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【中文期刊】 韩超 段磊 等 《计算机科学与探索》 2017年11卷6期 897-907页
【摘要】 随着序列数据在实际中的广泛应用,序列数据质量评价成为学术、工业等众多领域的热门研究问题.目前主流的序列数据质量评价方法是基于概率后缀树模型进行数据质量评价,然而这种方法难以实现对大规模数据的处理.为解决此问题,提出了基于Spark的序列数据...
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【中文期刊】 王慧锋 段磊 等 《计算机科学与探索》 2015年10期 1180-1194页
【摘要】 序列数据广泛存在于实际应用中，因此关于序列数据挖掘的算法研究一直都是热点。序列数据的质量关系到挖掘结果的可靠性，传统的数据质量评价方法多通过统计指标来分析数据的质量问题，但统计指标无法对非结构化序列数据中各元素之间的关系进行评估。为检测序列...
- 概要：
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【中文期刊】 林德南 彭志刚 等 《无线互联科技》 2015年5期 95-96,104页
【摘要】 云计算在大数据处理、资源共享方面的优势使得越来越多的行业使用云计算技术。云计算中的数据存储和检索方式与传统的数据库系统不同，且传统数据库的数据查询方式无法直接迁移到云平台中。文章利用后缀树建立云存储的算法，并讨论了基于后缀树云查询模型，且该...
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【中文期刊】 郑琪 蒋盛益 等 《计算机工程与应用》 2010年46卷23期 79-81页
【摘要】 系统调用序列能够反映系统进程的行为特征.而系统调用序列中每个调用的出现都与它之前出现的若干个调用相关.因此可以利用概率后缀树(PST)对系统调用序列建模,反映系统调用基于上下文的概率特性.提出了系统调用序列异常度的定义.在进行序列的异常检测...
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【中文期刊】 赵国光 尹湘舟 等 《微计算机信息》 2010年26卷12期 158-160页
【摘要】 本文利用后缀树向量空间模型(VSM),为每篇文献建立相应的基于内容的向量模型,通过夹角余弦得出文献之间的相似度,再结合中国医学科学院医学信息研究所提供的文献数据,最终构建出医学文献相关性数据库.该模型与传统的基于词表的VSM相比,最大的优点...
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【学位论文】 作者：张欣 导师：杨希武 辽宁师范大学 数学 应用数学（硕士） 2019年
【摘要】 生物序列比较是近年来迅速发展起来的一门学科，主要用来应对由分子生物学飞速发展所产生的巨大数据等问题。生物序列比较的常见方法有2种：序列的比对方法和序列的非比对方法。然而由于生物的全基因组序列比较长，比对方法计算量较大，我们利用序列的比对方法...
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【学位论文】 作者：乔科 导师：霍红卫 西安电子科技大学 计算机科学与技术 计算机软件与理论（硕士） 2014年
【摘要】 模体发现问题,即寻找转录因子结合位点(TFBS),是生物信息学上研究的热门问题之一。由于模体蕴含着丰富的生命遗传特征信息,所以探究基因序列上的模体实例,对基因表达和调控具有重要意义。而生物序列的复杂性和基因变异的存在导致了模体在空间分布和特...
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【学位论文】 作者：王洋 导师：林友芳 北京交通大学 计算机科学与技术 计算机科学与技术（硕士） 2011年
【摘要】 转录因子结合位点预测问题,即在DNA序列中发现允许出现变异的motif的问题,不论对于分子生物学还是对于计算生物学,都是一项非常重要的研究。基于一致序列表达的模式发现算法,典型的如使用后缀树来存储DNA序列,当通过深度优先遍历后缀树来匹配模...
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【学位论文】 作者：余希田 导师：李丹亚 中国协和医科大学(北京协和医学院) 北京协和医学院;中国医学科学院;清华大学医学部 图书馆、情报与档案管理 情报学（硕士） 2008年
【摘要】 为了进一步提高现有文献数据库的知识服务水平，中国医学科学院医学信息研究所近年来对构建面向知识服务的医学文献相关性数据库进行了大量的研究，已经探索出一套较为成熟且实用的基于词表分词的文献相关性判定算法，并基于此算法成功构建了中国生物医学工程文...
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【学位论文】 作者：王镝 导师：王国仁 东北大学 计算机科学与技术 计算机系统结构（博士） 2006年
【摘要】 生物信息学是20世纪80年代末，随着人类基因组计划的不断发展，基因序列和蛋白质数据的急速增加，以及信息理论和计算机技术的不断发展而逐渐形成的。在过去的十几年中人类对生物信息学，特别是DNA和人类基因序列的研究取得了长足的发展。海量DNA序列...
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