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【中文期刊】 李鑫 慈百全  等 《微生物学杂志》 2025年45卷1期 24-33页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 研究噬菌体裂解酶对细菌生物被膜(Bacterial biofilm,BBF)的作用效果及转录机制.细菌生物被膜的形成是细菌耐药性产生的重要原因之一.金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)是常见的易形成生物被膜的致病微生...

【关键词】 生物被膜； 金黄色葡萄球菌； 噬菌体裂解酶；

【中文期刊】 刘雅妮 杨静欢  等 《中国组织工程研究》 2025年29卷5期 1091-1100页 ISTICPKUCA

【摘要】 背景:纤维肌痛综合征作为常见风湿病,其发病与中枢敏化及免疫异常有关,但具体过程尚未阐明,缺乏特异性诊断标志物,不断探索该病的发病机制具有重要的临床意义.目的:基于加权基因共表达网络分析(WGCNA)等生物信息学方法和机器学习算法筛选纤维肌痛...

【关键词】 纤维肌痛综合征； 生物信息学； 机器学习；

【中文期刊】 李加根 陈跃平  等 《中国组织工程研究》 2025年29卷26期 5595-5607页 ISTICPKUCA

【摘要】 背景:类风湿关节炎发病机制至今尚未完全清晰,近来有研究表明线粒体自噬与类风湿关节炎存在关联性,但关键机制有待深入探究.目的:利用多机器学习算法鉴定和验证类风湿关节炎中线粒体自噬过程的核心互作基因并解析其免疫调控过程.方法:从GEO数据库整理...

【关键词】 线粒体自噬； 类风湿关节炎； 机器学习算法；

【中文期刊】 蔡溦 朱御坤  等 《中国组织工程研究》 2025年29卷18期 3747-3757页 ISTICPKUCA

【摘要】 背景:低度慢性炎症被认为在骨关节炎的发病机制中起着核心作用,但是具体的分子机制目前仍不清楚.目的:筛选和探讨骨关节炎中的潜在枢纽基因及免疫细胞的浸润情况.方法:将来自GPL570平台的GSE206848数据集与来自GPL96平台的GSE55...

【关键词】 骨关节炎； 滑膜组织； 枢纽基因；

【中文期刊】 周未来 李俊  等 《中国免疫学杂志》 2025年41卷2期 287-294页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 目的:利用生物信息学方法寻找与哮喘发病相关的关键基因并讨论其分子机制.方法:对GSE143303芯片数据进行加权基因共表达网络分析(WGCNA),筛选出与哮喘发病显著相关的模块,并对模块基因进行蛋白质相互作用(PPI)网络分析、功能及通路富...

【关键词】 支气管哮喘； 支气管镜管腔内活检； 加权基因共表达网络分析；

【中文期刊】 刘玲杰 林孟宣  等 《临床口腔医学杂志》 2025年41卷2期 95-100页 ISTIC

【摘要】 目的:通过生物信息学分析及实验验证与牙周炎相关的昼夜节律枢纽基因,探究昼夜节律相关基因在牙周炎发生发展中的作用.方法:利用R软件筛选牙周炎的差异表达昼夜节律相关基因并进行富集分析,以寻找关键通路和基因,并通过临床收集牙周炎和健康患者唾液样本...

【关键词】 牙周炎； 昼夜节律； 加权基因共表达网络分析(WGCNA)；

【中文期刊】 杜亚楠 王艺璇  等 《现代肿瘤医学》 2025年33卷4期 557-566页 ISTICCA

【摘要】 目的:为肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)患者开发一种新的免疫原性细胞死亡相关特征(immunogenic cell death related signatures,ICDRS)预后模型.方法:分别从 T...

【关键词】 肝细胞癌； 机器学习； 免疫原性细胞死亡；

【中文期刊】 郭峰 王晨宇  等 《现代泌尿外科杂志》 2025年30卷3期 215-222页 ISTICCA

【摘要】 目的 采用生物信息学分析筛选与肾透明细胞癌(KIRC)发生密切相关的分子生物标志物,并验证其在临床样本中的表达水平.方法 从癌症基因组图谱(TCGA)数据库获取KIRCⅠ期 mRNA测序数据,用主成分分析(PCA)降维处理,筛选差异表达基因...

【关键词】 分子生物学； 生物信息学； 表观遗传学；

【中文期刊】 张伟国 陆秀宏  等 《中国医学物理学杂志》 2025年42卷1期 112-121页 ISTICCSCD

【摘要】 目的:通过整合DNA甲基组数据和转录组数据构建基于增强子的非小细胞肺癌预后风险模型.方法:使用加权基因共表达网络分析(WGCNA)从甲基化差异位点的增强子中识别非小细胞肺癌相关基因.并基于转录组数据通过LASSO-Cox回归算法构建并验证预...

【关键词】 非小细胞肺癌； 增强子； 甲基化；

【中文期刊】 张莉 龚政  等 《临床检验杂志》 2025年43卷2期 136-143页 ISTICCA

【摘要】 目的 利用生物信息学方法筛选狼疮性肾炎(LN)的关键表达基因,寻找诊断LN的潜在生物标志物,探讨LN的发病机制.方法 从高通量基因表达(GEO)数据库下载慢性肾脏病相关的GSE99339数据集,用WGCNA方法筛选与LN相关的核心模块.获取...

【关键词】 高通量基因表达； 狼疮性肾炎； 加权基因共表达网络分析；