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            【中文期刊】 吕俊增  曹舒淇  等 《生物信息学》 2025年23卷2期 88-95页ISTIC

            【摘要】 基因组变异作为生物遗传多样性产生的核心,对解析生命演化、揭示物种内个体差异、探究疾病机制等方面有重要影响,而参考基因组作为遗传研究中的参考框架,其序列表征能力会直接影响遗传变异的准确识别.当前广泛应用的人类参考基因组主要由西方人群样本组成,...

            【关键词】 大规模人群参考基因基因序列比对

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            【中文期刊】 彭珊  王超  等 《广东畜牧兽医科技》 2025年50卷4期 94-104页

            【摘要】 小鹅瘟是由鹅细小病毒(Goose parvovirus,GPV)引发的传染病,20日龄内雏鹅具有高致死性,而青年鹅常表现为隐性感染,易被忽视.2024年11月,广东揭阳某地养鹅场青年鹅群(56日龄)急性发病,为明确病因,针对送检的病死鹅进行...

            【关键词】 鹅细小病毒基因遗传进化分析

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            【中文期刊】 杨振华  《河北北方学院学报(自然科学版)》 2025年41卷1期 30-36页

            【摘要】 随着高通量测序技术的发展,产生了大量全基因组序列数据.为提升非比对算法在构建全基因组序列进化关系方面的灵敏度和准确性,选择合适的k-mer模体数目十分重要.综述了 4类基于k-mer特征集的非比对计算方法:k-mer频率、k-mer间隔分布...

            【关键词】 算法基因k-mer特征集合

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            【中文期刊】 齐齐  蔡青山  等 《中国防痨杂志》 2024年46卷z1期 4-8页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 目的:探讨宏基因二代测序技术(metagenomic next-generation sequencing,mNGS)在胸内淋巴结结核中的诊断价值.方法:采用回顾性研究方法,搜集2020年12月至2023年9月浙江省中西医结合医院结核病诊疗...

            【关键词】 基因组二代测结核,胸内淋巴结诊断技术和方法

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            【中文期刊】 徐子健  江祉依  等 《基因组学与应用生物学》 2024年43卷6期 986-996页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 DNA甲基化作为一种表观遗传修饰,在植物的生长、发育和逆境反应中发挥着至关重要的作用.全基因组重亚硫酸盐测序(whole genome bisulfite sequencing,WGBS)被认为是DNA甲基化研究的"金标准",并且广泛应用于...

            【关键词】 DNA甲基化基因组甲基化测序列比对

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            【中文期刊】 姚晓伟  刘树仁  等 《结核与肺部疾病杂志》 2024年5卷1期 37-43页

            【摘要】 目的:评估二代测序技术(next generation sequencing,NGS)在骨关节结核诊断中的应用价值.方法:采用回顾性研究方法,参照入组标准收集2019年12月至2022年12月河北省胸科医院骨科收治的185例疑似骨关节结核患...

            【关键词】 结核,骨关节基因组二代测诊断技术和方法

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            【中文期刊】 张锦程  白和平  等 《中国兽医杂志》 2024年60卷6期 64-69页

            【摘要】 为了确定肉牛场犊牛患呼吸道疾病死亡的致病原,本试验采集河北省秦皇岛地区5个肉牛养殖场病牛的肺脏组织进行病原的分离培养,采用染色镜检、培养特性观察、支原体特异性oppD/F基因鉴定、16S rRNA序列比对和同源性分析鉴定分离菌株,并通过药敏...

            【关键词】 牛支原体瑞氏染色16S rRNA序列比对

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            【中文期刊】 黄琼林  谭靖怡  等 《福建农林大学学报(自然科学版)》 2024年53卷3期 323-331页

            【摘要】 [目的]阐明药食两用植物五指毛桃的叶绿体基因组结构及其系统进化关系,为其资源利用和产品开发等研究提供基因组信息.[方法]采用高通量测序技术对五指毛桃叶绿体基因组测序,并借助生物信息工具和软件进行序列拼接、注释、比对和系统进化分析.[结果]五...

            【关键词】 五指毛桃叶绿体基因密码子偏好性

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            【中文期刊】 张胜亮  《医学理论与实践》 2024年37卷13期 2280-2282页

            【摘要】 目的:对比分析突变扩增阻滞系统法(ARMS)及Sanger测序法对结肠癌患者KRAS基因突变的检测效果.方法:收集2019 年3 月—2023 年4 月医院收诊的98 例结肠癌手术患者,并对其手术切除病理标本中KRAS基因突变情况进行探究,...

            【关键词】 ARMS法检测Sanger测法检测结肠癌

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            【中文期刊】 吴民华  陈依虹  等 《湖南农业大学学报(自然科学版)》 2024年50卷2期 42-49页

            【摘要】 为了探明岭南地区特色中药三桠苦的叶绿体基因组结构和序列特征,以三桠苦叶片为材料,采用试剂盒法提取DNA和构建测序文库,利用Novaseq平台进行高通量测序,再结合生物信息学手段进行序列拼接、注释和特征分析.结果显示:三桠苦叶绿体基因组为 1...

            【关键词】 三桠苦叶绿体基因结构特征

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