织相容性复合体（Majorhistocompatibilitycomplex,MHC）所递呈的抗原。TCR是由α链和β链两条不同肽链构成的异源二聚体...
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【学位论文】 作者：江浦滋导师：陈卫华 华中科技大学 生物学 生物信息技术（博士） 2021年
【摘要】 近些年来，炎症性肠病与结直肠癌等常见的肠道疾病在全球的发病率逐年增加，给社会带来沉重的健康与经济负担。尽早发现疾病并及时干预可以有效降低疾病的治疗难度和死亡率。得益于实验方法与测序技术的进步，许多研究发现，肠道屏障破损（Compromise...
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【学位论文】 作者：钟朝芳导师：宁康 华中科技大学 生物学 生物信息技术（博士） 2021年
【摘要】 微生物是生物地球化学循环中不可缺少的组成部分，在平衡生态系统、调节动植物新陈代谢、预防疾病等方面具有重要功能。测序技术的快速发展积累了大量的微生物全基因组和宏基因组数据，为研究微生物遗传多样性、动态变化、环境适应性等提供了丰富资源，推动了微...
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【学位论文】 作者：韩毛振导师：宁康 华中科技大学 生物学 生物信息技术（博士） 2019年
【摘要】 微生物与人类和环境一起进化，并成为生命的一个重要组成部分，执行着各种重要的功能。如人体微生物和环境微生物分别在维持人体健康和生物地球化学循环中起着至关重要的作用。微生物群落是许多微生物的集合体，其中绝大部分的微生物（超过99%）是不可通过传...
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- 结论：
【学位论文】 作者：许浩东导师：薛宇 华中科技大学 生物学 生物信息技术（博士） 2019年
【摘要】 蛋白质赖氨酸修饰是生物体内非常重要的一类修饰,发生在蛋白质翻译完成后,在蛋白质赖氨酸残基上共价结合不同分子基团或小蛋白质的过程.蛋白质赖氨酸修饰影响蛋白质的结构、活性以及定位,参与多种生物学过程,例如蛋白质降解、细胞分化、基因表达、DNA复...
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- 结论：
【学位论文】 作者：刘腾导师：郭安源 华中科技大学 生物学 生物信息技术（博士） 2019年
【摘要】 细胞外囊泡（extracellular vesicles，EVs）是绝大多数细胞都能分泌的具有膜结构的囊泡，主要包括微泡（microvesicles，MVs）和外泌体（exosomes），广泛分布于人体各种细胞外液，是细胞间通讯的重要媒介。...
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【学位论文】 作者：张颖导师：薛宇 华中科技大学 生物学 生物信息技术（博士） 2019年
【摘要】 细胞自噬是真核生物中高度保守的对细胞内物质进行周转的重要过程，细胞通过动态调控自噬相关蛋白及翻译后修饰来维持各种物质/细胞器在合成、降解和重新利用之间的代谢平衡。细胞自噬作为维持细胞稳态的重要生物过程，受到上游多个生物学过程的调控，例如细胞...
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【学位论文】 作者：刘宇飞导师：周艳红 华中科技大学 生物学 生物信息技术（博士） 2018年
【摘要】 糖作为构成生物体的三类生物大分子之一，对生物体的生命活动有着重要的调控作用。其中，N-聚糖在免疫反应、细胞发育、细胞分化和粘附过程中均有重要作用，特别是由于在多种癌症研究中均已观察到血清N-聚糖结构和含量的显著变化，血清N-聚糖有望成为癌症...
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【学位论文】 作者：刘伟导师：郭安源 华中科技大学 生物学 生物信息技术（博士） 2017年
【摘要】 生命体在不同发育时期和不同组织部位，所表达基因的种类和数量不同，从而导致细胞分化、个体发育及不同组织器官的不同结构和生理功能。转录因子（Transcription factor,TF）是这种在特定的时间和空间条件下，基因选择性表达的重要调控...
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【学位论文】 作者：邓万锟导师：薛宇 华中科技大学 生物学 生物信息技术（博士） 2017年
【摘要】 蛋白质翻译后修饰是指在蛋白质完成翻译之后，在其氨基酸侧链或主链上发生的共价键的断裂或生成的化学反应。目前已经发现的蛋白质翻译后修饰有五百余种，其中，甲基化，乙酰化和磷酸化是研究较为广泛深入的几种翻译后修饰。蛋白质甲基化主要发生在赖氨酸和精氨...
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【学位论文】 作者：杨兆万导师：周艳红 华中科技大学 生物学 生物信息技术（博士） 2017年
【摘要】 近年来，高通量技术的发展和研究能力的增长带来了大规模的生物数据。生物信息学的主要课题之一是从海量数据中挖掘导致疾病的分子机制。本文基于PubMed文献摘要和由微阵列数据生成的基因共表达网络来挖掘疾病与基因的关联性，并应用于癌症和艾滋病这两种...
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【学位论文】 作者：王勇博导师：薛宇 华中科技大学 生物学 生物信息技术（博士） 2017年
【摘要】 蛋白质磷酸化是生物体内最重要的一种翻译后修饰，磷酸化反应是由蛋白激酶将ATP上的磷酸基团转移到底物特定氨基酸上完成的。磷酸化是一种可逆的共价修饰，其逆过程被称为去磷酸化反应，由蛋白质磷酸酶催化完成。蛋白质磷酸化是生物体内重要的调控方式，几乎...
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【学位论文】 作者：张琼导师：郭安源 华中科技大学 生物学 生物信息技术（博士） 2017年
【摘要】 特异表达基因是在特定环境下有着特殊表达模式的基因，它们可以作为特定生命活动和疾病发生发展的重要推动分子或者分子标志物。尽管目前有一些方法检测高通量转录组数据中的特异表达基因，然而还存在较多的不足。本研究中，我们首先开发了用于在高通量RNA-...
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【学位论文】 作者：王攀导师：何光源 杨广笑 华中科技大学 生物学 生物信息技术（博士） 2017年
【摘要】 生物大分子结构的计算机三维（three-dimensional;3D）图形可视化是结构生物信息学的重要研究内容;生物学家通过观察这些3D图形;可发现某些重要的生物学信息。一般而言;对这些大分子3D结构的观察需要特别专注于特定的局部对象;因为...
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【学位论文】 作者：夏恒导师：周艳红 张礼斌 华中科技大学 生物学 生物信息技术（博士） 2016年
【摘要】 金银花作为一种多年生的常绿缠绕藤蔓植物，是一种具有很大经济价值的草药，广泛种植于东亚国家，如中国，日本，和朝鲜。药理学研究显示金银花作为药材有抗菌，抗病毒，抗内毒素，抗炎和解热的作用。因此，金银花经常被用于治疗由于人体疾病引起的呼吸综合征，...
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【学位论文】 作者：李论导师：周艳红 华中科技大学 生物学 生物信息技术（博士） 2015年
【摘要】 绝大多数人类疾病以及农艺性状都属于复杂性状，通常受到大量的遗传因素的控制以及环境因素的控制。阐明复杂性状的遗传机制，对人类复杂疾病的致病机理研究、诊断预防以及新药的研发都有重要的意义，也为动植物品系的改良、产量及品质的提高奠定基础，因此具有...
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【学位论文】 作者：程涵导师：薛宇 华中科技大学 生物学 生物信息技术（博士） 2015年
【摘要】 蛋白质磷酸化是指通过蛋白激酶的催化作用将ATP中的磷酸基团转移到底物蛋白质特定氨基酸残基上的过程。磷酸化具有可逆性，去磷酸化由磷酸酶介导。作为最重要也是目前研究最为广泛的蛋白质翻译后修饰之一，可逆的磷酸化修饰在植物的生长发育过程中起着至关重...
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【学位论文】 作者：李威导师：谢鹭 刘谦 华中科技大学 生物学 生物信息技术（博士） 2015年
【摘要】 临床上肿瘤治疗的预后预测是治疗方案制定的首要问题，预测模型的构建和分子标签是预后预测成功的关键。传统的肿瘤临床分期系统对预后模型构建有指导作用，而分子标签近来在预后预测中也起到越来越重要的作用。目前国际上肝癌分级系统主要由西班牙、意大利、美...
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【学位论文】 作者：张红梅导师：郭安源 华中科技大学 生物学 生物信息技术（博士） 2015年
【摘要】 转录因子(transcription factor,TF)是一类通过结合特定DNA序列而选择性的激活或抑制基因表达的蛋白质,在转录调控过程发挥重要功能,鉴定和注释是其生物学功能研究的基础.TF和miRNA分别作为转录水平和转录后水平的关键调...
- 概要：
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【学位论文】 作者：伍中山导师：徐华强 刘谦 华中科技大学 生物学 生物信息技术（博士） 2015年
【摘要】 独脚金内酯既是内源性的植物激素，同时也作为外源性的信号分子在植物对矿物质营养元素缺乏的环境做出响应的过程中发挥着重要的作用。已有的研究发现，水稻中参与介导独脚金内酯信号通路的蛋白质包括α/β水解酶DWARF14（D14）、泛素连接酶SCFD...
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【学位论文】 作者：明星导师：刘谦 华中科技大学 生物学 生物信息技术（博士） 2014年
【摘要】 使用显微镜观察并采集脑组织的结构图像，重建神经元细胞的形态，以帮助理解和揭示大脑的功能和行为机制，是神经科学研究的重要方法之一。随着实验方法的进步，特别是光学显微镜（Light Microscope，LM）成像技术的发展，获得的神经元形态图...
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【学位论文】 作者：胡星驰导师：刘曼西 周艳红 华中科技大学 生物学 生物信息技术（博士） 2014年
【摘要】 不断进步的测序技术产生了大量RNA数据，然而，RNA不如DNA稳定这一理化特性，给实验研究带来了一定的困难，计算方法分析各类RNA的特征、结构、功能是现在生物信息学最重要的应用之一。miRNA是一类广泛存在于动植物中的内源性单链非编码RNA...
- 概要：
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【学位论文】 作者：姚元根导师：薛宇 华中科技大学 生物学 生物信息技术（博士） 2014年
【摘要】 小的非编码RNA的长度大约为20-30个核苷酸，它在动物的各种发育过程中，例如胚胎发育、神经发育、肌肉发育、生殖发育等起到关键的作用。microRNA(miRNA)和Piwi-interacting RNA(piRNA)是两种重要的小的非编...
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【学位论文】 作者：王松林导师：刘笔锋 张桂森 华中科技大学 生物学 生物信息技术（博士） 2014年
【摘要】 抑郁症是一种严重的、反复发作的、慢性的和潜在可危及生命的病症。第一代抗抑郁药物三环类抗抑郁药和单胺氧化酶抑制剂的发现，使得单胺神经递质成为治疗抑郁症的重要靶点。第二代抗抑郁药物，包括选择性5-羟色胺再摄取抑制剂、去甲肾上腺素再摄取抑制剂、5...
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【学位论文】 作者：施华导师：骆清铭 华中科技大学 生物学 生物信息技术（博士） 2014年
【摘要】 脑是维持机体生命活动的重要中枢。人的大脑有约1000亿个神经元，神经活动所需的能量来自于脑部的供血供氧。这个庞大而复杂的系统的运行机制与脑部的微循环和能量代谢密切相关，受到研究人员的持续关注。随着科学技术的发展，多种研究手段应运而生，从血氧...
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【学位论文】 作者：高天顺导师：薛宇 华中科技大学 生物学 生物信息技术（博士） 2014年
【摘要】 泛素和类泛素偶联是最重要的蛋白质翻译后修饰之一，负责调控各种各样的生物学过程。在真核生物中，泛素化和其它类泛素修饰有相似的酶级联E1（泛素激活酶）-E2（泛素偶联酶）-E3（泛素蛋白连接酶）。泛素和类泛素研究发现了一千多个具有活性的酶，但是...
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【学位论文】 作者：郑露露导师：周艳红 李亦学 华中科技大学 生物学 生物信息技术（博士） 2014年
【摘要】 在病原微生物持续危害公众健康与生命的今天，及时有效的检测将显著提高人类监控应对此类风险的能力。当前，微生物检测仍以PCR技术为基础，因此敏感而又特异的PCR引物，将是检测成功与否的关键。本论文基于公共数据库中广泛存在的核酸序列片段，针对常见...
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【学位论文】 作者：张恒导师：刘笔锋 张桂森 华中科技大学 生物学 生物信息技术（博士） 2014年
【摘要】 对于理想的静脉麻醉药物，安全、快速的苏醒一直是一个非常重要的评价指标。目前临床上使用的麻醉药物都有药物蓄积作用导致的苏醒延迟问题，即使以快速苏醒特性标榜的丙泊酚在长期的输注后也会产生麻醉苏醒的延迟。这种延迟作用必然会增加病人的住院观察时间，...
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【学位论文】 作者：马兆武导师：郭安源 华中科技大学 生物学 生物信息技术（博士） 2013年
【摘要】 本论文主要分为两个部分,第一部分为白血病相关microRNA (miRNA)筛选研究,第二部分为细胞周期蛋白(Cyclin)系统进化分析.第一部分:白血病相关microRNA筛选研究MiRNA是一类长约22个核苷酸的小分子非编码RNA,在转...
- 概要：
- 方法：
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【学位论文】 作者：徐飞导师：刘笔锋 华中科技大学 生物学 生物信息技术（博士） 2013年
【摘要】 后基因组时代,以核酸、蛋白质、代谢物以及它们之间相互作用网络为对象的各种"组学"研究,已经成为发现生命的化学基础和加速人们对其分子机制更加深入了解的主要工具.尤其是最年来,癌症和干细胞等领域的重大突破揭示了群体细胞中某些细胞在功能上表现出的...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【学位论文】 作者：龚静导师：郭安源 华中科技大学 生物学 生物信息技术（博士） 2013年
【摘要】 microRNA(miRNA)是一类广泛存在的长约22个核苷酸左右的小分子非编码RNA。它通过与蛋白编码基因的mRNA3’端非翻译区(3’UTR)碱基互补结合从而抑制mRNA翻译或者介导mRNA降解,在转录后水平调控基因的表达。作为一类重要...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【学位论文】 作者：徐飞导师：刘笔锋 华中科技大学 生物学 生物信息技术（博士） 2013年
【摘要】 后基因组时代，以核酸、蛋白质、代谢物以及它们之间相互作用网络为对象的各种“组学”研究，已经成为发现生命的化学基础和加速人们对其分子机制更加深入了解的主要工具。尤其是最年来，癌症和干细胞等领域的重大突破揭示了群体细胞中某些细胞在功能上表现出的...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【学位论文】 作者：许光导师：周艳红 华中科技大学 生物学 生物信息技术（博士） 2013年
【摘要】 质谱（MS）是一种仪器分析技术，它能够有效地解析聚糖结构并提供定性和定量的信息。糖组学是研究生物体内糖的分子结构及生物功能的科学。随着糖组学的发展，大量的聚糖结构通过解析质谱实验数据而确定。最近生物信息技术的发展提供了一个利用聚糖结构数据库...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【学位论文】 作者：陈寅导师：刘笔锋 张桂森 华中科技大学 生物学 生物信息技术（博士） 2012年
【摘要】 精神分裂症是一种严重的心理疾病,全球有大约1％的人群受到影响。目前精神分裂症的治疗主要以非典型抗精神病药物为主,此类药物能很好控制精神分裂症阳性症状,对阴性症状也有一定疗效,但会产生QT间期延长和体重增加等不良反应。多靶点抗精神分裂症药物能...
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【学位论文】 作者：蔡瑞琨导师：刘曼西 周艳红 华中科技大学 生物学 生物信息技术（博士） 2012年
【摘要】 T细胞抗原表位是T细胞抗原上具有特殊功能的肽段,能够特异性地被T细胞识别,从而激起T细胞免疫应答。因此,研究T细胞抗原表位不仅有助于了解传染性疾病、自身免疫性疾病、过敏反应以及肿瘤等疾病的免疫应答机理,而且对计算机辅助疫苗设计起到推动作用。...
- 概要：
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【学位论文】 作者：孙建导师：刘笔锋 华中科技大学 生物学 生物信息技术（博士） 2011年
【摘要】 钙离子是一种普遍的细胞内信使，其浓度的时空变化及相关的信号转导过程调控基因的表达，从而影响甚至决定细胞的行为。所以，研究单细胞钙信号以及钙信号在细胞间的传递对于揭示众多生理过程的机制、攻克人类疾病意义重大。微流控芯片已成为细胞研究的新型平台...
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【学位论文】 作者：徐波导师：刘笔锋 华中科技大学 生物学 生物信息技术（博士） 2010年
【摘要】
由于生物样品的复杂性，对不同组分的分离是对样品进一步分析的必须前提。
在蛋白质组学研究中尤其如此，迫切需要高效分离技术的鼎力支持。传统的单一分离模式所能获得的分辨率十分有限，因此将相关性低的不同分离模式联用可以获得更高的分辨率...
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- 方法：
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【学位论文】 作者：段谟杰导师：周艳红 华中科技大学 生物学 生物信息技术（博士） 2009年
【摘要】
后基因组时代最主要的研究任务之一就是阐明蛋白质的功能。蛋白质功能可以帮助人们理解复杂的生命现象。但是在许多情况下，不仅要了解蛋白质所发挥的作用，更需要理解为什么蛋白质会具有这种功能，这要求人们深入地研究蛋白质结构。
然而，受到...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【学位论文】 作者：刘融导师：周艳红 华中科技大学 生物学 生物信息技术（博士） 2009年
【摘要】 后基因组时代的主要目标之一是要阐明生物大分子间的相互作用机制。而蛋白质相互作用是所有生命活动发生的基础，是细胞进行一切代谢活动的必要条件。对蛋白质相互作用进行研究不仅有助于揭示生命活动的本质，而且对疾病发生机制的了解及有效药物的开发均起到推...
- 概要：
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【学位论文】 作者：徐友志导师：刘笔锋 华中科技大学 生物学 生物信息技术（博士） 2009年
【摘要】 动力学研究能够揭示分子过程的内在机制，是科学界一直关注的热点问题，先后有12位科学家因此而荣获诺贝尔化学奖。生物分子的功能取决于其活性分子结构的形成，即生物分子的折叠动力学，是当前最活跃的前沿领域之一，例如蛋白质折叠被Science列为21...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【学位论文】 作者：周到导师：周艳红 华中科技大学 生物学 生物信息技术（博士） 2009年
【摘要】 基因调控网络的研究一直是生物学中的研究热点，随着各种生物技术手段的进步，尤其是基因芯片技术的不断进步，近年来积累了大量基因组范围的基因在不同时空下的表达谱数据。这些数据通常描述了生物体中绝大部分基因在特定生命状态或过程中的表达变化情况，可以...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【学位论文】 作者：马闯导师：周艳红 华中科技大学 生物学 生物信息技术（博士） 2009年
【摘要】 确定基因及其功能元件是基因组测序完成之后的首要任务，对于发现疾病相关基因、了解基因的转录调控规律等具有重要意义。目前虽然提出了多种预测方法，但是预测精度依然不能令人满意。本文基于生物信息学的方法对基因及其功能元件的预测展开了一定的研究。主要...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【学位论文】 作者：肖庆导师：何光源 杨广笑 华中科技大学 生物学 生物信息技术（博士） 2008年
【摘要】 硒是人及哺乳动物必需的一种微量元素。硒参与甲状腺激素代谢、抗氧化系统和机体免疫功能的正常发挥。在原核生物、真核生物和古细菌中都发现有硒蛋白的存在，其中哺乳动物硒蛋白现已发现近30种。但是，植物硒蛋白的研究相对滞后，迄今为止仅见于衣藻硒蛋白的...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【学位论文】 作者：袁芳导师：周艳红 华中科技大学 生物学 生物信息技术（博士） 2008年
【摘要】 疾病的发生是遗传因素与环境因素共同作用的结果。发现疾病的致病基因是理解疾病致病原因、协助临床判断及预防诊治的基础,因此寻找疾病基因是后基因时代的重要目标。如何对连锁分析或基因组关联分析所得定位区域中的众多基因进行疾病基因的风险评估是寻找疾病...
- 概要：
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- 结论：
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