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【中文期刊】 李光 王亚东 等 《生物信息学》 2007年5卷2期 78-81页ISTIC
【摘要】 DNALA是一种个人DNA数据隐私保护的方法.该方法能有效的实现对个人DNA数据的隐私保护,但前期数据预处理复杂,而且后期处理精度不高.本文针对DNALA的这些缺点进行改进,形成了Savior算法.Savior算法在数据预处理阶段用双序列比...
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【中文期刊】 曹莉 许玉龙 等 《计算机系统应用》 2015年9期 112-117页
【摘要】 随着生物序列数据库中序列数据的激增,开发兼有高度生物敏感性和高效率的算法显得极为迫切。通过对生物序列比对问题中Needleman-Wunsch算法和Smith-Waterman算法深入分析,提出了Smith-Waterman算法的改进算法,...
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【中文期刊】 梁之昶 陈小玲 等 《黑龙江畜牧兽医》 2007年11期 7-9页
【摘要】 为设计A型FMDV基因分型探针建立其3个基因型的数据库,以美国国家生物技术信息中心(NCBI)基因库和英国口蹄疫世界参考实验室(FMDWRL)基因库中所登记的血清A型口蹄疫病毒(FMDV)VP1基因序列为研究对象,运用双序列比对和构建系统发...
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【中文期刊】 梁之昶 陈小玲 等 《动物医学进展》 2007年28卷7期 102-106页
【摘要】 研究仔猪12种致病菌的16 S rRNA基因序列,分析其亲缘关系,为设计其16 S rRNA基因的诊断探针提供理论依据.从美国国家生物技术信息中心(NCBI)基因库中下载332条仔猪12种致病菌的16S rRNA基因序列,应用双序列比对和构...
【关键词】 16 S rRNA基因;致病菌;双序列比对;
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【中文期刊】 罗静初 《生物信息学》 2023年21卷1期 1-19页ISTIC
【摘要】 首先介绍序列比对的分子生物学基础,即核酸序列基本单元核苷酸和蛋白质序列基本单元氨基酸.文中以精心设计的图表列出四种核苷酸和二十种氨基酸的名称、性质和分类.第2节简述序列比对基础,包括相似性和同源性基本概念、整体比对和局部比对、点阵图方法、动...
- 概要:
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【中文期刊】 罗静初 《生物信息学》 2021年19卷1期 1-25页ISTIC
【摘要】 本文介绍欧洲分子生物学开放软件包EMBOSS序列分析程序应用实例.第1节简单介绍EMBOSS软件包的概况和基本用法.第2节介绍格式转换、序列提取、序列变换和序列显示等常用序列处理程序.第3节介绍序列比对程序,包括双序列比对、多序列比对和点阵...
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【中文期刊】 薛颖 黄维藻 等 《应用与环境生物学报》 2008年14卷3期 337-340页ISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 RBX1蛋白是基于Cullin蛋白的E3复合体中的一个亚基,对于基于Cullin蛋白的E3复合体结合E2及Cullin蛋白的活化具有重要作用.利用RT-PCR分离到水稻RBX1cDNA,序列比对分析显示,水稻RBX1与拟南芥、人、果蝇及酵母...
- 概要:
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【学位论文】 作者:王金彪 导师:孙磊 高海东 扬州大学 其他 电子信息(硕士) 2023年
【摘要】 规律间隔成簇短回文重复序列(ClusteredRegularlyInterspacedShortPalindromicRepeats,CRISPR)及相关蛋白(CRISPR-associated,Cas)系统(CRISPR-Cas)是一种存...
【关键词】 规律间隔成簇短回文重复序列 ; 相关蛋白系统 ;
- 概要:
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【学位论文】 作者:杨海 导师:朱大铭 山东大学 计算机科学与技术 计算机软件与理论(博士) 2019年
【摘要】 结构变异(Structural Variation,SV)通常是指规模介于单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)和染色体变异之间的基因组变异形式,是生物遗传多样性的重要组成部分,不仅能够导致个...
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- 方法:
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【学位论文】 作者:贾丽娟 导师:霍红卫 西安电子科技大学 计算机科学与技术 计算机软件与理论(硕士) 2011年
【摘要】 序列比对是生物信息学中一种基本的信息处理问题,对于发现核酸和蛋白质序列上的功能、结构以及进化信息具有非常重要的意义。随着生物序列数据库中序列数据的激增,设计出能够处理大规模运算的并行算法就显得非常迫切。本文研究了生物信息学中的双序列比对及其...
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