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【中文期刊】 孟人杰 罗楠 等 《军事医学》 2024年48卷3期 213-218页 ISTICCSCDCA
【摘要】 目的 利用深度学习方法,鉴别基因组相似度很高的大肠杆菌和志贺菌,为临床诊断和疫情防控提供参考依据.方法 提出一种迁移学习大规模预训练蛋白质语言模型的卷积神经网络(CNN),用于细菌类型鉴别,该方法可在属水平上实现对细菌类型的快速准确鉴别.为...
【中文期刊】 崔晟頔 王凯 等 《畜牧兽医学报》 2024年55卷5期 1945-1957页
【摘要】 为了更深入地了解肉质性状的遗传基础,本研究使用基于基因型填充的测序数据进行了GWAS分析并与之前的发表的EWAS结果进行共定位分析.该研究发现了515个全基因组水平显著的SNPs位点和4 134个达建议显著阈值的SNPs位点,这些位点共涉及...
【中文期刊】 张元旭 李竟 等 《畜牧兽医学报》 2024年55卷5期 1827-1841页
【摘要】 遗传评估软件在动物领域的应用极大地提高了育种工作效率.随着基因组测序技术不断完善和人工智能技术的兴起,动物遗传评估软件也得到了快速的发展.本文首先介绍了常规育种和基因组育种在动物育种领域的应用,然后重点回顾了GBLUP方法、贝叶斯方法和机器...
【中文期刊】 王浩臣 蔡雨皓 等 《生态学报》 2023年43卷19期 8011-8024页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 叶际微生物组对植物的生长发育至关重要,但植物与其定殖微生物组相互作用机制尚不明确.目前植物与微生物互作研究多集中于根际微生物组,对叶际微生物组的研究较少,且这些研究未能从微生物互作的角度探究植物与微生物的相互作用机理.基于网络作图理论,将拟...
【中文期刊】 高超群 曹然然 等 《畜牧兽医学报》 2023年54卷2期 554-562页
【摘要】 旨在对中国地方鸡品种的遗传多样性与种群结构进行分析.本研究使用Affymetrix Axiom 600K高密度鸡基因分型芯片对来自8个品种的157只地方鸡及233只商品鸡进行基因分型,以品种作为分组来计算各分组的观测杂合度、期望杂合度、次等...
【中文期刊】 姜晓梦 袁振 等 《福建农林大学学报(自然科学版)》 2023年52卷1期 10-16页
【摘要】 采用生物信息学方法鉴定了巨菌草(Cenchrus fungigraminus Z.X.Lin&D.M.Lin&S.R.Lan sp.nov.)中CAMTA(calmodulin-binding transcription activator...
【中文期刊】 郑周宜 刘雨婷 等 《热带作物学报》 2023年44卷3期 516-525页
【摘要】 为深入了解云南省热带能源植物小桐子的遗传多样性和亲缘关系,本研究以云南省 9 个种源地的小桐子群体为材料展开联合分析.为了研究群体多态性,以MISA程序开发了 8 对SSR分子标记,PCR扩增后选取多态性较好的4 对引物以 9 个居群 95...
【中文期刊】 于永乐 姚延珠 等 《华北农学报》 2023年38卷1期 232-238页
【摘要】 旨在对猪细小病毒1型(PPV1)突变株生物学特性进行分析.对采自山东不同地区养猪场的67份流产胎儿组织样品进行PPV的分离和培养,经电镜观察和IFA试验进行鉴定,通过Overlap PCR对分离株进行全基因序列扩增,SnapGene V4进...
【中文期刊】 黎谢飞 时淄航 等 《中国食品学报》 2023年23卷9期 285-294页
【摘要】 通过益生菌在高温、高盐条件下的转录组分析,揭示菌体细胞在类似环境下的生理反应情况及相关机制.采用三代测序及生物信息学分析方法测定并拼接完成嗜酸乳杆菌CICC 6074的全基因草图.将生长对数期的嗜酸乳杆菌细胞在高温、高盐条件下耐受后,提取总...
【中文期刊】 卞云迪 张驰 等 《天津师范大学学报(自然科学版)》 2022年42卷4期 39-45页
【摘要】 为了探究AP2/ERF基因家族在小麦基因组中的分布及功能,利用生物信息学方法和小麦全基因组数据信息,在小麦全基因组范围内共鉴定出74个TaAP2/ERF转录因子基因.鉴定所得基因编码的蛋白大多数呈酸性,且大部分被定位在细胞核中,与多数转录因...
【关键词】 小麦; 全基因组鉴定; AP2/ERF转录因子家族;