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【中文期刊】 陈永乐 平美萱 等 《华西药学杂志》 2021年36卷3期 241-247页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 初步探索新型冠状病毒(SARS-CoV-2)基因组5'非翻译区(5'UTRs)中的内部核糖体进入位点(IRESs),分析其翻译机制.方法 对SARS-CoV-2基因组5'UTR进行序列比对和GC含量分析,用Mfold软件模拟RNA二级...
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【中文期刊】 张涵 王芳 等 《中国中药杂志》 2019年44卷21期 4605-4611页MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 为探究冬虫夏草转录组中简单重复序列(simple sequence repeats,SSR)位点信息,开发冬虫夏草SSR分子标记奠定基础,该研究利用MISA (MicroSatellite)软件对冬虫夏草转录组拼接获得的16 875 uni...
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【中文期刊】 曾薇 刘翼 等 《中华全科医学》 2021年19卷7期 1114-1116,1120页ISTIC
【摘要】 目的 探讨lncRNA DLEU2转录调控因子的结构特征及其与lncRNA DLEU2结合位点.方法 利用生物信息学工具分析lncRNA DLEU2转录调控因子的理化性质、结构、跨膜区、信号肽和亚细胞定位,预测转录因子与lncRNA DLE...
【关键词】 lncRNA DLEU2；转录调控因子；生物信息学分析；
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【中文期刊】 李俊仁 陈秀珍 等 《中国中药杂志》 2018年43卷12期 2503-2508页MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 为了探讨穿心莲转录组中SSR位点信息及其所在基因的生物学功能,并为开发穿心莲分子标记奠定基础,该研究以穿心莲转录组测序获得的43 683条Unigene为对象,采用MicroSAtellite (MISA)软件分析其中的SSR位点信息,并利...
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【中文期刊】 李清 李标 等 《中国中药杂志》 2017年42卷1期 63-69页MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 SSR是应用于金钗石斛鉴定和遗传多样性研究的重要分子标记之一.为开发新的SSR标记,寻求快速鉴别金钗石斛的方法,该文通过生物信息学手段对金钗石斛转录组序列进行SSR位点搜索、分析,并设计出SSR特异性引物.结果显示,从金钗石斛转录组中搜索到...
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【中文期刊】 常越 闫嵩 等 《中国中药杂志》 2016年41卷8期 1430-1434页MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 该实验采用Roche 454 GS FLX测序仪获得黄芪的转录组数据,使用454 Sequencing System Software分析软件进行转录组从头拼接;利用MISA工具筛选了黄芪转录组测序获得的9 893条unigenes,对其S...
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【中文期刊】 穆秀丽 文朝朝 等 《中国生物制品学杂志》 2020年33卷11期 1223-1229页ISTICCSCDCABP
【摘要】 目的 利用生物信息学软件分析淋巴瘤相关蛋白T细胞因子4(T cell factor 4,TCF4)的理化性质、空间结构、蛋白质修饰位点及蛋白相互作用关系.方法 根据美国国家生物技术信息中心(National Center for Biote...
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【中文期刊】 王森 张震 等 《中药材》 2014年37卷9期 1566-1569页MEDLINEISTICPKUCA
【摘要】 目的:分析半夏转录组中的SSR位点信息,并设计SSR引物,为开发新的分子标记奠定基础.方法:利用EST-trimmer和cross-match对转录组测序获得的unigene进行过滤,除去冗杂序列;利用MISA对无冗余unigene进行SS...
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【中文期刊】 马康 刘宇 等 《生物技术》 2015年25卷4期 334-336,396页ISTICCA
【摘要】 [目的]用B交配型位点基因对杏鲍菇不同极性菌株进行快速鉴定.[方法]根据杏鲍菇B交配型位点基因的信息素PEphb(3.3.1～3.3.4)和信息素受体PEPHSTE(3.3.1 ～3.3.4)基因设计8对特异性引物,对原生质体单核化得到的2...
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【中文期刊】 周海舟 韩丽 等 《国际免疫学杂志》 2011年34卷3期 241-244页ISTICCA
【摘要】 目的 分析不同亚型丙型肝炎病毒(HCV)包膜糖蛋白E1和E2的变异性.方法 从HCV基因数据库中获得不同亚型HCV包膜序列,并利用生物信息学方法进行核苷酸序列变异性、包膜糖蛋白亲水性性及糖基化位点分析.结果 与其他亚型相比,1b亚型HCV...
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