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【中文期刊】 尹正胜 崔梦琦 等 《淮北师范大学学报（自然科学版）》 2023年44卷2期 63-69页
【摘要】 非编码RNA功能通常与其结构密切相关,准确预测RNA的二级结构有助于揭示RNA的功能.在传统的遗传算法基础上,结合RNA二级结构和假结的特点,提出一种多解并行的遗传算法预测RNA二级结构和假结.首先构建茎区池和初始解集;然后根据RNA二级结...
【中文期刊】 陈翔 卜东波 等 《生物化学与生物物理进展》 2009年36卷1期 115-121页 SCIISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 RNA的二级结构预测是生物信息学中一个已经有30多年历史的经典问题,基于最小自由能模型(MFE)的优化算法是使用最为广泛的方法.但RNA结构中假结的存在使MFE问题理论上成为一个NP-bard问题,即使采用动态规划等优化算法也会面临时间复杂...
【中文期刊】 刘阳 李佳桥 等 《西安电子科技大学学报（自然科学版）》 2018年45卷4期 112-117页
【摘要】 由于基于最小自由能模型的传统算法复杂度高且搜索效率低,故利用量子遗传算法提出了一种新的核糖核酸二级结构的预测算法.该算法将种群信息加载到量子比特上完成初始化,通过量子酉变换(量子逻辑门)实现种群的更新与演化,借助于量子计算的并行性优势使得核...
【中文期刊】 晁江涛 马春森 《生物信息学》 2011年09卷2期 157-163页 ISTIC
【摘要】 RNA二级结构的预测算法研究已有近40年的发展历程,研究假结也将近30年的历史.在此期间,RNA二级结构的预测算法取得了很大进步,但假结预测的正确率依然偏低.其中启发式算法能较好地处理复杂假结,使其成为率先解决假结预测难题可能性最大的算法....
【中文期刊】 石峰 莫忠息 等 《生物数学学报》 2004年19卷2期 233-237页 ISTIC
【摘要】 引入蛋白质二级结构预测的新方法:隐马尔可夫模型.其中将蛋白质的二级结构分成三类:H(指α-螺旋),E(β-折叠)及O(包括转角,卷曲及其他结构).该方法属于统计方法,但考虑了相邻氨基酸之间的相互作用(体现在状态传输概率).通过模型的改进及参...
【中文期刊】 唐媛 李春花 等 《现代生物医学进展》 2013年13卷26期 5180-5182页 ISTICCA
【摘要】 认识蛋白质的二级结构是了解蛋白质的折叠模式和三级结构的基础,并为研究蛋白质的功能以及它们之间的相互作用模式提供结构基础,同时还可以为新药研发提供帮助.故研究蛋白质的二级结构具有重要的意义.随着后基因组时代的到来,越来 越多的蛋白质序列不断被...
【学位论文】 作者： 王林宇 导师：刘元宁 吉林大学 计算机科学与技术 计算机科学与技术(生物信息学)（博士） 2022年
【摘要】 核糖核酸（RiboNucleicAcid,RNA）是生物体中重要的生物大分子，可以通过催化、翻译、基因调控等多种方式参与生命活动和复杂疾病的发生发展。研究表明RNA二级结构影响RNA与其他分子的交互和功能的发挥，同时相同家族的非编码RNA（...
【关键词】 RNA二级结构相关预测； ncRNA家族识别；
【学位论文】 作者： 余政良 导师：张凯 武汉科技大学 其他 网络信息安全（硕士） 2022年
【摘要】 RNA分子是由四种碱基聚合而成的单链核酸分子，不仅是一种重要的遗传物质，还被用于求解复杂组合优化问题。由于碱基互补，单链RNA分子能折叠成不同结构，这些二级和三级结构决定了RNA分子的功能。因此，准确预测RNA结构是生命科学，计算机科学等学...
【关键词】 RNA二级结构预测算法； 进化策略；
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