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【中文期刊】 包锴 刘珂  等 《生物信息学》 2012年10卷4期 229-233页 ISTIC

【摘要】 已有研究通过计算和实验的手段,证明了不同的microRNA (miRNA)通过相互之间的合作,来共同调控它们所共有的靶基因.对miRNA之间这种合作行为的特性的研究,能够帮助我们更好的理解miRNA的调控机理.本文建立了一个网络来描述miR...

【关键词】 MicroRNA； 共调控网络； 系统；

【中文期刊】 刘伟 李立  等 《生物工程学报》 2017年33卷11期 1791-1801页 MEDLINEISTICPKUCSCDCA

【摘要】 高通量生物监测方法可以同时检测同一样本的上千个参数,其在生物医学中的应用越来越广泛,但如何系统地分析并从高通量数据中挖掘有用信息,仍是一项重要的课题.网络生物学的出现使人们对复杂生物系统有了更深刻的理解,组织/细胞功能执行具有模块化特点.目...

【关键词】 权重基因共表达网络分析； 高通量技术； 疾病；

【学位论文】 作者： 戴宏霜 导师：卢欣 高燕宁  中国医学科学院北京协和医学院  临床医学 肿瘤学（基础）（博士） 2019年

【摘要】 第一章与Ⅰ期肺腺癌术后复发转移相关的microRNA
　　背景:有30～35％的早期肺腺癌患者根治术后死于肿瘤复发和远处转移，筛选预测患者预后或肿瘤转移相关的肿瘤分子标志物，并采取以分子分型为基础的靶向药物治疗，将有可能在一定程度上延...

【关键词】 术后复发； 结直肠癌；

【学位论文】 作者： 徐丽诗 导师：冯雁  上海交通大学  生物学 生物工程（硕士） 2016年

【摘要】 共进化指的是在成对的生物个体或者生物分子之间发生的协同变化，通常用来维持或者优化这些生物体或者生物分子之间的功能相关作用。近年来，SCA算法利用共进化理论挖掘蛋白质家族信息，能筛选出功能相关的共进化氨基酸群落(“sectors”)。为新功能...

【关键词】 α/β水解酶； 共进化网络；

【学位论文】 作者： 吴培 导师：Stefan Grünewald  中国科学院大学  生物学 计算生物学（博士） 2016年

【摘要】 四元组权重描述集合中任意四个元素的数量子结构，作为对比，距离可以认为是集合中任意两个元素的子结构。因此我们认为在进化分析中四元组权重包含更为丰富的信息，利用这一大类方法可以重建更为准确的进化历史。先前的研究中四元组权重方法往往被用于进化树的...

【关键词】 进化网络； 四元组权重；

【学位论文】 作者： 桂娟娟 导师：沈其君 董长征  宁波大学  公共卫生与预防医学 流行病与卫生统计学（硕士） 2016年

【摘要】 目的：
　　对人肠道病毒71型（Enterovirus71,EV71)基因组的分子进化特征进行系统性的研究，构建和分析 EV71的分子共进化网络，掌握 EV71的进化和传播规律，为EV71的监测和手足口病的防控提供支持。
　　方...

【关键词】 手足口病； 人肠道病毒71型；

【学位论文】 作者： 刘米 导师：蒋太交  中国科学院大学  生物学 生物信息学（博士） 2015年

【摘要】 A型流感H1N1每年都会导致季节性的流行，并带来严重的感染和死亡。2009年，由重组的猪源H1N1病毒导致的大暴发传染到世界各地，给人类社会带来了巨大的影响。因此，深入了解流感H1N1的抗原进化对于监控和预防流感十分重要。在论文的第一部分，...

【关键词】 人流感H1N1病毒； 抗原进化；

【学位论文】 作者： 赵东宇 导师：于军  中国科学院大学  生物学 生物信息学（博士） 2013年

【摘要】 随着人类基因组计划的顺利完成，基因组学、转录组学和蛋白质组学等组学研究都进入了快速发展时期。而DNA测序技术的革新和进步，导致了生物信息数据的爆炸式增长。当前生物信息学研究的重要命题，就是如何对这些组学数据进行合理存储、整理、挖掘并高效使用...

【关键词】 共进化网络； 蛋白质相互作用；

【学位论文】 作者： 林强 导师：封少龙 段招军  南华大学  特种医学 劳动卫生与环境卫生学（硕士） 2012年

【摘要】 目的：利用生物信息学方法建立GII.4型诺如病毒的进化模型，探讨1974年至2010年世界范围GII.4诺如病毒的进化机制和动力学规律，找出影响GII.4诺如病毒进化的重要氨基酸位点，为预防和控制诺如病毒胃肠炎的暴发流行提供基础数据。

【关键词】 GII.4诺如病毒； 共发生网络；

【学位论文】 作者： 徐锋 导师：余龙 寿天德  复旦大学  基础医学 遗传学（博士） 2008年

【摘要】 蛋白质磷酸化修饰是细胞内最广泛、最重要的信息调控方式。这个过程能够影响细胞的生长、分化、代谢、分裂、迁移,乃至生物体的肌肉收缩、免疫、学习和记忆。蛋白激酶是最大的、也是最重要的蛋白质家族之一。在真核细胞内,大约有2％的基因编码激酶蛋白,有约...

【关键词】 蛋白激酶； 催化域；