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【中文期刊】 刀福英 陈欣欣 等 《生物信息学》 2017年15卷1期 1-6页ISTIC
【摘要】 嗜热蛋白在高温下能保持稳定性和活性,是研究蛋白质热稳定性的理想模型,开发一个蛋白质热稳定性识别的方法将对蛋白质工程和蛋白质的设计很有帮助.目前的研究中,氨基酸的组成及其物化性质一直被认为和蛋白质的热稳定性相关.本研究筛选出可靠的数据集,包括...
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【中文期刊】 许嘉 《生物信息学》 2013年11卷4期 297-299页ISTIC
【摘要】 抗冻蛋白是一类具有提高生物抗冻能力的蛋白质.抗冻蛋白能够特异性的与冰晶相结合,进而阻止体液内冰核的形成与生长.因此,对抗冻蛋白的生物信息学研究对生物工程发展,提高作物抗冻性有重要的推动作用.本文采用由400条抗冻蛋白序列和400条非抗冻蛋白...
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【中文期刊】 丁辰 邓科君 等 《生物信息学》 2011年09卷3期 238-241页ISTIC
【摘要】 膜蛋白是重要的药物靶位点,对膜蛋白类型的研究有助于药物的成功设计,因此正确预测膜蛋白类型对于药物研发是十分必要的.本文采用由274条分枝杆菌膜蛋白序列组成的一致性小于40%的数据集,以经过优化的伪氨基酸组分为特征,利用支持向量机分类算法预测...
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【中文期刊】 向妍 陈渊 等 《生物化学与生物物理进展》 2016年43卷7期 691-698页SCIISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 糖基化是蛋白质翻译后的主要修饰,O-糖基化的固定模式未知,高精度识别O-糖基化位点是机器学习面临的挑战性问题.以迄今最大的人O-糖基化位点Steentoft数据集为基础,本文首次提出了基于位置的卡方差表特征x2-pos,融合伪氨基酸序列进化...
【关键词】 O-糖基化位点预测；卡方差表特征；伪氨基酸序列进化信息；
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【中文期刊】 袁敏 胡秀珍 《生物物理学报》 2009年25卷5期 349-355页MEDLINEISTICCA
【摘要】 膜蛋白的类型与其功能是密切相关的,因此膜蛋白类型的预测是研究其功能的重要手段,从蛋白质的氨基酸序列出发对膜蛋白的类型进行预测有重要意义.文章基于蛋白质的氨基酸序列,将组合离散增量和伪氨基酸组分信息共同作为预测参数,采用随机森林分类器,对8类...
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【学位论文】 作者：孙鉴 导师：杜朴风 张家琳 天津大学 计算机科学与技术 计算机技术（硕士） 2020年
【摘要】 蛋白质是生命的物质基础，也是构成细胞的重要有机物，它与我们的各种生命活动息息相关，因此研究其功能对于推动生物学、医学等领域的发展十分重要。在本文中我们提出一种基于序列聚类的蛋白质功能预测方法，我们知道蛋白质的伪氨基酸组分不仅包括了蛋白质天然...
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【学位论文】 作者：娄立峰 导师：田保光 青岛科技大学 统计学 统计学（硕士） 2018年
【摘要】 近些年来，由于测序技术的迅速发展，蛋白质序列的数目呈指数型增长，传统的实验方法难以应对海量增长的蛋白质数据，所以迫切需要开发理论计算的方法探究蛋白质结构与功能之间的关系。生物信息学是一门交叉学科，它是在生物学的基础上利用信息科学技术获取生物...
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【学位论文】 作者：张安胜 导师：王爱 安徽大学 计算机科学与技术 计算机应用技术（硕士） 2015年
【摘要】 随着人类基因组计划的完成，生命科学的研究重点逐步的从基因组学转向蛋白质组学，人类进入后基因组时代。蛋白质组学的研究重点是蛋白质的结构与功能，而蛋白质的结构决定了蛋白质的功能，因此，对蛋白质结构的研究成为后基因组时代的重点。另一方面，近年来由...
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【学位论文】 作者：谭生龙 导师：吴松 华中科技大学 计算机科学与技术 计算机应用技术（博士） 2015年
【摘要】 植物通过其抗病基因编码抗病蛋白并触发抗病反应，这一机制是植物抗病的重要途径。其中，编码具有核苷酸结合位点及亮氨酸重复区（Nucleotide binding site and leucine rich repeat，NBS-LRR型抗病基因...
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