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            【中文期刊】 林明海  胡连信  等 《生物工程学报》 2025年41卷6期 2415-2431页MEDLINEISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 小型城市湿地分布广泛,易受人类活动的影响,是重要的碳源和碳汇.微生物在碳循环中起重要驱动作用,但目前对小型城市湿地中原核生物多样性及其在固碳和碳代谢中的作用研究较少.为深入了解小型城市湿地中微生物驱动的碳循环过程,解析微生物群落和相关功能类...

            【关键词】 小型城市湿地基因组组装基因组固碳

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            【中文期刊】 陈宜亭  张凤  等 《生物化学与生物物理进展》 2018年45卷1期 59-67页SCIISTICPKUCSCDCABP

            【摘要】 近期,从非编码RNA中发现具有肽编码能力的小开放阅读框(sORFs),激发了人们对这种长期被忽略的基因组元件的研究兴趣,sORFs迅速成为当前重点研究领域.由于表达水平及丰度低、序列短等因素,对肽编码sORFs的有效研究方法及数据资源还很缺...

            【关键词】 小开放阅读框原核生物基因组注释蛋白质编码基因

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            【中文期刊】 向华  《微生物学通报》 2020年47卷11期 3491-3493页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 CRISPR-Cas系统是在原核微生物中广泛存在的抵抗病毒(或质粒)入侵的防御系统.基于CRISPR-Cas9系统发展的基因组编辑工具可以方便快捷地实现对生物体内基因组的精确编辑,如突变基因的修复、有益基因的强化和有害基因的删除等,已在生命...

            【关键词】 原核生物免疫系统CRISPR-Cas基因组编辑

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            【中文期刊】 刘开辉  张波  等 《微生物学报》 2018年58卷10期 1743-1753页ISTICPKUCSCDCABP

            【摘要】 [目的]揭示陕北花马盐湖沉积物原核微生物群落组成,并分析其潜在的耐盐功能基因.[方法]构建盐湖沉积物宏基因组16S rRNA文库和fosmid文库,利用Illumina HiSeq高通量测序及生物信息技术分析细菌古菌群落组成和耐盐菌株(5-...

            【关键词】 盐湖基因组文库原核生物

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            【中文期刊】 左光宏  郝柏林  《生物技术通报》 2015年11期 60-67页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 组分矢量构树(CVTree)方法是基于全基因组的、不用序列联配的物种亲缘关系研究方法。CVTree3是我们最新开发的CVTree网络服务器,它基于并行化的核心程序,以适应当前基因组数据的海量增加;它自动对比物种亲缘关系与分类系统,并在网页上...

            【关键词】 CVTree原核生物基因组

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            【中文期刊】 张成普  徐平  等 《生物工程学报》 2014年30卷7期 1026-1035页MEDLINEISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 随着基因组测序技术的不断发展,大量微生物基因组序列可以在短时间内得以准确鉴定.为了进一步探究基因组的结构与功能,基于序列特征与同源特征的基因组注释算法广泛应用于新测序物种.然而受基因组测序质量以及算法本身准确性偏低等问题的影响,现有的基因组...

            【关键词】 蛋白质基因组原核生物基因组注释

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            【中文期刊】 毕胜男  于家峰  等 《生物物理学报》 2015年31卷3期 272-285页MEDLINEISTICCA

            【摘要】 基于同义密码子偏好分析,对54个原核基因组大、小染色体及质粒中蛋白质编码基因的序列特征进行了对比分析.结果表明,大、小染色体中蛋白质编码基因的GC含量分布相近,质粒中蛋白质编码基因的GC含量分布与所在物种全基因组的GC含量差别较大.进一步的...

            【关键词】 原核生物基因组大染色体小染色体

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            【学位论文】 作者:刘孝珍 导师:张磊   沈锡辉   西北农林科技大学   生物学 微生物学(博士) 2023年

            【摘要】 群体感应(QuorumSensing,QS)是一种普遍存在的细胞间信号传输机制,通过响应环境中的自诱导物(Autoinducers,AIs)的浓度变化调节多基因表达,从而改善微生物群体功能使其适应复杂的环境。自诱导因子-2(Autoindu...

            【关键词】 原核生物基因组

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            【学位论文】 作者:钱博文 导师:郭丽   南京邮电大学   生物学 生物信息学(硕士) 2021年

            【摘要】 近年来,在基因组非编码区域发现的具有肽编码能力的小开放阅读框(Smallopenreadingframes,sORFs)引起了人们的极大关注。肽编码sORFs序列短(小于100个氨基酸)、表达水平低,过去的研究认为这些短ORFs不可能编码蛋...

            【关键词】 原核生物基因组肽编码sORFs

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            【学位论文】 作者:张亚东 导师:肖景发   中国科学院大学   生物学 生物信息学(博士) 2020年

            【摘要】 基因组测序技术的飞速发展,使得大量的原核生物基因组被测序和解析,这为探索物种间的演化机制和基因组动力学提供了丰富的数据基础。泛基因组分析不但在研究物种演化和物种鉴定、分类上发挥了重要的作用,在致病菌的防治和疫苗制备等方面也具有巨大的价值。目...

            【关键词】 原核生物基因组

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