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【中文期刊】 韩咏 杨军 等 《中华肿瘤防治杂志》 2021年28卷6期 442-448页ISTICPKUCA
【摘要】 目的 利用癌症基因图谱(TCGA)数据评估分析人线粒体转录延伸因子(TEFM)基因在原发性肝癌中的表达及临床意义,为原发性肝癌的诊治提供新思路.方法 从TCGA中下载肝癌数据集,获得TEFM基因表达谱和临床数据;利用R语言及Perl语言对数...
【关键词】 肝癌;人线粒体转录延伸因子;线粒体;
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【中文期刊】 张雨青 曹佳宝 等 《生物工程学报》 2020年36卷12期 2566-2581页MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 病毒组是指分布在各种环境中病毒的集合或病毒宏基因组的统称.病毒可以分布于水体、冰川、动植物甚至某些病毒当中,主要分为真核病毒、原核病毒和亚病毒.其在维持环境内稳态、生态系统平衡等方面起着非常重要的作用,并且与人类的健康密切相关.近年来,随着...
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【中文期刊】 谭玉靓 唐文静 等 《现代预防医学》 2020年47卷12期 2228-2232页ISTICPKUCA
【摘要】 目的 基于生物信息学,对缺血性脑卒中(IS)相关差异表达基因(DEGs)进行分子层面的分析,深入分析IS的发病机制和关键基因.方法 从GEO数据库下载与IS相关的生物基因芯片,基于P值及log |FC|值对GEO原始数据进行筛选,确定DEG...
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【中文期刊】 满君 张晓梅 等 《现代预防医学》 2020年47卷3期 502-507页ISTICPKUCA
【摘要】 目的 应用生物信息学方法挖掘恶性肺结节的相关基因,为恶性肺结节诊断和治疗提供靶点.方法 从GEO(Gene Expression Omnibus)数据库中下载基因芯片数据集GSE108375和GSE27489,利用GEO2R筛选恶性肺结节的...
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【中文期刊】 张珊 陈巍 等 《中华行为医学与脑科学杂志》 2020年29卷9期 827-833页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的:分析抑郁症患者较健康人各脑区转录组基因的差异表达情况。方法:在基因表达谱数据库(gene expression omnibus,GEO)中搜索抑郁症病例-对照设计并含有原始数据的研究,设定物种为人。以各数据集所有转录组基因为观察变量,...
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【中文期刊】 何诚成 张迎春 等 《细胞与分子免疫学杂志》 2019年35卷6期 481-490页MEDLINEISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 寻找脓毒症患者中性粒细胞中发生差异变化的致病相关基因及关键通路.方法 从基因表达汇编(GEO)数据库下载GSE6535、GSE49755、GSF49756、GSE49757,其中包含143个实验组样本及65个对照组样本的基因芯片数据....
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【中文期刊】 李子超 易晓巍 等 《中华整形外科杂志》 2019年35卷4期 361-366页MEDLINEISTICPKUCSCD
【摘要】 目的 探究通过加入间充质干细胞产生的细胞外基质,从而改变肪来源干细胞的微环境后,使得脂肪来源干细胞增殖转化功能改善的核心分子和作用机制.方法 采用生物信息学方法,从基因表达谱芯片数据库中获取12组供体的转录组信息,并分为4组:Ad on N...
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【中文期刊】 金美玲 李艳春 等 《中华肾病研究电子杂志》 2021年10卷4期 205-213页ISTIC
【摘要】 目的:基于生物信息学对IgA肾病(IgAN)基因表达谱数据进行基因富集分析和免疫细胞浸润分析,旨在研究IgAN相关免疫机制。方法:从基因表达集(GEO)数据库获取IgAN肾脏组织的GSE93798整体RNA序列数据,利用limma软件包筛选...
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【中文期刊】 邱冬妮 潘峰 等 《中医杂志》 2018年59卷2期 151-155页ISTICPKUCSCD
【摘要】 目的 通过网络药理学方法探讨补肾强督治偻方治疗强直性脊柱炎的作用机理.方法 运用中药系统药理学成分分析平台(BAT-MAN)数据库获取补肾强督治偻方的作用靶标基因,于CTD数据库中获取强直性脊柱炎疾病相对应的靶标基因,将两者取交集后获取疾病...
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【中文期刊】 贺佐梅 曾普华 等 《中医杂志》 2018年59卷13期 1139-1143页ISTICPKUCSCD
【摘要】 目的 基于网络药理学方法探讨固肺消积饮治疗非小细胞肺癌的可能作用机制. 方法 利用TCMSP数据库,采用口服生物利用度筛选和药物相似性评价筛选固肺消积饮药物有效成分,并预测疾病靶点,构建成分-靶点网络图,并筛选核心网络图,用DAVID数据库...
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