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【中文期刊】 张宏 展淑琴 《实用临床医药杂志》 2024年28卷19期 22-26,32页ISTICCA
【摘要】 目的 基于生物信息学分析筛选阿尔茨海默病(AD)的核心基因,并对可能的致病信号通路进行分析.方法 从基因表达综合(GEO)数据库中下载AD相关基因芯片数据,筛选出GSE227221和GSE162873数据集.应用GEO2R在线分析软件筛选A...
- 概要：
- 方法：
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【中文期刊】 王建平 霍子天 等 《生命科学研究》 2024年28卷2期 143-151页ISTICCA
【摘要】 免疫细胞一直被认为是维持机体平衡的重要调节因子,对肿瘤浸润免疫细胞进行量化分析有望揭示免疫系统在肿瘤中的多方面作用.本文总结了量化肿瘤浸润免疫细胞的计算方法及相关的分析工具,包括基于标志基因富集分析方法和反卷积分析方法开发的算法模型与工具,...
【关键词】 肿瘤；肿瘤浸润免疫细胞(TIC)；基因集富集分析(GSEA)；
- 概要：
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【中文期刊】 匡思杰 成宏 等 《重庆医学》 2023年52卷9期 1399-1407页MEDLINEISTICCA
【摘要】 目的 鉴定影响乳腺癌患者生存预后的肿瘤特征,探究酸敏感离子通道3(ACCN3)和过氧化物酶样蛋白(PXDNL)对乳腺癌细胞增殖、侵袭、迁移和患者生存预后的影响.方法 利用单样本基因富集分析(ssGSEA)和Cox回归分析评估不同肿瘤特征与乳...
【关键词】 乳腺癌；加权基因共表达网络分析；单样本基因富集分析；
- 概要：
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【中文期刊】 张平安 高娜 等 《广东药科大学学报》 2022年38卷3期 98-105页ISTICCA
【摘要】 目的 利用生物信息学的方法探究IL-8在慢性阻塞性肺疾病(COPD)中的差异表达机制及其相关基因的功能.方法 使用基因表达综合数据库(gene expression omnibus,GEO)筛选慢阻肺患者和正常对照样本的mRNA、miRNA...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 刘博 孙超 等 《吉林大学学报（医学版）》 2025年51卷2期 437-446页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的:采用生物信息学方法筛选多原发肺癌(MPLCs)的差异表达基因(DEGs),分析其生物学功能以及对肺腺癌预后的影响.方法:在高通量基因表达综合数据库(GEO)下载GSE200972单细胞转录组测序数据.采用R软件进行数据初步处理后,采用...
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- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 易嘉欣 廖建春 等 《国际口腔医学杂志》 2025年52卷2期 210-216页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 探究金担子素A(AbA)对白色念珠菌的抑菌活性及潜在作用机制,评估其未来作为新型抗真菌药物的应用潜力.方法 首先测定了AbA的最低抑菌浓度(MIC),并探究其对菌丝形成及细胞壁完整性的影响.随后,利用转录组测序探讨了白色念珠菌在AbA...
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【中文期刊】 刘雅妮 杨静欢 等 《中国组织工程研究》 2025年29卷5期 1091-1100页ISTICPKUCA
【摘要】 背景:纤维肌痛综合征作为常见风湿病,其发病与中枢敏化及免疫异常有关,但具体过程尚未阐明,缺乏特异性诊断标志物,不断探索该病的发病机制具有重要的临床意义.目的:基于加权基因共表达网络分析(WGCNA)等生物信息学方法和机器学习算法筛选纤维肌痛...
- 概要：
- 方法：
- 结论：
【中文期刊】 谢铱子 林雪莹 等 《中国组织工程研究》 2025年29卷31期 6708-6716页ISTICPKUCA
【摘要】 背景:线粒体自噬与特发性肺纤维化的发生发展关系密切,但其作用机制尚不清楚.目的:探讨线粒体自噬在特发性肺纤维化中的生物学机制,为临床特发性肺纤维化风险预测及亚型区分提供思路.方法:通过GEO和Reactome Pathway数据库等获取特发...
- 概要：
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- 结论：
【中文期刊】 巩月红 王梦君 等 《中国组织工程研究》 2025年29卷35期 7679-7689页ISTICPKUCA
【摘要】 背景:肺纤维化的早期诊断是及时开展抗纤维化药物治疗的基础,因此,探索并发现能够有效应用于肺纤维化早期诊断的理想生物标志物对疾病治疗至关重要.目的:通过生物信息学和机器学习技术对肺纤维化过程中涉及的与自噬相关关键基因进行深入分析,探究与自噬相...
- 概要：
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【中文期刊】 柳可心 马超 等 《中国组织工程研究》 2025年29卷20期 4181-4189页ISTICPKUCA
【摘要】 背景:葡萄糖代谢过程在维持机体正常生理功能中扮演着至关重要的角色,当葡萄糖代谢出现紊乱时,可能会导致一系列的健康问题.目前,骨关节炎中葡萄糖代谢相关分子机制和潜在基因靶点有待进一步研究.目的:通过生物信息学方法分析骨关节炎中葡萄糖代谢相关基...
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