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          【中文期刊】 武建亮  苏洋  等 《畜牧兽医学报》 2025年56卷6期 2733-2740页

          【摘要】 旨在探究低密度SNP芯片在猪育种中的应用效果,尤其是在基因型填充和育种值估计准确性方面的表现.本研究在中高密度SNP芯片"中芯一号"的基础上设计了一款密度为5K的低密度SNP芯片,可用于检测种猪遗传标记分型,并填充至质控后的"中芯一号"的面...

          【关键词】 基因组选择密度SNP芯片

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          【中文期刊】 林雨浓  王泽昭  等 《中国农业科学》 2023年56卷8期 1585-1593页

          【摘要】 [目的]尝试通过在华西牛参考群高密度标记芯片位点中,使用两种标记筛选方法挑选具有代表性的且密度梯度不同的SNP位点集合,后利用基因组填充策略在相同填充参数下将低密度芯片数据填充至高密度继而进行后续基因组研究,从而达到降低华西牛基因型分型成本...

          【关键词】 填充准确性密度SNP芯片华西牛

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          【中文期刊】 齐欣  张静静  等 《畜牧兽医学报》 2016年47卷8期 1539-1545页

          【摘要】 旨在探索低密度芯片标记的筛选方法并评估不同低密度芯片的准确性.本研究采用BovineHD高密度芯片,检测西门塔尔牛基因组的SNP位点及其与饱和脂肪酸含量的关联性,根据P值或效应值筛选标记构成低密度芯片,使用IBS聚类分组和随机分组进行交叉验...

          【关键词】 全基因组关联分析基因组选择密度芯片

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          【学位论文】 作者:董献军 导师:陆祖宏   东南大学   生物医学工程 生物医学工程(硕士) 2005年

          【摘要】 随着人类基因组计划的完成,生命科学进入了后基因组时代。科学家开始探究疾病与基因的关系,并把目光投向基因组上特殊的遗传标记位点——SNP。SNP多态性位点的差异有可能造成人们罹患疾病的不同风险和对药物的不同反应。发现这些与常见疾病相关的DNA...

          【关键词】 冠心病生物信息学

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          【中文期刊】 吴俊锋  闫奕源  等 《畜牧兽医学报》 2024年55卷10期 4325-4333页

          【摘要】 旨在分析使用低密度芯片的基因分型数据通过基因型填充获取高密度的基因型数据的准确性.本研究利用10K SNP芯片数据填充至50K,分析填充所得基因型与50K真实基因型的基因型一致性.具体方法如下:使用4 435只健康纯系蛋鸡母系个体为试验群体...

          【关键词】 蛋鸡基因芯片基因型填充

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