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【中文期刊】 徐建震 郭政 等 《生物物理学报》 2005年21卷3期 187-194页MEDLINEISTICCA
【摘要】 使用两套基因表达谱数据,按各基因的表达值方差,选择表达变异基因对样本聚类,发现一般使用方差较大的前10%的基因作为特征基因,就可以较好地对疾病样本聚类.对不同的疾病,包含聚类信息的特征基因有不同的分布特点.在此基础上,结合基因功能分类体系(...
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【中文期刊】 郭政 张田文 等 《同济大学学报（自然科学版）》 2006年34卷2期 264-269页
【摘要】 按GeneOntology基因功能分类体系,将基因模块化地组织成具有显著生物意义的低维功能模块单元,并将其作为新的分析指标用于分类微阵列疾病样本,从而提出了基于功能表达谱的聚类分析新途径.采用NCI60数据集,通过功能表达谱对组织样本进行聚...
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【会议论文】徐建震 第十届全国医药信息学大会 2005年
【摘要】 利用两套表达谱数据,选择不同程度的高变异基因,结合基因功能分类体系Gene Ontology筛选疾病相关的功能模块,并探讨模块选择结果对高变异基因的不同选择标准的稳健性.结果表明,利用前10﹪高变异基因筛选的功能模块具有较好的聚类效果,在不...
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【会议论文】朱晶 第十届全国医药信息学大会 2005年
【摘要】 特定的疾病状态一般仅与少数基因有比较直接的关系,而这少数疾病相关的基因对应的基因功能类中应该显著聚集由于疾病状态引起的差异表达的基因.据此假设,提出了一种结合基因功能分类知识的特征基因选择与疾病分类方法.在将基因注释到基因功能分类体系(Ge...
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【中文期刊】 鲍家成 杨渊 《华夏医学》 2024年37卷1期 50-60页CA
【摘要】 目的 通过网络药理学研究枸骨叶治疗非酒精性脂肪肝病(NAFLD)的生物学靶点和作用机制.方法 通过本草组鉴(HERB)数据库、SwissADME和中医药系统药理学(TCMSP)数据库筛选枸骨叶的活性成分,通过TCMSP 和Swiss Tar...
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【中文期刊】 牟少华 李娟 等 《广西植物》 2022年42卷8期 1383-1393页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 毛竹是我国重要的经济竹种,在长期栽培适应过程中产生了丰富的变异.为揭示毛竹竹秆变异变型的全基因组突变类型,以黄皮毛竹、金丝毛竹、绿皮花毛竹和花毛竹4个毛竹变型为实验材料,采用高通量重测序技术获得全基因组序列,进行单核苷多态性(SNP)、小片...
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【中文期刊】 屠康 喻辉 等 《生物化学与生物物理进展》 2004年31卷8期 705-711页SCIISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 针对基因功能分类体系Gene Ontology的层次结构特点,修改关联规则挖掘算法Apriori,开发"挖掘与基因差异表达关联的GO功能组合"软件(RuleGO).RuleGO以基因表达谱上的差异表达基因集合和不差异表达基因集合为输入,输出...
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【中文期刊】 袁发浒 胡松 等 《中国比较医学杂志》 2019年29卷7期 53-60页ISTICPKUCA
【摘要】 目的 骨关节炎(osteoarthritis,OA)是最常见的退行性慢性关节疾病,然而其具体的基因机制至今尚不完全清楚,通过基因芯片检测OA细胞模型的基因表达谱变化,为深入研究OA发病机制提供更多生物学依据.方法 胰酶结合胶原酶分离获得小鼠...
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【学位论文】 作者：张海燕 导师：钱永华 鲁兴萌 西北农林科技大学 西北农林科技大学 兽医学 预防兽医（硕士） 2007年
【摘要】 基于微孢子虫分类学地位的争议，本研究通过克隆家蚕微孢子虫(Nosema bombycis)的α-Tubulin、β-Tubulin基因，利用Bioeditor将核苷酸序列翻译成氨基酸序列，并从NCBI中收集不同物种的α-Tubulin、β-...
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【中文期刊】 钟国才 李强 等 《中国神经精神疾病杂志》 2007年33卷2期 82-87页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 研究安佳欣胶囊对抑郁症模型大鼠基因功能类表达的影响.方法 分析抑郁症大鼠模型组和安佳欣胶囊组各8例样本的基因表达谱数据,筛选差异表达基因.利用基因功能分类体系Gene Ontology中的生物学过程子树和细胞组分子树,寻找和分析显著聚...
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