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【中文期刊】 马秋双 杨茗涵 等 《中华肺部疾病杂志(电子版)》 2025年18卷2期 261-265页ISTIC
【摘要】 目的分析人源微小RNA-195-5p(human microRNA-195-5p,hsa-miR-195-5p)在非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)患者血清外泌体中的表达及临床意义。方法选择20...
【关键词】 非小细胞肺癌;人源微小RNA-195-5p;生物信息学;
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【中文期刊】 陈安 冯娟 等 《中华肝脏外科手术学电子杂志》 2023年12卷6期 702-707页ISTICCA
【摘要】 目的:基于生物信息学探讨细胞通信网络因子4(CCN4)基因在肝细胞癌(肝癌)中的表达及其临床意义。方法:通过TCGA数据库分析肝癌组织中CCN4蛋白表达及其与临床病理参数的关系,利用肿瘤免疫评估资源(TIMER)数据库分析CCN4蛋白表达与...
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【中文期刊】 李越洲 张孔玺 等 《中华普通外科学文献(电子版)》 2023年17卷6期 426-432页ISTICCA
【摘要】 目的:利用生物信息学方法探索Pumilio(PUM)蛋白作为胃癌潜在生物标志物的可能性。方法:从UCSC Xena官网下载TCGA-STAD队列作为训练集,从GEO数据库下载GSE15459作为验证集。基于训练集中胃癌样本的生存时间和生存状...
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【中文期刊】 李纯璞 张立清 等 《中国矫形外科杂志》 2021年29卷2期 149-153页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 [目的]采用综合生物信息学方法探索RPUSD1在骨肉瘤细胞中的表达及预后意义.[方法]从GEO(gene expres-sion omnibus,GEO)芯片数据库收集骨肉瘤基因芯片原始数据,并下载基因表达谱资料及临床信息资料.采用Wilc...
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【中文期刊】 刘波 付婷婷 等 《第三军医大学学报》 2021年43卷10期 915-922页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 整合生物信息学分析法鉴定出肝内胆管癌(intrahepatic cholangiocarcinoma,ICC)发生发展的关键通路和具有诊断价值的潜在生物学标志物.方法 从美国国立生物技术信息中心基因表达数据库(gene express...
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【中文期刊】 丁相元 严思奇 等 《中华普通外科学文献(电子版)》 2022年16卷1期 20-26页ISTICCA
【摘要】 目的:从公共数据库获取数据,筛选差异表达基因,旨在发现胃癌潜在的靶点基因并揭示其生物学特征。方法:基因表达谱(GSE29272、GSE54129、GSE13911、GSE79973、GSE19826)从GEO数据库获得;差异表达基因通过GE...
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【中文期刊】 杨双燕 任红 等 《中华肝脏病杂志》 2020年28卷9期 773-783页MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的:通过生物信息学方法筛选出参与肝细胞癌(HCC)进展的核心基因(Hub gene),探讨细胞周期蛋白B2(CCNB2)在HCC发生发展及预后中的潜在作用。方法:从GEO数据库中筛选并下载四个HCC相关数据集,用GEO2R分析数据并鉴定差...
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【中文期刊】 陈秋月 王卓智 等 《中国医院药学杂志》 2020年40卷23期 2440-2444页ISTICPKUCA
【摘要】 目的:用生物信息学共表达外推(以下简称生信COXEN)法初步构建食管癌精准化疗药物(5-氟尿嘧啶、紫杉醇和顺铂)生物标志物模型.方法:本研究使用5种统计学方法(Pearson相关分析、Spearman相关分析、Welch's t-test、...
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【中文期刊】 王丽惠 邹春林 《中国肿瘤生物治疗杂志》 2020年27卷11期 1246-1254页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的:基于已发表的芯片数据通过生物信息学方法筛选差异表达基因,以发现前列腺癌诊断/预后和耐药相关分子标志物.方法:筛选GEO数据库中已发表的前列腺癌mRNA芯片数据GSE6956和前列腺癌细胞多烯紫杉醇耐药mRNA芯片数据GSE33455进...
【关键词】 前列腺癌;化疗耐药;诊断/预后分子标志物;
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【中文期刊】 张光君 涂刚 《第二军医大学学报》 2020年41卷12期 1338-1345页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 探讨泛素折叠修饰因子1特异性肽酶结构域蛋白(ZUP1)基因在乳腺癌中的表达情况及上下游机制.方法 使用基因表达汇编(GEO)、癌症基因组图谱(TCGA)和基因型-组织表达(GTEx)数据库,检索收集乳腺癌患者的基因信息和临床病理数据,...
【关键词】 泛素折叠修饰因子1特异性肽酶结构域蛋白;乳腺肿瘤;存活率分析;
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