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【学位论文】 作者:闻梓导师:李立 华中农业大学 生物学 生物信息学(博士) 2022年
【摘要】 染色质的三维结构与基因调控和细胞功能有紧密的内在联系。基于染色体构象捕获技术(ChromosomeConformationCapture,3C)的实验显示,真核生物的染色体在三维结构上被划分为A/B区室(compartment),且分别与常...
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【学位论文】 作者:YIBELTAL AREGA ASHEBIR导师:李国亮 华中农业大学 生物学 生物信息学(博士) 2021年
【摘要】 很多高通量测序技术均可用于检测全基因组染色质交互,包括了基于配对末端标签的染色质相互作用分析技术(ChIA-PET)。ChIA-PET是一种在全基因组范围内检测特定蛋白介导的高分辨率染色质相互作用的实验方法,可用于在较高分辨率下鉴定基因转录...
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【学位论文】 作者:王栋导师:孔德信 华中农业大学 生物学 生物信息学(博士) 2021年
【摘要】 传统药物研发模式周期长、投入高、成功率低,迫切需要寻求新的技术作为突破口,以此加速新药研发的效率、降低新药发现的成本。而随着人类进入后基因组时代海量数据迅速积累,又得益于计算能力的突破和大数据技术的兴起,以数据为驱动的化学信息学方法使新药研...
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【学位论文】 作者:王晖导师:张红雨 华中农业大学 生物学 生物信息学(博士) 2021年
【摘要】 近年来,伴随着大规模人群的全基因组关联分析(Genome-WideAssociationStudy,GWAS),许多与阿尔茨海默症(Alzheimer’sDisease,AD)相关的微效位点被发现。鉴于GWAS分析仅包含了常见变异,其发现的...
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【学位论文】 作者:王云龙导师:李国亮 方亚平 华中农业大学 生物学 生物信息学(博士) 2021年
【摘要】 影响基因转录与表达的非编码序列调控元件(non-codingregulatoryelements,NCREs),在细胞分化和生命进化的过程中起着极其关键的作用,与基因组空间结构也有着密切关联,它们的变异往往也伴随疾病的产生。因此鉴定NCRE...
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【学位论文】 作者:吕博敏导师:张红雨 华中农业大学 生物学 生物信息学(博士) 2020年
【摘要】 近年来,随着肠道微生物领域研究的深入开展,大量的研究表明肠道微生物与宿主体内的物质代谢和生理机能的维持存在着复杂而紧密的联系。与宿主的其他表型一样,肠道微生物作为动物的“第二基因组”同时受到来自环境因素和宿主遗传因素的共同影响。随着全基因组...
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【学位论文】 作者:洪萍导师:李国亮 华中农业大学 生物学 生物信息学(博士) 2019年
【摘要】 大多数的基因组注释局限于一维线性水平。随着高通量技术的发展,越来越多的研究表明远程调控在基因表达中有重要作用,例如调控元件的远程调控在生物体分化、发育等过程中是必不可少的。想要深入了解基因的表达调控模式,仅从一维结构来研究基因组已不能满足需...
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【学位论文】 作者:李根导师:高军 华中农业大学 生物学 生物信息学(博士) 2019年
【摘要】 转录因子如何在数十亿的碱基中找到并结合特异性位点,是转录调控和生物医学领域研究的热点和难点。研究表明转录因子与特异性序列的结合可以从两个方面理解:一是热力学的角度,即特异性由转录因子结合DNA特定位点的相对结合自由能决定。二是动力学的角度,...
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