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【会议论文】林锦霞 2006年中国科学院智能计算与生物信息学学术研讨会 2006年
【摘要】 克隆测序短小芽孢杆菌木聚糖酶基因,在同源模建所得三维结构的基础上寻找底物结合可能的活性口袋,用计算机模拟其与底物木聚糖的对接,预测酶与催化反应过程的关键氨基酶残基。所得的信息对木聚糖酶的定向改造有重要意义。
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【会议论文】肖强海 2006年中国科学院智能计算与生物信息学学术研讨会 2006年
【摘要】 早期应答基因是一类调控生物体细胞分化,个体发育和应对体内外刺激变化的重要功能基因。它们的表达不依赖于新蛋白的合成,同时受到严格调控,通常处于很低的水平,但却能在特定的生理或病理过程中出现显著的表达变化。这种变化不同于表达水平稳定的看家基因,...
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【会议论文】刘满强 2006年中国科学院智能计算与生物信息学学术研讨会 2006年
【摘要】 本文针对已有的蛋白质二级结构模型存在的不足,提出了一种新的基于数据挖掘技术的递归神经网络的模型ENN,并利用遗传BP算法作为该模型的学习算法。通过相关的实验与结果分析,证明了该模型的有效性。
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【会议论文】刘伟 2006年中国科学院智能计算与生物信息学学术研讨会 2006年
【摘要】 DNA计算是一种以分子生物学为基础的全新算法。较之电子计算具有较高并行性,可为电子计算机在多项式时间内解决不了的NP-完全问题的提供解法。这里主要介绍了DNA计算所研究的,目前取得了较大进展NP完全问题--SAT(可满足性)问题具有代表性的...
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【会议论文】王树林 2006年中国科学院智能计算与生物信息学学术研讨会 2006年
【摘要】 基于基因表达谱的肿瘤分类方法有望成为临床医学上一种快速而有效的肿瘤诊断方法。但由于基因表达谱数据存在维数过高、样本量很小以及基因冗余和噪音大等特点,使得提取与肿瘤有关的信息基因成为一件有挑战性的工作。在总结肿瘤分类研究成果的基础上,首先从总...
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【会议论文】程俊 2006年中国科学院智能计算与生物信息学学术研讨会 2006年
【摘要】 合作式协同进化算法是多个子种群通过适应度的关联而进化的新型算法,常常应用于那些多目标、规模大的优化问题。本文在合作式协同进化遗传算法的基础上,提出进一步模拟自然界中的灾变现象,在原先的算法中加入灾变算子,提高算法的性能,尤其是解决了重要的不...
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【会议论文】熊赟 2006年中国科学院智能计算与生物信息学学术研讨会 2006年
【摘要】 随着生物测序技术的发展,以DNA序列和蛋白质序列为主的生物序列数据呈指数增长,但测序只是探索生命本质的第一步,对这些序列数据的深入研究,解读其中所包含的信息进而理解生命是人们在后基因组时代面临的主要任务,也是生物信息学的核心问题之一。开展这...
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【会议论文】陈晓辉 2006年中国科学院智能计算与生物信息学学术研讨会 2006年
【摘要】 DNA微阵列技术在一次实验中可以产生了全基因组的基因表达数据,如何从这些海量的表达数据中挖掘出我们感兴趣的基因之间相互作用的信息,即反向工程,是目前的研究热点之一。本文将介绍一种整合生物学知识先验的方法,基于现有的贝叶斯网络框架,对DNA微...
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【会议论文】徐旭东 2006年中国科学院智能计算与生物信息学学术研讨会 2006年
【摘要】 聚类分析是基因表达数据分析中使用最为广泛的一类方法。本文提出一种基于数据挖掘的模糊关联规则的基因关联模糊聚类算法(GRFCA)对基因表达数据进行聚类分析,并对此算法进行深入的分析研究,最后用实验数据对GRFCA聚类算法和多种传统聚类算法在性...
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【会议论文】吴建盛 2006年中国科学院智能计算与生物信息学学术研讨会 2006年
【摘要】 随着对各种生物的基因组序列测序工作的完成,大量的DNA序列数据涌现出来,为研究在基因组中寻找水平转移基因提供了极大的便利。本文中,我们对三种细菌基因组模拟插入一些水平转移基因,通过提取基因密码子使用个数的序列特征,使用支持向量机的方法,预测...
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