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【中文期刊】 李晶 鞠苇杭 等 《山东大学学报（医学版）》 2025年63卷9期 31-39页ISTICPKUCA
【摘要】 目的 基于单细胞转录组学数据,探究多种癌症组织中不同细胞类型的基因共表达规律.方法 依托大规模公共单细胞转录组学数据,运用CS-CORE方法为 6 种常见的细胞类型在 5 种不同的癌症中分别构建了细胞类型特异性的基因共表达图谱.结果 共获得...
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【中文期刊】 张桢淳 李永唯 等 《中国动脉硬化杂志》 2024年32卷4期 310-318页ISTICCA
【摘要】 [目的]从空间与基因共表达网络的角度揭示跨种属的缺血性心力衰竭机制.[方法]从美国国立生物技术信息中心基因表达数据库(NCBI-GEO)中检索获得GSE210374和GSE57338高通量测序数据,利用R语言软件程序包分析筛选在心肌梗死大鼠...
- 概要：
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【中文期刊】 韦柳萌 黄志广 等 《海南医学》 2024年35卷8期 1065-1070页ISTICCA
【摘要】 目的 探讨膀胱癌组织中SNORA76的表达水平及其潜在分子机制.方法 从基因表达数据库(GEO)、癌症基因组图谱(TCGA)公共数据集以及ArrayExpress网站中,获得6个SNORA76在膀胱癌(BLCA)中的表达数据,进行差异基因表...
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【中文期刊】 刘萌萌 《四川生理科学杂志》 2024年46卷10期 2125-2131页
【摘要】 目的:通过加权基因共表达网络分析筛选结直肠癌(Colorectal cancer,CRC)潜在的生物标志物.方法:下载基因表达综合数据库(Gene expression omnibus,GEO)中的基因表达谱GSE44076 和GSE218...
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【中文期刊】 付婷婷 林逸飞 等 《中国医科大学学报》 2023年52卷6期 487-493页ISTICPKUCABP
【摘要】 目的 通过对癌症基因组图谱(TCGA)数据库中膀胱尿路上皮癌(BLCA)的数据挖掘,探讨Trop-2基因的表达及其临床意义,为Trop-2作为临床治疗靶点提供理论依据.方法 利用GEPIA2、cBioPortal等在线工具分析Trop-2在...
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【中文期刊】 温中庆 张强 等 《华中科技大学学报（医学版）》 2022年51卷2期 158-166页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 通过生物信息学方法鉴定与结直肠癌相关的核心基因,并初步验证.方法 从TCGA数据库中下载正常人和结肠腺癌(COAD)患者的临床资料和基因表达数据;从GEO数据库中下载275例结直肠癌患者的肿瘤组织及其癌旁正常组织基因表达数据.通过差异...
【关键词】 结直肠癌；加权基因共表达网络分析；差异表达基因；
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【中文期刊】 商泽斌 杨天昊 等 《临床医学研究与实践》 2023年8卷34期 1-8,13页
【摘要】 目的 基于加权基因共表达网络分析(WGCNA)和机器学习探索慢性阻塞性肺疾病(COPD)肺泡巨噬细胞(AMs)在疾病进展中的潜在病理机制,识别具有临床价值的潜在生物标志物.方法 COPD数据集来自基因表达汇编(GEO)数据库,使用差异表达基...
【关键词】 慢性阻塞性肺疾病；肺泡巨噬细胞；加权基因共表达网络分析；
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【中文期刊】 王珏 《现代药物与临床》 2024年39卷2期 309-316页ISTICCA
【摘要】 目的 探讨千层纸素A抑制宫颈癌的作用及潜在机制.方法 在GEO和TCGA数据集中分析SHC SH2 结构域结合蛋白 1(SHCBP1)在宫颈癌患者与健康人之间的表达的差异;通过MTT实验验证千层纸素A对HeLa细胞的抑制作用.采用Weste...
【关键词】 千层纸素A；宫颈癌；SHC SH2结构域结合蛋白1；
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【中文期刊】 蔡溦 朱御坤 等 《中国组织工程研究》 2025年29卷18期 3747-3757页ISTICPKUCA
【摘要】 背景:低度慢性炎症被认为在骨关节炎的发病机制中起着核心作用,但是具体的分子机制目前仍不清楚.目的:筛选和探讨骨关节炎中的潜在枢纽基因及免疫细胞的浸润情况.方法:将来自GPL570平台的GSE206848数据集与来自GPL96平台的GSE55...
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【中文期刊】 禹志远 董海平 等 《上海交通大学学报（医学版）》 2025年45卷10期 1308-1319页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的·开发一种多算法协同的计算生物学策略,构建吗啡耐受外周神经调控网络的预测模型,并筛选高置信度候选靶标.方法·构建不同吗啡用药时长的小鼠模型,采集其背根神经节(dorsal root ganglion,DRG)组织开展批量RNA测序,以表...
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