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【中文期刊】 李彦 蔡永琴 等 《生物技术通讯》 2015年26卷1期 74-77,145页ISTICCA
【摘要】 目的:研究钙调蛋白(CaM)结构的动力学行为和运动趋势.方法:利用高斯网络模型(GNM)和各向异性网络模型(ANM),分析CaM在无钙和含钙2种形式下的功能运动.结果:CaM的慢运动模式显示,CaM的构象变化主要表现为2个结构域的运动;2种...
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【中文期刊】 左柯 胡建平 等 《江苏农业科学》 2017年45卷22期 32-37页
【摘要】 HIV-1整合酶(HIV-1 IN)是目前开发抗艾滋病药中最具潜力的药物靶点之一,四聚体是该蛋白发挥生物学功能的主要聚集体形式.为了得到IN四聚体与病毒DNA的复合物,并研究其运动性与生物学功能的关系,采用同源模建、结构优化及叠落等方法,在...
【关键词】 HIV-1整合酶四聚体;病毒DNA;高斯网络模型;
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【中文期刊】 陈磊 巩卫康 等 《生物化学与生物物理进展》 2022年49卷6期 1146-1154页SCIISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 目的 阿片受体是一种G蛋白偶联受体(GPCR),主要通过变构转导胞外区内源性配体结合信号,使其与胞内区效应蛋白偶联来介导镇痛反应.δ阿片受体(DOP)除了与疼痛控制有关外,还与情绪控制有关,是一个很有吸引力的治疗靶点.本文旨在分析DOP的结...
【关键词】 δ阿片受体(DOP);各向异性网络模型;微扰响应扫描;
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【外文期刊】 Riccardi D ; Cui Q ; 等 《Biophysical Journal》 2009年96卷2期 464-475页SCISCIEMEDLINE
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【学位论文】 作者:余俊锋 导师:张颖 内蒙古工业大学 统计学 统计学(硕士) 2024年
【摘要】 识别G蛋白偶联受体的关键残基对了解其变构调节机制起着关键性作用,然而通过实验手段获取复合体晶体结构,进而识别关键残基需要消耗大量的资源。随着计算机技术的发展,通过分子对接、分子动力学模拟和机器学习等计算手段可以有效地预测蛋白质与配体的结合位...
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- 方法:
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【学位论文】 作者:郑烨翰 导师:田绪红 华南农业大学 计算机科学与技术 计算机应用技术(硕士) 2012年
【摘要】 蛋白质折叠是分子生物学中的一个基础性问题。蛋白质折叠机理的研究,对探索生物现象机理以及蛋白质构象病的治疗具有重要意义。前期研究中通过全原子的分子动力学和Monte Carlo的方法对蛋白质折叠和去折叠进行模拟,均可得到良好的构象特征数据和模...
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【学位论文】 作者:苏计国 导师:王存新 北京工业大学 生物医学工程 生物医学工程(硕士) 2006年
【摘要】 随着人类基因组计划的顺利完成,以功能基因组学和蛋白质组学为主要研究内容的后基因组时代已经到来。从蛋白质一维序列预测其三维结构,进而从三维结构预测其生物学功能是蛋白质组学研究的重要组成部分。储存在DNA分子中的遗传信息转录到RNA,然后翻译为...
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