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            【学位论文】 作者:鲍振申 导师:刘文斌   温州大学   计算机科学与技术 计算机系统结构(硕士) 2016年

            【摘要】 随着生态环境的恶化以及其它的一些问题,全球范围内癌症的发病率一直持续上升尤其是中国。全球半数癌症病例在亚洲,而亚洲大部分的癌症患者集中在中国。大量的研究表明,许多癌症的发生与信号通路的功能障碍有关。确定癌症相关的信号通路可以帮助研究者研究治...

            【关键词】 癌症信号通路

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            【学位论文】 作者:鲍振申 导师:刘文斌   温州大学   计算机科学与技术 计算机系统结构(硕士) 2016年

            【摘要】 随着生态环境的恶化以及其它的一些问题,全球范围内癌症的发病率一直持续上升尤其是中国.全球半数癌症病例在亚洲,而亚洲大部分的癌症患者集中在中国.大量的研究表明,许多癌症的发生与信号通路的功能障碍有关.确定癌症相关的信号通路可以帮助研究者研究治...

            【关键词】 信号通路分析皮尔森相关系数

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            【学位论文】 作者:于雄香 导师:刘文斌   温州大学   计算机科学与技术 计算机软件与理论(硕士) 2015年

            【摘要】 布尔网络是研究基因调控网络的一种非常重要的模型,通过时序数据推理基因之间的调控关系是研究网络动态行为和干预策略的基础。现有的预测研究主要集中在基因之间的调控关系,而对调控基因与目标基因之间的布尔函数的作用方式研究甚少。
              由于基因调...

            【关键词】 基因调控网络函数泛化

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            【学位论文】 作者:李先彬 导师:刘文斌   温州大学   计算机科学与技术 计算机系统结构(硕士) 2015年

            【摘要】 通路分析是加深生物实验数据理解的通用研究方法。信号通路影响分析方法(SPIA),该方法将注释在通路的经典的富集分析方法和实时的扰动的方法结合到一起。因为以前方法是主要针对单个通路分析的,他们的分辨率不是很高由于差异表达的基因可能集中在通路的...

            【关键词】 最小生成树子通路

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            【学位论文】 作者:于雄香 导师:刘文斌   温州大学   计算机科学与技术 计算机软件与理论(硕士) 2015年

            【摘要】 布尔网络是研究基因调控网络的一种非常重要的模型,通过时序数据推理基因之间的调控关系是研究网络动态行为和干预策略的基础.现有的预测研究主要集中在基因之间的调控关系,而对调控基因与目标基因之间的布尔函数的作用方式研究甚少.由于基因调控网络是一种...

            【关键词】 基因调控网络动态行为

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            【学位论文】 作者:李先彬 导师:刘文斌   温州大学   计算机科学与技术 计算机系统结构(硕士) 2015年

            【摘要】 通路分析是加深生物实验数据理解的通用研究方法.信号通路影响分析方法(SPIA),该方法将注释在通路的经典的富集分析方法和实时的扰动的方法结合到一起.因为以前方法是主要针对单个通路分析的,他们的分辨率不是很高由于差异表达的基因可能集中在通路的...

            【关键词】 差异基因子通路

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            【学位论文】 作者:欧阳宏嘉 导师:刘文斌   温州大学   计算机科学与技术 计算机应用技术(硕士) 2014年

            【摘要】 基因调控网络是整个系统生物学中的基础和核心,通过基因调控网络的重构,人们可以认识生物系统内部的运行机理,揭开生命奥秘的本质。在本文中,我们基于约束性布尔网络模型提出了一种基因调控网络预测的新算法。它通过连续两个状态之间目标基因的变化确定出预...

            【关键词】 基因调控网络动态特性

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            【学位论文】 作者:许鹏 导师:刘文斌   温州大学   计算机科学与技术 计算机应用技术(硕士) 2013年

            【摘要】 复杂生物系统一个重要特性是可以产生具有长程相关性的波动信号.布尔网络是基因调控网络的一种重要模拟仿真模型,已经成功应用于仿真模拟许多真实生物网络系统.在本文中,我们基于布尔网络研究网络的动态行为,结果发现在小噪声环境下,布尔网络系统可以从有...

            【关键词】 布尔网络动态行为

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            【学位论文】 作者:许鹏 导师:刘文斌   温州大学   计算机科学与技术 计算机应用技术(硕士) 2013年

            【摘要】 复杂生物系统一个重要特性是可以产生具有长程相关性的波动信号。布尔网络是基因调控网络的一种重要模拟仿真模型,已经成功应用于仿真模拟许多真实生物网络系统。在本文中,我们基于布尔网络研究网络的动态行为,结果发现在小噪声环境下,布尔网络系统可以从有...

            【关键词】 布尔网络动态行为

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            【学位论文】 作者:昝乡镇 导师:刘文斌   温州大学   计算机科学与技术 计算机应用技术(硕士) 2012年

            【摘要】 生物网络作为一种描述生物分子间相互作用关系的研究模型,在揭示生物体的生长、发育、衰老和疾病等生命系统的基本分子过程和规律中受到越来越多的重视.由于生物系统通常具有保守性,利用网络集中的频繁模式挖掘可以排除生物数据中的各种干扰,挖掘出有生物意...

            【关键词】 复杂生物网络集基因表达

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