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【中文期刊】 谢青 房延兵 等 《中国生物制品学杂志》 2021年34卷1期 48-53页ISTICCSCDCABP
【摘要】 目的 筛选甲状腺乳头状癌(papillary thyroid carcinoma,PTC)显著差异表达的microRNA(miRNA),分析其与PTC 发病机制的相关性.方法 选取确诊的PTC 癌组织及癌旁正常组织样本各6 份,提取总RNA...
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【中文期刊】 黄亚辉 匡卫平 等 《国际神经病学神经外科学杂志》 2021年48卷3期 249-255页ISTIC
【摘要】 目的 探究癫痫的转录组学特征,寻找癫痫诊治的潜在靶点.方法 选取雄性幼龄SD大鼠17只,采用抽签法随机将大鼠分为2组:对照组(8只)、CSRS组(9只).基于氯化锂-匹罗卡品构建的慢性自发性癫痫(CSRS)大鼠模型,取CSRS大鼠及对照组大...
- 概要:
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【中文期刊】 王津晗 路倩颖 等 《中华放射医学与防护杂志》 2018年38卷2期 81-86页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 探讨致死剂量的电离辐射对小鼠空肠组织转录组动态变化.方法 小鼠经14 Gy137Cs γ射线腹部照射后,分别于6h,3.5和5d提取各组小鼠空肠总RNA进行转录组测序.表达变化倍数在2倍以上即视为显著差异,对表达差异的基因进行IPA、...
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【中文期刊】 刘玉 成飞 等 《中华肝脏病杂志》 2017年25卷4期 285-290页MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 用二代转录组测序(RNA-seq)技术,结合差异基因GO分析、KEGG富集分析,探讨细胞色素(CY) P450在高脂饮食诱导的小鼠非酒精性脂肪性肝(NAFLD)中的作用. 方法 高脂饲料(D12492,60%脂肪热量)喂养C57BL/...
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【中文期刊】 容丹 王佳平 等 《微生物学通报》 2017年44卷5期 1038-1046页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 [目的]通过低剪切力模拟失重(Low-shear modeled microgravity,LSMMG)连续传代培养大肠杆菌,检测大肠杆菌在模拟失重条件下的表型变化及基因改变.[方法]利用旋转细胞培养系统模拟失重环境对大肠杆菌K12进行连续...
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【中文期刊】 王磊 程飞跃 等 《微生物学报》 2017年57卷2期 220-228页ISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 [目的]通过转录组高通量测序技术(即RNA-seq),结合生物信息学分析和分子生物学方法,在组学水平鉴定极端嗜盐菌中可能的非编码RNA (ncRNA).[方法]将培养至对数中期的地中海富盐菌在不同盐浓度下处理30分钟,提取RNA,进行链特异...
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【中文期刊】 邓飞龙 贾先波 等 《生物工程学报》 2015年31卷9期 1271-1278页MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 转录本组装是基于第二代测序技术研究转录组的关键环节,其质量好坏直接影响到下游结果的可靠性,也是目前的研究热点与难点.转录本组装方法可以分为Genome-guided和de novo两类,它们在理论基础与算法实现方面各有优劣.转录本组装质量的...
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【中文期刊】 刘美兰 谭晓风 等 《植物遗传资源学报》 2014年15卷5期 1053-1059页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 油桐是我国四大木本油料植物之一,当前对油桐的研究主要集中在栽培选优及低产林改造方面,而对油桐脂肪酸延长代谢的分子机理研究尚未见报道.本研究以油桐果实膨大期、油脂转化初期和油脂转化高峰期的种子为材料,采用高通量RNA测序技术对油桐种子脂肪酸延...
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【中文期刊】 肖薪龙 张选 等 《生物工程学报》 2014年30卷11期 1763-1773页MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 RNA-seq技术能够全面快速地获得物种在某一状态下的转录本序列信息,但测序并组装后的大量Unigene往往不包含完整ORF (Open reading frame).转录组库具有一定的冗余性,存在着属于同一个转录本的Unigene,这些U...
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【中文期刊】 王劲松 李春晓 等 《中国综合临床》 2020年36卷3期 217-222页ISTIC
【摘要】 目的:构建长链非编码RNA(long non-coding RNA,LncRNA)表达特征的乳腺癌患者预后的预测模型。方法:分析癌症基因组图谱(the cancer genome atlas,TCGA)数据库1 081例乳腺癌患者的转录组测...
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