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【中文期刊】 王志强 杜慧莹  等 《植物遗传资源学报》 2024年25卷8期 1385-1395页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 以条纹自交系西瓜(TD)和网条突变体西瓜(WT)为材料,通过分离群体的条纹性状比例探索西瓜的条性状遗传基础;以转录组测序及表达差异分析为基础,探索网条突变体西瓜在不同发育阶段的表达谱变化,筛选出条纹自交系与网条突变体西瓜之间表达差异显著的基...

【关键词】 西瓜； 果皮条纹； 转录组；

【中文期刊】 董海丽 王国胜  等 《上海医药》 2024年45卷19期 63-71页 CA

【摘要】 目的:运用生物信息学方法挖掘儿童呼吸道合胞病毒(RSV)的诊断标志物,为RSV的靶向治疗提供依据.方法:从GEO中获得RSV的基因表达数据集.运用差异表达分析、免疫浸润分析、WGCNA和LASSO确定RSV的关键生物标志物.同时,绘制ROC...

【关键词】 呼吸道合胞病毒； 诊断基因； 中性粒细胞；

【中文期刊】 张飞飞 袁红  等 《国际检验医学杂志》 2023年44卷17期 2122-2128页 ISTICCA

【摘要】 目的 筛选骨髓增生异常综合征(MDS)患者的疾病特征基因并分析其与免疫细胞浸润的关系.方法 从高通量基因表达数据库(GEO)中下载MDS患者及健康人的基因表达谱数据.应用生物信息学的方法对表达谱数据进行差异基因、加权基因共表达网络(WGCN...

【关键词】 骨髓增生异常综合征； 加权基因共表达网络分析； 核心基因；

【中文期刊】 宋自崇 张黎军  《微循环学杂志》 2023年33卷1期 65-70,75页 ISTIC

【摘要】 目的:通过生物信息学和机器学习筛选扩张型心肌病(DCM)核心基因.方法:从基因表达数据库中获取GSE42955和GSE84796芯片数据集.先用R软件"limma"包初筛差异表达基因(DEGs),然后通过构建加权基因共表达网络(WGCNA)...

【关键词】 扩张型心肌病； 加权基因共表达网络分析； 机器学习；

【中文期刊】 景晓莹 彭亮  等 《宁夏医科大学学报》 2023年45卷3期 258-267,289页 ISTIC

【摘要】 目的 基于癌症基因组图谱(the cancer genome atlas,TCGA)和基因型-组织表达(genotype-tissue ex-pression,GTEx)数据库,通过差异表达和加权基因共表达网络(weighted gene ...

【关键词】 胰腺导管腺癌； 癌症基因组图谱数据库； 基因型-组织表达数据库；

【中文期刊】 储金林 马睿瑶  等 《山东医药》 2022年62卷26期 1-5页 ISTICCA

【摘要】 目的 筛选糖尿病肾病(DKD)患者血浆细胞游离DNA(cfDNA)中5-羟甲基胞嘧啶(5hmC)修饰的关键ln?cRNA,并构建其ceRNA调控网络.方法 收集14例糖尿病患者和17例DKD患者的血浆样本,利用5hmC-Seal技术对cfD...

【关键词】 糖尿病肾病； 5-羟甲基胞嘧啶； 长链非编码RNA；

【中文期刊】 刘雅妮 杨静欢  等 《中国组织工程研究》 2025年29卷5期 1091-1100页 ISTICPKUCA

【摘要】 背景:纤维肌痛综合征作为常见风湿病,其发病与中枢敏化及免疫异常有关,但具体过程尚未阐明,缺乏特异性诊断标志物,不断探索该病的发病机制具有重要的临床意义.目的:基于加权基因共表达网络分析(WGCNA)等生物信息学方法和机器学习算法筛选纤维肌痛...

【关键词】 纤维肌痛综合征； 生物信息学； 机器学习；

【中文期刊】 蔡溦 朱御坤  等 《中国组织工程研究》 2025年29卷18期 3747-3757页 ISTICPKUCA

【摘要】 背景:低度慢性炎症被认为在骨关节炎的发病机制中起着核心作用,但是具体的分子机制目前仍不清楚.目的:筛选和探讨骨关节炎中的潜在枢纽基因及免疫细胞的浸润情况.方法:将来自GPL570平台的GSE206848数据集与来自GPL96平台的GSE55...

【关键词】 骨关节炎； 滑膜组织； 枢纽基因；

【中文期刊】 武英楷 史高龙  等 《中国组织工程研究》 2025年29卷2期 294-301页 ISTICPKUCA

【摘要】 背景:类风湿关节炎是一种全身的免疫相关性疾病,主要病理特点是关节滑膜炎性增生及关节软骨的破坏,其发病机制目前尚不明确,迫切需要发现新的具有高度敏感性和特异性的诊断标志物.目的:联合使用生物信息学技术及计算机学习算法,识别并筛选类风湿关节炎患...

【关键词】 加权基因共表达网络； 机器学习算法； 类风湿关节炎；

【中文期刊】 白雪 王启彤  等 《医学理论与实践》 2025年38卷1期 1-7,13页

【摘要】 目的:ATP结合盒(ABC)转运蛋白基因家族影响动脉粥样硬化疾病的发展,通过基因表达综合数据库(GEO)数据挖掘,研究ABC转运蛋白基因家族中与动脉粥样硬化(AS)诊断相关的基因,以探索潜在的AS标志物.方法:共纳入4个备选数据集(GSE4...

【关键词】 动脉粥样硬化； ABCB1； 基因集富集分析；