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【中文期刊】 陆翼 葛成 等 《现代计算机》 2023年29卷4期 18-24,48页
【摘要】 从头测序技术是应用于蛋白质组学的测序方法.与其他测序技术相比,从头测序技术的优势是在不依赖数据库搜索和无需PCR扩增的基础上对DNA或者蛋白质进行测序.目前,从头测序技术也广泛应用于蛋白质组学领域.研究人员为了将测序技术所得的短序列read...
【关键词】 从头测序； 序列组装算法； de Bruijn图；
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【中文期刊】 陈平 李水明 等 《中国生物化学与分子生物学报》 2006年22卷7期 591-598页 MEDLINEISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 利用MALDI-TOF质谱结合磺基异硫氰酸苯酯(SPTTC)化学辅助的从头测序(de novo sequencing)方法,将用固相金属离子亲和色谱(immobilized metal affinity chromatography,IMA...
- 概要：
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【中文期刊】 王中胜 朱云平 等 《军事医学科学院院刊》 2006年30卷5期 465-467页 ISTICCSCDCA
【摘要】 从头测序为蛋白质组研究提供了一种不用借助于任何蛋白质序列数据库信息,直接解读串联质谱数据的方法.其基本算法主要由4个部分组成:质谱图的构建,离子类型的确定,测序算法以及打分算法.质谱图的构建和离子类型的确定是从头测序算法的基础.测序算法是从...
- 概要：
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【中文期刊】 刘清萍 刘中华 等 《生命科学研究》 2004年8卷2期 112-116页 ISTICCA
【摘要】 采用纳升喷雾(Nano)技术和碰撞诱导解离(CIDcollisioninducddissociation)方法,在电喷雾四极杆飞行时间质谱(ESI-Q-TOFelectrspectrometryionization-quadrupole-t...
【关键词】 电喷雾四极杆飞行时间质谱； 从头测序； Edman降解；
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【中文期刊】 王勇 高升 等 《质谱学报》 2015年36卷4期 302-309页
【摘要】 研究肽段从头测序需要解决的问题之一是区分亮氨酸和异亮氨酸残基,利用基质辅助激光解吸电离-串联飞行时间质谱(MALDI-TOF/TOF)所产生的w型离子区分这两种氨基酸残基是目前最常用的方法.本研究以6对合成的同分异构肽段(由7～15个氨基酸...
【关键词】 从头测序； 串联飞行时间质谱(MALDI-TOF/TOF)； 亮氨酸；
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【中文期刊】 朱泽轩 张永朋 等 《深圳大学学报（理工版）》 2013年30卷4期 409-415页
【摘要】 针对高通量DNA测序技术发展产生的DNA测序数据量猛增,数据压缩技术是解决存储和传输高通量DNA序列数据问题的重要方法之一.评述DNA测序数据传统压缩方法包括替代法和统计法,以及基于参考基因组的高通量DNA测序数据压缩方法,介绍并比较重测序...
- 概要：
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【中文期刊】 周新文 严钦 等 《高等学校化学学报》 2009年30卷4期 706-711页
【摘要】 利用基质辅助激光解吸电离-串联飞行时间(MALDI-TOF-TOF)质谱结合磺基异硫氰酸苯酯化学辅助的方法对一种从拟青霉(Paecilomyces bainier)分离纯化到的新人参皂苷Rb1水解酶的部分肽段进行了从头测序. 共获得了这个新...
【关键词】 磺基异硫氰酸苯酯； 基质辅助激光解吸电离-串联飞行时间质谱； 新蛋白质；
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【中文期刊】 范春明 王贤纯 等 《质谱学报》 2005年26卷2期 65-70页
【摘要】 虎纹捕鸟蛛毒素-Ⅵ(HWTX-Ⅵ)和敬钊缨毛蛛毒素-Ⅷ(JZTX-Ⅷ)是两种蜘蛛多肽类神经毒素.它们的大部分氨基酸序列已由Edman降解法测出,但仍有部分序列由于某些原因未能确定.为了鉴定未知部分的序列,利用电喷雾电离-四极杆-飞行时间质谱...
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【中文期刊】 孙汉昌 张纪阳 等 《生物化学与生物物理进展》 2010年37卷12期 1278-1288页 SCIISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 近年来,基于质谱技术的高通量蛋白质组学研究发展迅速,利用串联质谱图谱鉴定蛋白质是其数据处理中一个基础而又重要的环节.由于不需要利用蛋白质序列数据库,从头测序方法能够分析新物种或者基因组未测序物种的串联质谱数据,具有数据库搜索方法不可替代的优...
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【中文期刊】 吴靖娜 洪乔茜 等 《食品科学》 2024年45卷2期 188-194页
【摘要】 本实验以红毛藻为原料,利用酶解法及超滤分级制备获得不同分子质量的肽组分,经高效液相色谱法测定体外血管紧张素转化酶(angiotensin-converting enzyme,ACE)抑制活性发现F2组分(800～2 000 Da)的ACE抑...
【关键词】 红毛藻； de novo从头测序； 虚拟筛选；
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