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【会议论文】徐旭东 2006年中国科学院智能计算与生物信息学学术研讨会 2006年
【摘要】 本文提出了一种基于Web的基因表达数据管理系统的设计方案。本系统采用两套数据库SampleDataBase和GeneInformationDataBase,使用R和Biocondutor提供的方法分析基因表达数据,为用户提供统一的平台,简化...
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【会议论文】陈春 2006年中国科学院智能计算与生物信息学学术研讨会 2006年
【摘要】 当细胞受压力胁迫时,线粒体外膜通透性增加,同时线粒体膜间促凋亡分子会向胞质中释放,从而激活下游的凋亡事件。Bcl-2家族蛋白直接参与调节线粒体外膜上的凋亡分子释放孔道的形成。我们综合了线粒体外膜渗漏的两种调控机制,用布朗动力学描述Bcl-2...
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【会议论文】马彬广 2006年中国科学院智能计算与生物信息学学术研讨会 2006年
【摘要】 蛋白质折叠是当今分子生物学领域中的核心问题之一。揭示蛋白折叠机理的一个重要方面,就是找出蛋白质折叠速率的决定因素。近年来,该领域的研究取得了很大的进展,提出了许多经验参数,例如、接触序、长程序、总接触距离、二级结构含量、有效长度、组成指标等...
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【会议论文】左先波 2006年中国科学院智能计算与生物信息学学术研讨会 2006年
【摘要】 基于MATLAB的Bioinformatics Toolbox在互联网平台上读取扬子鳄线粒体全序列并对其碱基组成、密码子偏倚性、开放阅读框及CpG岛进行统计分析;读取包括扬子鳄在内的16种鳄类12s rRNA、16s rRNA、Cytb序列...
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【会议论文】刘志华 2006年中国科学院智能计算与生物信息学学术研讨会 2006年
【摘要】 戊型肝炎病毒是发展中国家急型肠道传染疾病的主要起因,主要发生在欠发达地区。零星的戊肝发生案例也在发达国家被报道,可能是传染区域输入病源或是本地病源。戊肝的研究和疫苗的研制涉及到戊肝病毒的分型。目前,戊肝病毒的分型已成为一个备受关注的研究课题...
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【会议论文】王金华 2006年中国科学院智能计算与生物信息学学术研讨会 2006年
【摘要】 多数RNA分子的结构在进化申是高度保守的,其中很多包含伪结。而RNA伪结的预测一直是一个棘手问题,很多RNA二级结构预测算法都不能预测伪结。本文提出一种基于迭代法预测带伪结RNA二级结构的新方法。该方法在给潜在碱基对打分时综合了热力学和协变...
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【会议论文】吴建盛 2006年中国科学院智能计算与生物信息学学术研讨会 2006年
【摘要】 随着对各种生物的基因组序列测序工作的完成,大量的DNA序列数据涌现出来,为研究在基因组中寻找水平转移基因提供了极大的便利。本文中,我们对三种细菌基因组模拟插入一些水平转移基因,通过提取基因密码子使用个数的序列特征,使用支持向量机的方法,预测...
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【会议论文】刘满强 2006年中国科学院智能计算与生物信息学学术研讨会 2006年
【摘要】 本文针对已有的蛋白质二级结构模型存在的不足,提出了一种新的基于数据挖掘技术的递归神经网络的模型ENN,并利用遗传BP算法作为该模型的学习算法。通过相关的实验与结果分析,证明了该模型的有效性。
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【会议论文】徐旭东 2006年中国科学院智能计算与生物信息学学术研讨会 2006年
【摘要】 聚类分析是基因表达数据分析中使用最为广泛的一类方法。本文提出一种基于数据挖掘的模糊关联规则的基因关联模糊聚类算法(GRFCA)对基因表达数据进行聚类分析,并对此算法进行深入的分析研究,最后用实验数据对GRFCA聚类算法和多种传统聚类算法在性...
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【会议论文】程俊 2006年中国科学院智能计算与生物信息学学术研讨会 2006年
【摘要】 合作式协同进化算法是多个子种群通过适应度的关联而进化的新型算法,常常应用于那些多目标、规模大的优化问题。本文在合作式协同进化遗传算法的基础上,提出进一步模拟自然界中的灾变现象,在原先的算法中加入灾变算子,提高算法的性能,尤其是解决了重要的不...
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