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【学位论文】 作者:孟亚茹 导师:李国君 山东大学 统计学 统计学(硕士) 2023年
【摘要】 细胞是生物体结构和功能的基本单位,其可以执行并完成生物体的各种特定功能。单细胞RNA测序使研究人员能够研究单个细胞之间的异质性,并从转录组的角度发现和定义新的细胞亚型。随着测序技术不断发展,单细胞测序技术具有高深度与高通量的优势,同时还可以...
【关键词】 单细胞RNA测序数据集 ; 聚类分析 ;
- 概要:
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- 结论:
【学位论文】 作者:袁仁辉 导师:梅正阳 华中科技大学 统计学 应用统计(硕士) 2022年
【摘要】 随着单细胞 RNA测序技术的发展,大量的单细胞 RNA测序数据集产生。细胞识别是单细胞测序的主要任务之一,如何利用已经标注的细胞去识别未被标注的细胞变得越来越重要。目前已经有很多基于传统的或者基于机器学习的细胞识别研究。但是大多数的单细胞识...
- 概要:
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- 结论:
【学位论文】 作者:闫晓芳 导师:张世华 中国科学院大学 数学 运筹学与控制论(硕士) 2019年
【摘要】 随着高通量单细胞RNA测序技术的不断进步和广泛展开,研究人员可以对特定的生物过程或者复杂疾病样本进行单细胞层面的系统研究。单细胞RNA测序为单细胞水平下研究更加精确的生物功能奠定了基础。近几年,单细胞RNA测序数据正在广泛地产生,数据越来越...
- 概要:
- 方法:
- 结论:
【中文期刊】 张书铭 张义炜 等 《广西医科大学学报》 2024年41卷1期 67-77页ISTICCA
【摘要】 目的:探讨外周血白细胞(PBLs)细胞周期末期促复合体亚基1(ANAPC1)表达与冠心病(CHD)的相关性及其诊断价值.方法:从GEO数据库检索基因表达数据集和单细胞RNA测序数据集观察ANAPC1在CHD患者PBLs和其他细胞中的表达情况...
【关键词】 细胞周期末期促复合体亚基1;冠心病;单细胞RNA测序分析;
- 概要:
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【中文期刊】 朱元增 张秀磊 等 《胃肠病学和肝病学杂志》 2024年33卷5期 532-538页ISTICCA
【摘要】 目的 探讨食管鳞状细胞癌(esophageal squamous cell carcinoma,ESCC)中肿瘤微环境(tumor microenvironment,TME)的作用及关键的 LR对及其对预后的影响,以深入理解 ESCC 的预...
- 概要:
- 方法:
- 结论:
【中文期刊】 胡逸恺 宋明坤 等 《天津医科大学学报》 2023年29卷1期 1-8页ISTIC
【摘要】 目的:使用单细胞转录组数据绘制胃癌免疫微环境组成图谱,探究胃癌转移过程中MHC-Ⅱ类分子演进缺失的免疫机制.方法:在GEO数据库中获取胃癌原发癌和转移癌单细胞数据集,基于R(4.1.2)、Python(3.7),对该数据集进行分群、拷贝数变...
- 概要:
- 方法:
- 结论:
【中文期刊】 朱晓姝 滕飞 等 《基因组学与应用生物学》 2024年43卷2期 195-206页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 单细胞转录组测序技术提供单个细胞分辨率的基因表达谱,有助于更准确地揭示细胞异质性.聚类是识别生物组织中细胞类型的主要方法,选择合适的聚类算法可以提升单细胞转录组测序数据分析的性能.本文阐述了 k-means、层次聚类(hierarchica...
- 概要:
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