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【中文期刊】 李亭 刘俊  等 《小型微型计算机系统》 2022年43卷1期 203-209页

【摘要】 预测蛋白质三维结构对了解其生物功能、疾病发病机理研究、药物研发等具有重大意义.为了提高蛋白质结构预测的精度,提出了一种基于距离约束和二面角优化的蛋白质结构预测方法(Distance Constraint and Dihedral Angle...

【关键词】 蛋白质结构预测； 距离约束； 二面角优化；

【中文期刊】 李章维 肖璐倩  等 《计算机科学》 2020年47卷7期 161-165页

【摘要】 蛋白质能量模型的不精确性导致数学上的最优解并不一定对应其稳定的天然态结构,同时其巨大的构象空间使得现有方法也极易收敛到局部最优解.针对蛋白质结构能量模型不精确和高维构象空间采样可靠性低的问题,在进化算法的基础上,提出了一种基于二面角相似度的...

【关键词】 蛋白质结构预测； 多模态优化； 二面角相似度模型；

【学位论文】 作者： 李亭 导师：张贵军  浙江工业大学  控制科学与工程 控制工程（硕士） 2021年

【摘要】 蛋白质在生命过程中扮演着重要的角色，蛋白质的结构决定了其特定的生物功能，了解其结构才能更好的理解生命密码。蛋白质结构对蛋白质功能研究、药物设计、精准医疗等方面有着重要的作用。然而，传统实验方式测定蛋白质三维结构费时、费力、成本高，因此，通过...

【关键词】 蛋白质结构预测； 距离约束；

【中文期刊】 徐为人 刘成卜  等 《中草药》 2004年35卷4期 375-378页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 目的水飞蓟宾RRRR对映体分子中存在多个可变的二面角,可以产生许多立体构象,旨在从理论上寻找其合理构象.方法采用二面角系统搜索后,结合AM1方法确定主要构象,以B3LYP/6-31G*方法优化构型后,在B3LYP/3-21G水平计算了振动频...

【关键词】 水飞蓟宾； 构象搜索； 密度泛函方法；

【学位论文】 作者： 金媚媚 导师：张贵军  浙江工业大学  控制科学与工程 控制理论与控制工程（硕士） 2013年

【摘要】 随着人类基因组计划的完成以及蛋白质工程研究的日益深入，蛋白质分子构象空间确定与功能的研究已成为分子生物学领域中最具有挑战性的问题之一。根据Anfinsen原则，以计算机为工具，运用适当的算法，从氨基酸序列出发，直接预测蛋白质的空间结构，是当...

【关键词】 分子构象优化算法； 蛋白质结构预测；

【中文期刊】 周长会 吴启勋  等 《陕西理工学院学报（自然科学版）》 2013年6期 55-58页

【摘要】 采用密度泛函理论在B3LYP/6-31G（ d）水平上对苯基亚磷酸甲酯分子的几何结构进行优化，计算了该分子的分子轨道能、键长、键角、二面角、慕利肯电荷分布及轨道电子激发态，这些分子量化计算结果可为研究苯基亚磷酸甲酯分子性质提供理论基础。

【关键词】 密度泛函理论( DFT)； 苯基亚磷酸甲酯； 慕利肯电荷；

【中文期刊】 刘鸿雁 李岩  《吉林化工学院学报》 2013年30卷11期 10-12,21页

【摘要】 采用DFT//B3 LYP方法,在6-31G*基组下,对8-羟基喹啉锂(LiQ)及其衍生物基态结构进行优化.在基态几何优化基础上,用含时密度泛函理论(TD-DFT)计算吸收光谱.用CIS/6-31G*方法优化8-羟基喹啉锂单体的S1激发态结...

【关键词】 8-羟基喹啉锂； 密度泛函； 分子轨道；

【中文期刊】 兰子平 覃松  等 《内江师范学院学报》 2010年25卷10期 42-45页

【摘要】 采用密度泛函理论在B3LYP/6-311+G*水平上对该化合物可能的两种异构体进行分子几何结构优化和频率计算.结果 表明,最稳定异构体分子的酰胺基团与噻唑环共平面,苯环与噻二唑环共平面,分子由两个共轭平面组成,其二面角为30°左右.并对其进...

【关键词】 N-(1,3-噻唑-2-基)-1,2,3-苯并噻二唑-7-甲酰胺； 光谱； 热力学性质；