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【中文期刊】 王天宇 高诗铠 等 《生理科学进展》 2025年56卷3期 226-234页ISTICPKUCA
【摘要】 单细胞转录组测序(single-cell RNA sequencing)是一种在单细胞水平上对全基因组基因表达进行高通量测序的技术,能有效解析细胞群体异质性,目前广泛应用于发育、疾病等研究领域.由于单细胞转录组数据通常存在高噪声、高维度和高...
- 概要：
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【中文期刊】 孙成涛 孙广江 等 《中国组织工程研究》 2025年29卷13期 2812-2821页ISTICPKUCA
【摘要】 背景:骨质疏松导致的脆性骨折发病率逐年上升,亟需探索其病理生理、潜在生物标志物、治疗靶点及有效药物.骨微环境中存在多种细胞,对骨代谢的维持至关重要.近几年,单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术被开发用于表征单个细胞的转录组,并逐步应用...
- 概要：
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- 结论：
【中文期刊】 刘洋 池晴佳 等 《西安交通大学学报（医学版）》 2025年46卷1期 169-177页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 通过单细胞测序(scRNA-Seq)和Bulk转录组测序(Bulk RNA-Seq)技术鉴定出与肝癌CD8+T细胞相关的生物标志物并建立预后模型.方法 从GEO数据库中下载肝癌的单细胞数据集,通过scRNA-Seq技术提取患者与对照组...
- 概要：
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【中文期刊】 胡非凡 占强 等 《南京医科大学学报（自然科学版）》 2025年45卷2期 285-290页ISTICPKUCA
【摘要】 胃癌发病和肿瘤微环境重编程密切相关,但肿瘤微环境的复杂性与异质性限制了胃癌的个体化精准诊疗.单细胞转录组测序技术从探讨肿瘤微环境重编程过程出发,可在单细胞水平"描绘"胃癌中肿瘤微环境的"景观",深入探索肿瘤微环境各细胞亚型间的相互作用,揭示...
- 概要：
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【中文期刊】 刘子瑜 耿丹丹 等 《中国组织工程研究》 2025年29卷1期 193-201页ISTICPKUCA
【摘要】 背景:帕金森病以中脑特别是黑质致密部为主要病理改变,导致患者运动和非运动功能受损.目前研究受制于细胞异质性,其发病机制仍需要更深入的阐明.近些年,单细胞转录组测序(single-cell RNA sequencing,scRNA-seq)逐...
- 概要：
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- 结论：
【中文期刊】 杨欣海 陈芳 等 《陆军军医大学学报》 2025年47卷7期 681-690页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 探究高原低氧环境联合辐照损伤对小鼠骨髓造血细胞的影响.方法 165只C57BL/6雄性小鼠(10～12周,体质量20～25 g)按随机数字表法进行分组:正常对照组(Control组,n=33)、6 Gy单纯辐照组(6 Gy组,n=43...
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【中文期刊】 孙熠伟 徐淑坦 《基因组学与应用生物学》 2025年44卷6期 561-577页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 单细胞转录组测序(single-cell RNA sequencing,scRNA-seq)在揭示细胞异质性方面具有重要意义,但现有细胞类型注释方法存在着跨物种适应性、泛化性、类别不平衡等问题.本文提出了一种基于图注意力网络(graph a...
【关键词】 图注意力网络(GAT)；单细胞转录组测序(scRNA-seq)；细胞类型注释；
- 概要：
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【中文期刊】 李晶 鞠苇杭 等 《山东大学学报（医学版）》 2025年63卷9期 31-39页ISTICPKUCA
【摘要】 目的 基于单细胞转录组学数据,探究多种癌症组织中不同细胞类型的基因共表达规律.方法 依托大规模公共单细胞转录组学数据,运用CS-CORE方法为 6 种常见的细胞类型在 5 种不同的癌症中分别构建了细胞类型特异性的基因共表达图谱.结果 共获得...
- 概要：
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- 结论：
【中文期刊】 梁乐斌 陈慧芳 等 《上海交通大学学报（医学版）》 2025年45卷10期 1261-1270页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的·研究Apcmin/+小鼠自发结肠肿瘤的空间表观遗传特征.方法·使用8月龄雄性Apcmin/+小鼠自发结肠肿瘤模型,搭建空间染色质可及性测序(assay for transposase-accessible chromatin with...
【关键词】 结直肠癌；空间染色质可及性测序；表观遗传；
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【中文期刊】 刘博 孙超 等 《吉林大学学报（医学版）》 2025年51卷2期 437-446页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的:采用生物信息学方法筛选多原发肺癌(MPLCs)的差异表达基因(DEGs),分析其生物学功能以及对肺腺癌预后的影响.方法:在高通量基因表达综合数据库(GEO)下载GSE200972单细胞转录组测序数据.采用R软件进行数据初步处理后,采用...
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