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【中文期刊】 朱镜璇 于正飞 等 《高等学校化学学报》 2019年40卷1期 138-146页
【摘要】 采用分子动力学模拟和拉伸分子动力学模拟方法,结合分子力学-广义玻恩表面积(MM-GB/SA)方法进行自由能计算和结构交互指纹分析,研究了模拟过程中非特异性底物(对氧磷/内酯)分别与嗜热磷酸三酯酶样内酯酶(SsoPox)野生型和突变体(W26...
【关键词】 嗜热类磷酸三酯酶样内酯酶；分子动力学模拟；拉伸分子动力学模拟；
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【中文期刊】 曹了然 张春煜 等 《物理化学学报》 2017年33卷7期 1354-1365页
【摘要】 在当今科学探索中,分子动力学模拟作为实验的辅助,替代甚至引导,有越来越大的重要性.在这篇综述里,我们概括介绍了分子模拟领域的发展历史,特别是专注于近期的进展,包括新的分子力场,增强采样技术以及在研究生物分子体系方面的最新成果.
- 概要：
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【中文期刊】 任家毅 杨志伟 等 《高等学校化学学报》 2017年38卷11期 2070-2076页
【摘要】 以表皮生长因子Ⅲ型突变体(EGFRvⅢ)抗原多肽与其抗体(MR1)及其人源化突变体的复合物结构为出发点,采用分子动力学中的6种常用力场及3种常用溶剂水模型,分别对上述抗原-抗体复合物进行100 ns的分子动力学模拟与分子力学和连续介质模型计...
【关键词】 单链抗体；分子动力学模拟；分子力学和连续介质模型的自由能计算；
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【中文期刊】 光翠娥 张海玲 等 《食品科学》 2017年38卷9期 8-13页
【摘要】 地肤子中的木鳖子皂苷Ic和2’-O-β-D-吡喃葡萄糖木鳖子皂苷Ic有较强抑制肾素体外活性的功能.分子对接证实两皂苷与肾素结合较好,分别形成9个和4个氢键,氨基酸Ser230与Tyr231是氢键作用的关键残基,而Ala229、Met303、...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 冯婷婷 秦宜德 《科技创新导报》 2015年23期 248-249页
【摘要】 分子动力学是一门多学科且交叉学科，是物理、数学、化学、生物和医学的综合技术。随着计算机信息技术的发展和完善，计算机在生物化学，物理，医学各个领域都实现了技术的革新，发展出计算生物学1、计算化学等多门新兴学科，这些新技术和学科的发展革新使得科...
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【中文期刊】 王哲 王普 等 《化工进展》 2013年10期 2475-2479,2485页
【摘要】 脂肪酶是一种重要的生物催化剂，其来源广泛，可在水相甚至非水介质中催化多种反应，并表现出很高的立体选择性和催化活性。有关脂肪酶的应用和基础研究备受重视，特别是脂肪酶催化机理和结构功能关系成为近年来研究热点，基于现代计算机技术的分子模拟计算在相...
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【中文期刊】 范文杰 雷凯 等 《成都电子机械高等专科学校学报》 2012年15卷1期 5-9页
【摘要】 对1,1'-二萘基骨架的3个探针分子,采用Hyperchem和Gaussian 03先后进行分子力学优化、分子动力学模拟、半经验和HF/STO-3G水平几何构型优化.用AutoDock Vina将优化后的探针分子、配体分子α-氨基酸/α-氨...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 李代禧 纪兰兰 等 《计算机与应用化学》 2009年26卷1期 25-28页
【摘要】 首先通过分子力学法,确定辅酶Q10(CoQ10)的7个β-环糊精(β-CD)包合物(CoQ10-7-β-CDs)的最稳定优势构型.并进一步用分子动力学法模拟真空状态,一定时间内包合物的动态结构,并统计分析CoQ10包合前后结构的变化对性质的...
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【中文期刊】 刘艳芝 何丽红 《天水师范学院学报》 2008年28卷2期 62-64页
【摘要】 应用分子模拟技术模拟真实分子体系的结构和性质来寻找目标分子,已大大推动了新材料的研制进程.本文在合成N,N-二羟乙基-3-胺基-2-甲基丙酸甲酯单体的基础上,利用MP软件和GAUSSLAN 98 UHF/3-21G分别进行分子力学优化和几何...
- 概要：
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【中文期刊】 刘有平 纪庆 等 《天津药学》 2006年18卷2期 1-5页
【摘要】 目的:通过采用计算机模拟研究力达霉素发色团被蛋白质保护的作用机理的分析.方法:应用InsightⅡ和HyperChem等软件通过分子力学和分子动力学方法研究发色团和蛋白质之间的相互作用.结果:蛋白质通过静电引力和范德华力以及π电子同发色团相...
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