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【学位论文】 作者：陈传艺 导师：王长缨 福建农林大学 生物工程 生物信息科学与技术（硕士） 2012年
【摘要】 近年来,新一代测序技术不断涌现和发展.与费用高昂的Sanger测序技术相比,新一代测序技术不仅成本低,而且速度快,为完成更多基因组测序计划提供了可能.然而,新一代测序平台测得的序列片段长度短、数据量大、错误率较高,这给序列拼接带来了严峻的考...
【关键词】 新一代序列拼接 ； de Bruijn图 ；
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【学位论文】 作者：苏小保 导师：刘立芳 西安电子科技大学 计算机科学与技术 计算机软件与理论（硕士） 2012年
【摘要】 随着生物信息学的发展，全基因组序列不断被测序，对于转录的研究变得越来越重要。转录因子，作为一种重要的转录调控元件，它与DNA序列的结合位点——转录因子结合位点的识别已经成为当前的研究热点。准确的预测、识别算法有助于人们识别转录因子的目标基因...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【学位论文】 作者：林敏 导师：宁正元 福建农林大学 生物学 生物学;生物信息科学与技术（硕士） 2011年
【摘要】
新一代测序技术产生的序列片段普遍在35bp~75bp且数据量巨大,原来的序列比对和组装软件不适合这么短的序列,这就给序列比对和序列组装提出了新的挑战。本文主要探讨了新一代测序技术中的短序列比对和短序列组装算法。主要工作如下:
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- 概要：
- 方法：
- 结论：
【学位论文】 作者：孙伟东 导师：马宗民 东北大学 计算机科学与技术 计算机系统结构（博士） 2011年
【摘要】 目前新的高通量DNA测序技术能够在很短的时间内以较低的成本生成大量的序列数据，生物序列的数据量正以爆炸式的速度快速增长。与此同时，计算机处理器的频率已接近理论极限，这意味着现存的串行算法很难像以前一样依靠频率的提高获得性能提升。并行处理技术...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【学位论文】 作者：黄影 导师：霍红卫 西安电子科技大学 计算机科学与技术 计算机软件与理论（硕士） 2009年
【摘要】
生物信息学是在生命科学的研究中，以计算机为工具对生物信息进行储存、检索和分析的科学。如何快速而有效地对生物数据进行处理，从而发现蕴涵于其中的丰富生物知识，是生物信息学研究的重要内容。其中，生物序列的索引技术是目前的一个研究热点。
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- 概要：
- 方法：
- 结论：
【学位论文】 作者：董丽霞 导师：霍红卫 西安电子科技大学 计算机科学与技术 计算机软件与理论（硕士） 2009年
【摘要】 随着基因组被完全测序的物种数量的飞速增长，基因组比对成为新的发展趋势，基于后缀树查找最大唯一匹配的方法是进行基因组比对时普遍采用的方法。虽然其采用的基于后缀树的构造以及查找最大唯一匹配的算法的时间和空间复杂度都是线性的，但是空间花费较大。此...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【学位论文】 作者：陈昌平 导师：刘自伟 西南科技大学 计算机科学与技术 计算机应用技术（硕士） 2009年
【摘要】
随着人类基因组计划的顺利完成，生物信息学成为开启后基因组时代的“金钥匙”，其任务就是读懂人类基因组，这一研究的关键就是了解非编码区的信息结构。因此，分析非编码区信息结构是基因组分析的重要内容，已成为生物信息学研究的前沿课题。
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- 概要：
- 方法：
- 结论：
【学位论文】 作者：王镝 导师：王国仁 东北大学 计算机科学与技术 计算机系统结构（博士） 2006年
【摘要】 生物信息学是20世纪80年代末，随着人类基因组计划的不断发展，基因序列和蛋白质数据的急速增加，以及信息理论和计算机技术的不断发展而逐渐形成的。在过去的十几年中人类对生物信息学，特别是DNA和人类基因序列的研究取得了长足的发展。海量DNA序列...
- 概要：
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