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            【中文期刊】 周贤喆  韩象名  等 《医学研究杂志》 2024年53卷5期 27-32页ISTIC

            【摘要】 目的 探讨亲环蛋白B(cyclophilin B,PPIB)在脑胶质瘤中的表达与临床病理特征、患者生存期的关系,以及与肿瘤相关巨噬细胞浸润的相关性.方法 基于癌症基因组数据集(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库...

            【关键词】 胶质瘤亲环蛋白B癌症基因数据集

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            【中文期刊】 王微微  季瑞  等 《诊断病理学杂志》 2023年30卷3期 308-312页ISTIC

            【摘要】 基于数据库分析自噬相关的基因与卵巢癌(ovarian cancer,OC)不良预后的关系.通过GEO数据库GSE54388数据集筛选OC中的差异基因,GO数据库分析确认其中与自噬相关的基因,对其进行PPI、KEGG分析,并通过在线数据库确认...

            【关键词】 生物学信息分析自噬卵巢癌

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            【中文期刊】 王振  YAO Mawulikplimi Adzavon  等 《生物技术进展》 2023年13卷1期 131-139页

            【摘要】 已有研究显示,胎龄小于14 d的小鼠胎儿皮肤能够实现无疤痕创伤愈合.深入研究胎儿无疤痕愈合的分子机理,对于伤口护理方法优化与创伤医学的发展至关重要.利用已有数据库进行不同胎龄的小鼠皮肤组织转录组深入挖掘是常用的研究方法之一.从基因表达综合数...

            【关键词】 无疤痕愈合GEO数据集分析妊娠胎儿

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            【中文期刊】 王治  洪莉  等 《吉林大学学报(医学版)》 2020年46卷4期 804-809页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 目的:通过生物信息学方法分析与子宫内膜癌(EC)发生发展相关的关键基因和候选通路,探讨EC的发病机制和治疗靶点.方法:自公共基因芯片数据库(GEO)下载EC芯片数据集GSE17025和GSE63678,使用GE02R在线分析工具和R软件筛选...

            【关键词】 生物信息学子宫内膜癌差异基因

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            【中文期刊】 习文  肖洋  等 《中华检验医学杂志》 2025年48卷1期 117-124页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 目的:初步建立一种临床实验室病原宏基因组测序(mNGS)生物信息学分析流程的性能验证方案。方法:模拟三类数据集,其中CatⅠ数据集(包括CatⅠA和CatⅠB数据集)主要由病原体参考基因组及人源序列组成,CatⅠA数据集为常见病原体以及人源...

            【关键词】 基因生物信息学病原体

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            【中文期刊】 邓赵红  王士同  等 《生物信息学》 2004年2卷2期 13-20页ISTIC

            【摘要】 癌基因表达数据集具有小样本、高维数之特点,一般的机器学习机难以对其有效分类.因此,通常需要采用某些特征提取度量标准来进行降维处理.可是常用的一些特征提取度量标准亦会导致分类效果欠佳之问题.依据微分容量控制学习机DCCM,提出了一个新的特征提...

            【关键词】 生物信息学微分容量控制特征提取

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            【中文期刊】 李炜疆  宋江宁  《无锡轻工大学学报》 2001年20卷4期 340-343页

            【摘要】 高质量蛋白质结构及其对应基因序列数据是研究蛋白质折叠与蛋白质编码序列关系问题的基础.通过查询SWISS-PROT数据库中E. coli的蛋白质,得到不同数据库中的蛋白质结构与基因序列的交叉索引表,在此基础上,删除大量冗余及不可靠数据,最后得...

            【关键词】 基因序列蛋白质结构数据集

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            【中文期刊】 丛瑞  李星宇  等 《中国生物化学与分子生物学报》 2022年38卷7期 926-935页MEDLINEISTICPKUCSCDCABP

            【摘要】 线粒体是持续进行分裂和融合的动态细胞器.近年来,除了线粒体代谢作用相关的研究之外,线粒体动力学也开始逐渐引起研究的关注.越来越多的研究表明,线粒体动力学与肿瘤细胞生物学行为具有相关性.线粒体分裂蛋白1(mitochondrial fissi...

            【关键词】 线粒体分裂蛋白1癌症基因数据集线粒体

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            【中文期刊】 张晓东  陈汉涛  《生物医学工程学杂志》 2015年32卷1期 93-98页MEDLINEISTICPKUCA

            【摘要】 在生物和医学研究中采用基因矩阵技术为癌症诊断和治疗提供了一条新思路,为了发现不同癌症类型和准确地对癌症样本进行分类,提出了基于神经气体(NG)算法的聚类集成算法框架双神经气体聚类集成(DNGCE)去挖掘含有噪音的癌症基因数据集的内在结构.该...

            【关键词】 聚类集成神经气体算法基因数据集

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            【中文期刊】 石洁  常文静  等 《中国防痨杂志》 2025年47卷6期 769-778页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 目的:利用生物信息学方法鉴定结核病表达差异基因及相关信号通路,以发现可用于结核病诊断的生物标志物.方法:从高通量基因表达数据库(GEO)中搜索结核病患者样本及健康人群的基因表达芯片数据集,下载GSE139825基因芯片微阵列数据集作为分析数...

            【关键词】 结核基因组文库数据挖掘

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