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【中文期刊】 李秀珍 靳彬艳 等 《农药学学报》 2024年26卷3期 451-461页
【摘要】 为开发结构新颖的高效昆虫生长调节剂,以蜕皮激素受体(EcR)为靶标,以课题组前期发现的高活性化合物I7(N-(4-氰基-1-苯基-1H-吡唑-5-基)-2-苯乙酰胺)为先导,设计合成了20 个1-苯基-5-氨基吡唑类化合物,结构均经核磁共振...
- 概要：
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【中文期刊】 蔡棣 田浤 等 《中国药科大学学报》 2017年48卷2期 227-232页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 建立含有L-对硝基苯丙氨酸(p-nitro-L-phenylalanine,pNO2Phe)蛋白的分子动力学模拟方法,分析了含有pNO2Phe的蛋白具有免疫原性的构效关系,为其他含有非天然氨基酸蛋白的动力学模拟研究提供参考.使用CGenFF...
【关键词】 纳米分子动力学(NAMD)；可视化分子动力学(VMD)；分子动力学模似；
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【中文期刊】 段永斌 殷燕 等 《高等学校化学学报》 2017年38卷9期 1568-1577页
【摘要】 以3个已报道的苯并噻唑类Rho关联含卷曲螺旋蛋白激酶(ROCK)抑制剂(化合物1～3)为研究对象,经分子动力学模拟获得其在ROCK2蛋白结合口袋中的稳定结合构象,通过分子对接结果从氨基酸角度初步揭示了此类抑制剂的结构-活性关系(SAR);然...
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【中文期刊】 梁立 胡建平 等 《生物工程学报》 2016年32卷5期 669-682页MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 Faldaprevir类似物(Faldaprevir analogue molecule,FAM)能有效抑制HCV NS3/4A蛋白酶的催化活性,是一种潜在抗HCV先导化合物.通过生物信息学统计分析了已报道的HCV NS3/4A蛋白酶晶体结...
【关键词】 HCV NS3/4A蛋白酶；Faldaprevir类似物分子；分子动力学模拟；
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【中文期刊】 王绍鹏 任一鑫 《中国当代医药》 2024年31卷9期 21-28页CA
【摘要】 目的 利用网络药理学方法和计算机辅助药物设计策略,分析雷诺嗪对心肌缺血再灌注损伤(MIRI)致心律失常的潜在治疗靶点及机制.方法 采用Swiss Target Prediction数据库和DrugBank数据库预测雷诺嗪潜在的作用靶点.采用...
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【中文期刊】 陈双扣 唐思 等 《化学研究与应用》 2023年35卷7期 1624-1634页
【摘要】 铜绿假单胞菌是引起宿主防御机制受损患者严重感染的重要原因.胞外酶S(exoS)为铜绿假单胞菌III型分泌系统(T3SS)分泌的毒力因子之一,是维持细菌在宿主体内繁殖的重要步骤.因此,本文首先运用虚拟筛选的方法学研究,确定exoS的6GNJ靶...
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【中文期刊】 张天驰 张菁 《生物信息学》 2011年09卷2期 142-145页ISTIC
【摘要】 蛋白质折叠过程模拟是当前蛋白质研究领域的一个难点问题.针对这一问题,提出了一个描述蛋白质折叠过程的算法一拟蛇算法,并且从分子振荡和分子动力学理论两个方面来证明该算法的核心函数是可行和正确的.经过实验总结出所有蛋白质空间结构都可以通过两种类型...
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【中文期刊】 王永伟 蒋南 《科学技术与工程》 2016年16卷25期 30-37页
【摘要】 ZLc-002及其类似物是一系列PDZ结构域抑制剂,它们能够不同程度地阻断nNOS与CAPON之间的偶联,从而表现了不同的抗焦虑活性(PDZ指最早发现含有此结构域的三个蛋白质的首字母缩写,分别是:post synaptic density ...
【关键词】 PDZ结构域抑制剂；神经元型一氧化氮合酶(nNOS)；分子对接；
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【中文期刊】 张海玲 光翠娥 等 《食品与生物技术学报》 2014年33卷10期 1056-1062页
【摘要】 肾素是治疗高血压疾病的重要靶标之一,对肾素抑制剂大豆皂苷Ⅰ及其类似物大豆皂苷Ⅱ、甘草皂苷、单葡萄糖醛酸甘草皂苷元与肾素进行分子对接,采用分子动力学模拟和MM-PBSA相结合的方法计算对接复合物的结合自由能,并且对各部分贡献能以及分子间相互作...
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