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【中文期刊】 龚浩 樊永显 《中国生物化学与分子生物学报》 2019年35卷6期 633-647页MEDLINEISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 N4-甲基胞嘧啶(N4-methylcytosine,4mC)是一种重要的袁观遗传修饰,在DNA的修复、表达和复制中发挥重要作用.准确鉴定4mC位点有助于深入研究其生物学功能和机制,由于4mC位点的实验鉴定即耗时又昂贵,特别是考虑到基因序列...
- 概要：
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【中文期刊】 李永贞 樊永显 等 《中国生物化学与分子生物学报》 2018年34卷7期 785-793页MEDLINEISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 假尿苷(ψ)是RNA序列中的一种化学修饰,其在基因转录过程中,由酶的催化作用而形成.它是目前所发现为数最多的一种RNA修饰,并且在正常行使生物学功能方面扮演着重要角色.因此,假尿苷修饰位点的识别是一个非常重要的研究领域.随着RNA序列数据的...
- 概要：
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【学位论文】 作者：樊永显导师：沈红斌 上海交通大学 控制科学与工程 控制理论与控制工程（博士） 2013年
【摘要】 蛋白质是生命的物质基础，没有蛋白质就没有生命。氨基酸是组成蛋白质的基本单位，氨基酸通过脱水缩合连成蛋白质链。蛋白质的氨基酸序列是由对应基因所编码。蛋白质序列通过折叠构成一定的空间结构，从而发挥某一特定功能。蛋白质的某些氨基酸残基可以被翻译后...
- 概要：
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【成果】 2000241567 广西 TP181 应用技术 工程和技术研究与试验发展 公共软件服务 2020年
【成果简介】 在后基因组时代，越来越多的蛋白质分子序列被测定出来，如何确定蛋白质分子的功能位点是最重要的问题之一。传统生物实验的方法费时费力，在这种情况下，计算方法应运而生。该研究从蛋白质分子多源、异构、复杂的特征入手，首先研究了这些特征的相似性度量问题...
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