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【中文期刊】 汪梦竹 胡欣妍 等 《微生物学通报》 2023年50卷7期 3146-3158页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 同义密码子使用模式作为核苷酸与氨基酸的纽带,其多样性介导了核糖体扫描速率,同时扩充了基因的遗传信息存储量.随着新型技术的应用,发现特异性密码子和密码子结合力可调节核糖体扫描速率并影响蛋白质构象.同义密码子使用模式通过多种方式在不同环节影响着...
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【中文期刊】 李易聪 蒲飞洋 等 《生物工程学报》 2022年38卷3期 882-892页MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 随着基因组学和转录组学在不同生物体遗传和细胞生物学领域的广泛应用,同义密码子使用的偏嗜性逐渐被接受,并且在研究生物进化与生物表型之间的深层联系时,同义密码子使用模式受到相关领域研究人员的重视.信使RNA(messenger RNA,mRNA...
【关键词】 同义密码子使用模式；mRNA；精微调控翻译选择压力；
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【学位论文】 作者：张文娟 导师：钟扬 复旦大学 生物学 生物信息学（博士） 2006年
【摘要】 密码子水平的生物信息学分析是研究基因组进化、蛋白质功能以及遗传和环境相互作用等课题中一个的重要环节。本文中，我们从密码子使用模式的比较基因组分析、密码子用法作为构建系统发育树的方法以及基于密码子置换模型的适应性进化检测等三个方面进行了探索。...
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【学位论文】 作者：顾万君 导师：陆祖宏 东南大学 生物医学工程 生物医学工程（博士） 2004年
【摘要】 随着人类基因组计划和模式生物基因组计划的完成,公共数据库中生物数据的增长速度越来越快.如何从海量的生物数据中解读、提取和获得有用的生物信息,已成为基因组计划下一步亟待解决的问题.本文中,我们利用生物信息学的方法对基因的同义密码子使用进行了统...
- 概要：
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【中文期刊】 柯清林 上官宏斌 等 《微生物学杂志》 2024年44卷6期 78-84页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 淡紫灰链霉菌(Streptomyces lavendulae)BP39是一株具有广谱杀菌性能的生防菌.为探讨菌株BP39基因组密码子的偏好性,本研究基于菌株BP39的6356条编码序列,利用CodonW软件,计算其GC含量、有效密码子数(E...
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【中文期刊】 戴开宇 杨治风 等 《中国畜牧兽医》 2024年51卷1期 11-22页
【摘要】 [目的]探究Toll样受体5(TLR5)基因的密码子使用模式,并分析TLR5基因密码子使用偏好性的影响因素.[方法]综合运用CodonW、BioEdit和R等软件对筛选的15个不同物种TLR5基因完整编码区(CDS)序列核苷酸组成和密码子使...
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【中文期刊】 李鑫 李伟 等 《中国畜牧兽医》 2024年51卷4期 1349-1361页
【摘要】 [目的]明确乌苏里貉黑素皮质素受体3(melanocortin 3 receptor,MC3R)基因密码子使用偏好特征和影响因素,了解不同物种间遗传进化和密码子偏好性的关系,为开展MC3R基因异源高效表达研究提供理论依据.[方法]以乌苏里貉...
- 概要：
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【中文期刊】 凌立贞 王琴 等 《六盘水师范学院学报》 2024年36卷6期 58-68页
【摘要】 为了揭示罂粟全基因组密码子使用的偏好性特征及其影响因素,以罂粟的全基因组蛋白质编码序列为研究对象,采用CodonW软件以及在线工具CUSP系统分析获得的68 828条蛋白质编码序列.研究结果显示:罂粟编码基因中的密码子平均GC含量为41.5...
- 概要：
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【中文期刊】 郭松 梁湘兰 等 《广西植物》 2022年42卷8期 1426-1432页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 为确定瑶药紫九牛叶绿体基因组密码子的使用模式及其成因,该研究以紫九牛叶绿体基因组50条蛋白质编码序列为研究对象,利用Codon W 1.4.2和在线软件CUSP和Chips分析其密码子偏好性.结果表明:(1)RSCU>1的密码子有29个,其...
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