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【会议论文】杨锡南 2006年中国科学院智能计算与生物信息学学术研讨会 2006年
【摘要】 本文研究目标是从大规模芯片数据中检测显著性保守的癌症预后标志基因。论文利用了最新的基因芯片表达数据元分析(meta-analysis)手段一一排序的基因列表的相似性打分算法(Similarities of Ordered Gene List...
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【会议论文】项俊平 2006年中国科学院智能计算与生物信息学学术研讨会 2006年
【摘要】 本文我们提出一种全新的蛋白质结构比对方法，它是完全意义上的序列次序无关的结构比对方法，可以发现所谓的“循环排列”和逆序的比对。首先我们给出了蛋白质主链α碳坐标的四面体序列等价表示，证明了这种表示是充分的；对每个四面体提取了六维的不变量向量，...
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【会议论文】黄甲平 2006年中国科学院智能计算与生物信息学学术研讨会 2006年
【摘要】 基因表达调控是后基因组时代研究的一个重点。作为基因转录调控信息的载体，转录调控元件在基因转录过程中起着重要的作用。因此，分析和识别转录调控元件以及了解它们的功能是理解和解释整个基因组行为的重要步骤。本文我们开发了基于位置权重矩阵算法的调控元...
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【会议论文】刘志华 2006年中国科学院智能计算与生物信息学学术研讨会 2006年
【摘要】 戊型肝炎病毒是发展中国家急型肠道传染疾病的主要起因，主要发生在欠发达地区。零星的戊肝发生案例也在发达国家被报道，可能是传染区域输入病源或是本地病源。戊肝的研究和疫苗的研制涉及到戊肝病毒的分型。目前，戊肝病毒的分型已成为一个备受关注的研究课题...
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【会议论文】王秀荷 2006年中国科学院智能计算与生物信息学学术研讨会 2006年
【摘要】 前期对酵母基因上游序列的分析结果显示高效转录基因上游的序列在长度、寡核苷酸使用、以及寡核苷酸在序列中的分布等方面都有着区别于低效转录基因上游序列的特征，而且高效转录基因上游序列中含有较多潜在的转录因子结合位点。观察实验获得的转录调控位点，发...
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【会议论文】徐旭东 2006年中国科学院智能计算与生物信息学学术研讨会 2006年
【摘要】 本文提出了一种基于Web的基因表达数据管理系统的设计方案。本系统采用两套数据库SampleDataBase和GeneInformationDataBase，使用R和Biocondutor提供的方法分析基因表达数据，为用户提供统一的平台，简化...
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【会议论文】左先波 2006年中国科学院智能计算与生物信息学学术研讨会 2006年
【摘要】 基于MATLAB的Bioinformatics Toolbox在互联网平台上读取扬子鳄线粒体全序列并对其碱基组成、密码子偏倚性、开放阅读框及CpG岛进行统计分析；读取包括扬子鳄在内的16种鳄类12s rRNA、16s rRNA、Cytb序列...
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【会议论文】陈春 2006年中国科学院智能计算与生物信息学学术研讨会 2006年
【摘要】 当细胞受压力胁迫时，线粒体外膜通透性增加，同时线粒体膜间促凋亡分子会向胞质中释放，从而激活下游的凋亡事件。Bcl-2家族蛋白直接参与调节线粒体外膜上的凋亡分子释放孔道的形成。我们综合了线粒体外膜渗漏的两种调控机制，用布朗动力学描述Bcl-2...
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【会议论文】王金华 2006年中国科学院智能计算与生物信息学学术研讨会 2006年
【摘要】 多数RNA分子的结构在进化申是高度保守的，其中很多包含伪结。而RNA伪结的预测一直是一个棘手问题，很多RNA二级结构预测算法都不能预测伪结。本文提出一种基于迭代法预测带伪结RNA二级结构的新方法。该方法在给潜在碱基对打分时综合了热力学和协变...
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