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【中文期刊】 章广能 张育芳 等 《生物信息学》 2024年22卷4期 287-295页 ISTIC
【摘要】 化合物-蛋白质互作的鉴定对药物发现、靶标鉴定,网络药理学和蛋白质功能的阐明等至关重要.本文开发了一种基于表示学习的图神经网络预测化合物-蛋白质互作模型.首先利用Word2vec表示学习方法自动提取化合物和蛋白质的特征;然后将特征输入构建图神...
【关键词】 化合物-蛋白质相互作用； 表示学习； 图神经网络；
【中文期刊】 荣丹琪 王倩 等 《中国药科大学学报》 2023年54卷3期 305-313页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 药物研发过程中,化合物-蛋白质相互作用(compound-protein interaction,CPI)预测是发现苗头化合物、药物重定位等研究的关键技术手段.近年来,深度学习被广泛应用于CPI研究,加速了药物发现中CPI预测的发展.本文重...
【关键词】 深度学习； 化合物-蛋白质相互作用； 药物重定位；
【中文期刊】 刘宏生 于笑雪 等 《辽宁大学学报（自然科学版）》 2023年50卷2期 126-133页
【摘要】 化合物-蛋白质相互作用(Compound-protein interaction,CPI)预测是药物研发领域的一个重大课题.随着生物科学的飞速发展,各种科学实验产生了大量的生物数据,通过计算方法能够快速有效地提取和利用这些信息.已有方法未能...
【中文期刊】 彭丹妮 黄静 等 《生命科学》 2007年19卷4期 461-464页 ISTICCSCD
【摘要】 酵母双杂交系统自出现以来,广泛用于研究蛋白质之间的相互作用,它是一种具有高灵敏度的研究蛋白质之间关系的技术.在酵母双杂交系统基础上发展的酵母三杂交系统将应用范围扩展到蛋白质-蛋白质、蛋白质-RNA、蛋白质-小分子化合物等更广阔的研究领域.本...
【关键词】 酵母三杂交系统； 蛋白质-蛋白质相互作用； 蛋白质-RNA相互作用；
【学位论文】 作者： 王景虎 导师：郑光 兰州大学 计算机科学与技术 计算机科学与技术;计算机应用技术（硕士） 2020年
【摘要】 药物靶标的识别在药物发现和生物制药领域起着重要作用，其核心就是化合物-蛋白质相互作用关系的识别。传统的基于实验验证的药物研发模式，已经积累了大量的化合物-蛋白质相互作用关系的基础数据，然而，该模式存在流程复杂、识别不全、周期长、费用高昂以及...
【中文期刊】 邓雅文 曾瑞峰 等 《基因组学与应用生物学》 2024年43卷8期 1469-1482页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 本研究旨在通过生物信息学方法筛选鉴定益气活血散干预脓毒症中的关键基因及预测核心通路.首先检索本草组鉴HERB平台获取益气活血散的成分和靶点,并通过多个疾病数据库检索筛选得到脓毒症的潜在靶点.通过STRING数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用(...
【中文期刊】 方馨悦 石岚 等 《上海交通大学学报（医学版）》 2024年44卷10期 1287-1298页 ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 混合谱系白血病(mixed lineage leukemia,MLL)基因重排(MLL-rearranged,MLL-r)引起的急性白血病亚型侵袭性高且预后不良,缺少特异性治疗手段.MLL蛋白具有组蛋白甲基转移酶活性,在胚胎发育和正常造血中...
【关键词】 MLL基因重排白血病； Menin； 靶向治疗；
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