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            【中文期刊】 刘山林  《生物多样性》 2019年27卷5期 526-533页ISTICPKUCSCDCABP

            【摘要】 近年来DNA条形码技术迅速发展,产生的条形码的数量及其应用范围都呈指数性增长,现已广泛用于物种鉴定、食性分析、生物多样性评估等方面.本文重点总结并讨论了构建条形码参考数据库和序列聚类相关的信息分析的技术和方法,包括:基于高通量测序(high...

            【关键词】 DNA条形码可操作物种单元聚类

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            【中文期刊】 余泽晖  梁志伟  等 《微生物学通报》 2019年46卷8期 2053-2068页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 污泥厌氧消化是在消化污泥微生物组的协调下将剩余污泥中有机物转化为甲烷的微生物过程.与传统厌氧消化过程不同,污泥厌氧消化系统的进料底物为含有大量微生物细胞及胞外多聚物等复杂大分子有机物的剩余污泥.因此,厌氧消化污泥微生物组的种群组成、功能及种...

            【关键词】 剩余污泥厌氧消化微生物组

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            【中文期刊】 李昱辉  高瞻  等 《中国输血杂志》 2021年34卷5期 440-446页ISTICCA

            【摘要】 目的 分析中国无偿献血者宏基因组学及微生物组学,评估新发病原体对输血安全的潜在威胁.方法 收集2012~2018年重庆市、广西壮族自治区柳州市、新疆维吾尔自治区乌鲁木齐市、四川省绵阳市、湖北省武汉市、江苏省南京市、黑龙江省牡丹江市以及云南省...

            【关键词】 新发病原体无偿献血人群,中国宏基因组学

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            【中文期刊】 高婧  朱娅  等 《中国输血杂志》 2021年34卷5期 446-451页ISTICCA

            【摘要】 目的 了解凉山州健康无偿献血人群血液微生物组信息,检测血液中可能存在的病原体,并调查其流行情况.方法 随机采集凉山州健康献血人群血液标本1 299(人)份,提取总核酸后进行高通量测序,通过宏基因组学分析,确定微生物组.采用实时荧光定量PCR...

            【关键词】 无偿献血高通宏基因组学

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            【中文期刊】 郝林杰  张育民  等 《中华关节外科杂志(电子版)》 2021年15卷2期 185-191页ISTICCSCDCA

            【摘要】 目的:探讨宏基因二代测序技术在关节置换术后假体周围感染病原菌检测中的应用价值。方法:回顾性分析2018年1月至2019年10月西安市红会医院收治的诊断为关节置换术后假体周围感染患者临床资料,排除2周内应用抗生素患者及由于送检标本质量不合格导...

            【关键词】 关节成形术,置换假体相关感染宏基因

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            【中文期刊】 李沛翰  李鹏  等 《生物技术通报》 2018年34卷3期 43-52页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 新发突发传染病暴发给全球公共卫生防控带来严峻挑战.快速识别致病病原体是应对新发突发传染病的首要问题,传统病原检测方法难以应对已知变异较大病原或未知病原,基于高通量测序的宏基因组学研究给病原识别鉴定带来了新的方法和思路.核酸提取、高通量测序和...

            【关键词】 宏基因组学传染病防控高通

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            【中文期刊】 刘开辉  张波  等 《微生物学报》 2018年58卷10期 1743-1753页ISTICPKUCSCDCABP

            【摘要】 [目的]揭示陕北花马盐湖沉积物原核微生物群落组成,并分析其潜在的耐盐功能基因.[方法]构建盐湖沉积物宏基因组16S rRNA文库和fosmid文库,利用Illumina HiSeq高通量测序及生物信息技术分析细菌古菌群落组成和耐盐菌株(5-...

            【关键词】 盐湖宏基因组文库原核微生物

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            【中文期刊】 王禄禄  王立志  等 《中国微生态学杂志》 2017年29卷2期 223-228页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 微生物在自然界中广泛存在,除土壤和水中的微生物最多外,其次在农业畜牧业中反刍动物的瘤胃微生态系统中的微生物中所占比例最多.反刍动物瘤胃微生物由于种类繁多,数量巨大,微生物区系之间关系非常复杂,它们之间寄生共生,共同影响宿主的生长发育和机体代...

            【关键词】 反刍动物宏基因组学技术高通

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            【中文期刊】 吴楠  杨静慧  等 《微生物学通报》 2016年43卷12期 2720-2729页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 抗生素在医疗和畜禽养殖业的大量使用增加了环境中抗生素抗性微生物(ARB)和抗性基因(ARGs)的丰度与多样性,加速了抗生素耐药性在环境中的传播,给人类公共健康造成潜在威胁.但目前对于环境中耐药性的污染现状缺少足够的信息,相关研究方法亟待优化...

            【关键词】 抗生素抗性基PCR抗性组学

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            【中文期刊】 魏子艳  金德才  等 《微生物学通报》 2015年42卷5期 890-901页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 高通量测序技术的发展促进了组学技术在环境微生物研究中的广泛应用,而宏基因组学是目前最为关键和成熟的组学方法.生物信息学在微生物宏基因组学研究中具有至关重要的作用.它贯穿于宏基因组学的数据收集和存储、数据处理和分析等各个阶段,既是宏基因组学推...

            【关键词】 环境微生物宏基因组学生物信息学

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