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            【中文期刊】 傅东升  艾克热木江·木合热木  《中国组织工程研究》 2025年29卷20期 4379-4388页ISTICPKUCA

            【摘要】 背景:多指畸形患者中参与Heghog信号通路的一些转录因子发生异常表达,这些转录因子调控大量靶基因的表达,从而影响细胞的功能.目的:通过单细胞转录组分析多指畸形患者的转录组特征.方法:从GEO公共数据库中下载4例多指畸形患者细胞间质和上皮细...

            【关键词】 指畸形转录因子生物信息学

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            【中文期刊】 杨品  任振华  等 《基因组学与应用生物学》 2024年43卷7期 1196-1213页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 多模态组学数据的联合运用在揭示细胞异质性和解析细胞命运调控机制方面具有重要意义,目前已有多种方法被开发,用于处理不同组学模态数据的整合.本研究通过对应用于不同整合任务的多种数据整合方法进行性能评测,为相关领域的研究提供有益参考.使用6个联合...

            【关键词】 单细胞空间转录模态

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            【中文期刊】 徐琪  禹雷  等 《海南医学》 2024年35卷11期 1533-1544页ISTICCA

            【摘要】 目的 探讨结直肠癌恶性转变过程中的分子特征及其调控网络扰动,深入剖析结直肠癌恶性转变的微环境异质性并识别潜在治疗靶点.方法 首先从Gene Expression Omnibus(GEO)数据库中收集单细胞转录组测序数据,从欧洲分子生物学实验...

            【关键词】 结直肠癌单细胞数据转录调控网络

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            【中文期刊】 蔡浩洋  《四川师范大学学报(自然科学版)》 2022年45卷4期 452-461页

            【摘要】 随着测序技术的发展,目前单细胞测序已经成为生命科学各研究方向的前沿技术.单细胞测序技术是指在单个细胞的水平上对其携带的遗传信息进行高通量测序分析的技术.在2011年和2013年,单细胞测序技术分别被《Nature Methods》和《Sci...

            【关键词】 单细胞测序技术单细胞数据高通量测序

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            【学位论文】 作者:杨秀辉导师:吴昊   丁俊   山东大学   计算机科学与技术 人工智能(硕士) 2024年

            【摘要】 单细胞多组学技术阐明了复杂的细胞状态,为细胞动力学和疾病提供了变革性的见解。然而,尽管该技术已取得了长足的发展,但其多多种组学数据的分析与集成方面仍面临着一定的挑战。相对于scRNA-seq数据保有量高、稳健性好等,scATAC-seq等数...

            【关键词】 跨模态数据生成算法单细胞

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            【学位论文】 作者:王金章导师:张岩   哈尔滨工业大学   生物医学工程 生物医学工程(硕士) 2024年

            【摘要】 单细胞转录组学对研究复杂生物系统产生深远影响,通过常规测量数千个细胞的基因表达,现已能够构建全生物体细胞图谱。然而,转录组仅仅是定义细胞类型和状态以及确定其功能的众多参数中的一种。随着单细胞测序技术的发展,可以对同一个细胞同时检测转录组和染...

            【关键词】 小肠空肠

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            【学位论文】 作者:许震导师:孙磊   高海东   扬州大学   其他 通信工程(含宽带网络,移动通信等)(硕士) 2024年

            【摘要】 相对于传统的批量测序技术,单细胞组学技术具有单细胞分辨率的优点,已成为研究细胞异质性、发育过程、细胞间通信和疾病机制等问题的重要手段。特别是单细胞多组学技术能够获取同一细胞的不同组学层面信息。其中,配对的单细胞转录组测序(scRNA-seq...

            【关键词】 单细胞测序数据整合

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            【学位论文】 作者:陈丹阳导师:唐洲平   华中科技大学   临床医学 神经病学(硕士) 2023年

            【摘要】 目的:胶质母细胞瘤(Glioblastoma,GBM)预后较差,目前的治疗不够个性化和精准化。本研究旨在基于多组学数据构建GBM分子分型并开发一种稳健的预后预测模型,探索具有亚类特异性的靶向药物,改善GBM临床疗效。
              方法:本研究...

            【关键词】 胶质母细胞瘤数据

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            【学位论文】 作者:王筱颖导师:刘丙强   马勤   山东大学   数学 运筹学与控制论(博士) 2023年

            【摘要】 中心法则是生物体进行各项生命活动的所遵循的基本原则。随着测序技术的发展,基因组,转录组和蛋白质组的多种组学数据海量涌现,为深入研究生物体各项活动的内在机理提供了重大机遇。基于转录在中心法则中的轴承地位,利用转录组学数据研究生物体生命活动过程...

            【关键词】 单细胞数据挖掘药物反应

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            【学位论文】 作者:阙千荟导师:陈佳奇   哈尔滨工业大学   统计学 应用统计(硕士) 2023年

            【摘要】 单细胞多组学指的是在同一细胞中联合检测两个或更多组学数据的方法。从不同组学数据中整合信息通常可以达到更高的分析精度,并更有利于探索和识别细胞特征,以及研究个体细胞的异质性。然而,不同组学数据的异质性对数据分析带来了巨大的挑战。如何有效地对不...

            【关键词】 单细胞测序数据整合

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