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【学位论文】 作者： 蒋晔路 导师：吕强  苏州大学  计算机科学与技术 计算机技术（硕士） 2023年

【摘要】 分子是自然界中物质存在的基本单位，其性质的判定是药物发现的重要环节,快速高效的进行分子性质判定有助于快速确定有效药物分子。本文围绕分子3D构象的拓扑结构对小分子以及大分子的性质开展了建模分析，主要研究内容如下:
　　首先，结合消息传递...

【关键词】 分子性质计算分析； 3D拓扑建模；

【中文期刊】 胡乔 孙璇  等 《当代化工》 2023年52卷1期 231-235页

【摘要】 为了从原子水平上揭示仙鹤草中仙鹤内酯以及仙鹤草内酯-6-O-β-D-吡喃葡萄糖苷等异香豆素类化合物的结构与抗炎活性之间的关系,运用密度泛函理论DFT方法,在B3LYP/6-31G**水平上对仙鹤内酯以及仙鹤草内酯-6-O-β-D-吡喃葡萄糖...

【关键词】 仙鹤草； 异香豆素类化合物； 密度泛函理论(DFT)；

【中文期刊】 石嘉宁 吴俊涛  等 《食品与发酵工业》 2023年49卷20期 221-227页

【摘要】 为了探究酶表面氨基酸残基对催化性能的影响,对麦氏交替单胞菌(Alteromonas macleodii)的木聚糖酶XynZT-2进行分子改造.基于计算机模拟,预测了潜在的有益突变体E49F,通过定点突变构建突变酶基因xynZT-2E49F,...

【关键词】 麦氏交替单胞菌； 木聚糖酶； 定点突变；

【中文期刊】 余德观 陈旭雷  等 《光谱学与光谱分析》 2023年43卷10期 3211-3222页

【摘要】 头孢菌素类品种繁多,应用广泛,结构间存在一定共同特征,但不同结构间的性质差异仍缺乏系统性的比较研究,随着研究技术的不断发展,光谱技术与量子化学计算相结合的方法已成为探究结构性质和观察药物分子电子结构最有效的方法之一.为系统全面地研究非前药型...

【关键词】 非前药； 第三代头孢菌素； 密度泛函理论；

【中文期刊】 翁约约 李震岳  等 《温州医科大学学报》 2022年52卷9期 689-696页 ISTICCA

【摘要】 目的:比较分析铁皮石斛中菲类化合物的结构特征、谱学性质、反应活性和药代动力学性质,为新药开发提供参考.方法:采用密度泛函理论ωB97XD/6-311+G(d,p)方法计算研究铁皮石斛中12种菲类化合物结构与性质,并分析分子表面静电势、全局和...

【关键词】 铁皮石斛； 菲类； 密度泛函理论；

【中文期刊】 郝爱平  《浙江大学学报（医学版）》 2014年43卷4期 453-457页 MEDLINEISTICPKUCSCDCA

【摘要】 目的:对人类pygo1基因编码蛋白质进行结构和功能预测.方法:利用生物信息学方法和工具对PYGO1蛋白质理化性质、跨膜区域、二级结构、亲(疏)水性进行分析.结果:PYGO1蛋白氨基酸残基组成中脯氨酸含量最高,分子式C1943H2937N57...

【关键词】 人； pygo1基因； 生物信息学；

【中文期刊】 冯志远 安晓莉  等 《中国组织工程研究与临床康复》 2010年14卷47期 8843-8846页 ISTICPKUCA

【摘要】 背景:细胞黏附斑在其生物力学方向的研究虽然取得了很多进展,但仍然处于初期阶段,面临着理论模型与实验观察结果出现差异,一些模型缺乏实验依据,进一步优化模型设计等问题.目的:对近年国内外关于细胞黏附斑生物力学研究及其相关进展进行综述.方法:以"...

【关键词】 细胞黏附； 黏附斑； 黏附力；

【中文期刊】 刘有平 宋乃宁  等 《中国临床药理学与治疗学》 2004年9卷8期 868-871页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 目的:研究二氢吡啶类钙拮抗剂的化学结构与药物动力学的关系,为新药设计中早期筛选提供理论方法.方法:采用Insight Ⅱ软件的分子力学和分子动力学程序首先将钙拮抗剂的结构式转化为三维结构,并进行能量优化,使得结构趋于合理.HyperChem...

【关键词】 二氢吡啶类化合物； 钙拮抗剂； 分子力学和分子动力学；

【中文期刊】 刘洪超 胡澍  等 《重庆医学》 2015年44卷17期 2311-2314页 MEDLINEISTICCA

【摘要】 目的 利用生物信息学方法分析果蝇Tap蛋白的结构和功能.方法 基于NCBI数据库中果蝇Tap蛋白的氨基酸序列,从蛋白质理化性质、跨膜区、信号肽、亚细胞定位、结构域、三维结构及物种间同源蛋白进化关系等方面进行分析.结果 Tap蛋白为不稳定亲水...

【关键词】 Tap蛋白； 螺旋-环-螺旋构型； 分子结构；

【中文期刊】 郑春松 叶蕻芝  等 《中医正骨》 2013年25卷1期 11-13,18页 ISTIC

【摘要】 目的:探讨六味地黄丸治疗骨关节炎的多成分-多靶点作用 方法:以六味地黄丸所含的183个化合物和与骨关节炎相关的13个靶点蛋白质为研究对象,利用描述符计算、主成分分析、分子对接等计算机模拟方法,分析六味地黄丸所含化合物的物理化学性质及其作用的...

【关键词】 六味地黄汤； 骨关节炎； 计算机模拟；