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【中文期刊】 章广能 张育芳 等 《生物信息学》 2024年22卷4期 287-295页ISTIC
【摘要】 化合物-蛋白质互作的鉴定对药物发现、靶标鉴定,网络药理学和蛋白质功能的阐明等至关重要.本文开发了一种基于表示学习的图神经网络预测化合物-蛋白质互作模型.首先利用Word2vec表示学习方法自动提取化合物和蛋白质的特征;然后将特征输入构建图神...
【关键词】 化合物-蛋白质相互作用；表示学习；图神经网络；
- 概要：
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【中文期刊】 荣丹琪 王倩 等 《中国药科大学学报》 2023年54卷3期 305-313页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 药物研发过程中,化合物-蛋白质相互作用(compound-protein interaction,CPI)预测是发现苗头化合物、药物重定位等研究的关键技术手段.近年来,深度学习被广泛应用于CPI研究,加速了药物发现中CPI预测的发展.本文重...
【关键词】 深度学习；化合物-蛋白质相互作用；药物重定位；
- 概要：
- 方法：
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【中文期刊】 刘宏生 于笑雪 等 《辽宁大学学报（自然科学版）》 2023年50卷2期 126-133页
【摘要】 化合物-蛋白质相互作用(Compound-protein interaction,CPI)预测是药物研发领域的一个重大课题.随着生物科学的飞速发展,各种科学实验产生了大量的生物数据,通过计算方法能够快速有效地提取和利用这些信息.已有方法未能...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 彭丹妮 黄静 等 《生命科学》 2007年19卷4期 461-464页ISTICCSCD
【摘要】 酵母双杂交系统自出现以来,广泛用于研究蛋白质之间的相互作用,它是一种具有高灵敏度的研究蛋白质之间关系的技术.在酵母双杂交系统基础上发展的酵母三杂交系统将应用范围扩展到蛋白质-蛋白质、蛋白质-RNA、蛋白质-小分子化合物等更广阔的研究领域.本...
【关键词】 酵母三杂交系统；蛋白质-蛋白质相互作用；蛋白质-RNA相互作用；
- 概要：
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【学位论文】 作者：张勐 导师：朱真峰 郑州大学 计算机科学与技术 计算机技术（硕士） 2023年
【摘要】 确定化合物与蛋白质之间的相互作用是药物研发中的重要一环。基于先验知识的传统方法存在消耗时间长、投入成本高等问题。为了解决这些问题，许多研究人员采用深度学习算法，通过分析化合物与蛋白质数据的特征，挖掘两者之间的相互关系。基于深度学习的预测方法...
【关键词】 多通道自注意力融合 ； 化合物-蛋白质相互作用 ；
- 概要：
- 方法：
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【学位论文】 作者：万晓喆 导师：蒋华良 郑明月 中国科学院大学 药学 药物设计学（博士） 2022年
【摘要】 近年来，深度学习在药物研发中的应用得到飞速发展，极大缩短了研发的时间。但是传统的深度学习算法集中定义在欧氏结构数据上，而药物研发相关的生物大数据往往具有复杂高维的非欧氏结构，比如表征分子形状的三维结构、表征生物数据间相互关联的关系图等。为了...
【关键词】 图神经网络 ； 化合物-蛋白质相互作用 ；
- 概要：
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- 结论：
【学位论文】 作者：王景虎 导师：郑光 兰州大学 计算机科学与技术 计算机科学与技术;计算机应用技术（硕士） 2020年
【摘要】 药物靶标的识别在药物发现和生物制药领域起着重要作用，其核心就是化合物-蛋白质相互作用关系的识别。传统的基于实验验证的药物研发模式，已经积累了大量的化合物-蛋白质相互作用关系的基础数据，然而，该模式存在流程复杂、识别不全、周期长、费用高昂以及...
- 概要：
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【学位论文】 作者：王志斌 导师：郑光 兰州大学 软件工程 软件工程（硕士） 2018年
【摘要】 识别化合物-蛋白质相互作用在药物发现和药物设计中起到至关重要的作用，它为理解药物的药效、靶向以及不良副作用提供了有价值的参考。传统的方法主要是通过实验来验证化合物和蛋白质之间的相互作用关系，这种方法费时、费力，且不可能对所有的化合物、蛋白质...
【关键词】 深度学习 ； 化合物-蛋白质相互作用 ；
- 概要：
- 方法：
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【中文期刊】 王茜 丁一柠 《中国医药科学》 2025年15卷13期 61-65,70页
【摘要】 目的 基于网络药理学和分子对接研究黄芩中黄酮类化合物治疗炎症性肠病(IBD)的作用机制.方法 通过中药系统药理学数据库筛选黄芩中的黄酮类成分,联合ChEMBL等预测成分靶点,通过GeneCards等获取IBD靶点.使用Cytoscape等构...
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