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            【中文期刊】 胡爽  陈长波  《计算机应用研究》 2024年41卷12期 3777-3785页

            【摘要】 序列比对是基因组数据分析的关键一环,提高其比对效率对推动测序技术在医学、古生物学等领域的应用具有重要意义.针对BWA算法两大步骤之一的SAMSE存在冗余读取索引导致效率欠佳的问题,提出了新的算法BWA*.其通过运用流程优化消除了 SAMSE...

            【关键词】 序列比对罗伯斯-惠勒变换第二代测序

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            【中文期刊】 董柯清  王雷立  等 《西北植物学报》 2023年43卷1期 21-28页ISTICPKUCSCDCABP

            【摘要】 为探究玉米生物钟基因ZmPRR1-2的功能及表达特性,解析玉米光周期途径调控开花的机理,该研究以玉米骨干自交系'黄早4'为材料,克隆ZmPRR1-2基因的cDNA序列并进行生物信息学分析;利用qRT-PCR技术对该基因进行组织特异性表达分析...

            【关键词】 玉米生物钟ZmPRR1-2

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            【中文期刊】 陈梅莲  曾见芬  等 《现代检验医学杂志》 2023年38卷2期 75-80,159页ISTICCA

            【摘要】 目的 基于液相芯片技术建立一种可同时快速检测6种临床常见血流感染厌氧菌的方法.方法 通过GenBank寻找脆弱拟杆菌、厌氧消化链球菌、具核梭杆菌、中间普雷沃菌、产气荚膜梭菌和痤疮丙酸杆菌的16S rDNA基因序列,经序列比对分析,选择菌内保...

            【关键词】 厌氧菌液相芯片重聚合酶链式反应

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            【中文期刊】 余科  麻智芳  等 《水生生物学报》 2022年46卷7期 939-950页ISTICPKUCSCDCABP

            【摘要】 为探究贵州从江及邻近的榕江、黎平和锦屏以及广西三江、湖南的通道和靖州等地稻田鲤Cyprinus carpio Linnaeus的遗传结构及系统关系,研究基于mtDNA Cyt b基因测序技术对6个地理群体进行了分析.447尾稻田鲤中共界定出...

            【关键词】 Cytb基因遗传结构系统发育关系

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            【中文期刊】 曹萍  马志杰  等 《中国草食动物科学》 2022年42卷4期 18-22页

            【摘要】 为从分子水平上揭示青海省囊谦青牦牛的母系遗传多样性、群体结构及遗传背景,对31头囊谦青牦牛mtDNA D-loop区序列进行PCR扩增、测序和序列比对分析,确定序列变异位点和单倍型数目,计算单倍型多样度和核苷酸多样度大小,并进行系统发育分析...

            【关键词】 囊谦青牦牛mtDNA D-loop区遗传样性

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            【中文期刊】 马玉兰  曹萍  等 《中国牛业科学》 2022年48卷6期 50-54页

            【摘要】 [目的]旨在从分子水平上揭示并探究青海省唐古拉山牦牛群体的母系遗传多样性、群体结构及遗传背景.[方法]对 52 头唐古拉山牦牛个体mtDNA D-loop 区序列进行PCR扩增、测序后,再进行序列比对分析并使用生物信息学软件确定其核苷酸变异...

            【关键词】 唐古拉山牦牛mtDNA D-loop区遗传样性

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            【中文期刊】 张梦圆  张杨  等 《中国动物传染病学报》 2022年30卷3期 173-180页

            【摘要】 为了对驽巴贝虫(Babesia caba1li)HSP70基因进行原核表达获得生物信息学数据.本试验以新疆地方驽巴贝斯虫株截短HSP70基因组DNA为模板进行PCR扩增,序列比对分析,构建重组表达质粒HSP70-pET32a,经过IPTG诱...

            【关键词】 驽巴贝斯虫HSP70基因原核表达

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            【中文期刊】 胡蝶  皮之云  等 《法医学杂志》 2019年35卷4期 444-447页MEDLINEISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 目的 构建18S rDNA克隆文库检测滇池硅藻种群的多样性.方法 用硅藻18S rDNA特异性引物对滇池6个采集点水样的硅藻进行DNA扩增,构建硅藻18S rDNA克隆文库,随机挑取克隆子进行测序,通过BLAST进行序列比对,分析滇池硅藻种...

            【关键词】 法医病理学法医遗传学硅藻

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            【中文期刊】 伊璐  郝振华  等 《遗传学报》 2007年34卷12期 1088-1096页SCIMEDLINEISTICCSCDCABP

            【摘要】 JARID1C是高度保守的ARID蛋白家族的成员,该家族的蛋白参与并引起一系列生物学效应,如染色质重塑、细胞增殖与分裂、个体发育以及基因转录调控.JARID1C在人脑中表达丰富,对脑的发育和维持正常功能具有重要作用,突变可引起智力迟钝.本研...

            【关键词】 JARID1C基因cDNA克隆

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            【中文期刊】 雷初朝  陈宏  等 《遗传学报》 2005年32卷5期 481-486页SCIMEDLINEISTICCSCDCABP

            【摘要】 利用Clustal W软件对我国5个家驴品种26个个体的mtDNA D-loop区399 bp序列进行同源序列比对,共检测到核苷酸多态位点23个,只有转换1种类型,约占所测核苷酸的5.76%.以欧洲驴D-loop作对照,我国5个家驴品种D-...

            【关键词】 家驴线粒体DNAD-loop

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