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【中文期刊】 田晓军 张日新 《合成生物学》 2025年6卷3期 532-546页
【摘要】 在合成生物学中,基因模块是执行生物功能的核心元件."模块性"是指已知基因元件在被拼装为目的基因回路后仍能保持其功能相对独立的特性.不同于传统工程学独立且稳定的特性,基因回路存在于动态变化的细胞环境中,其功能蛋白的表达效率高度依赖于胞内资源....
- 概要：
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【中文期刊】 邢永华 宋培培 等 《中国高原医学与生物学杂志》 2022年43卷3期 184-199页CA
【摘要】 目的 初步筛选小细胞肺癌(Small-cell lung carcinoma,SCLC)的枢纽基因,为多靶标治疗提供线索.方法 利用加权基因共表达网络技术分析SCLC基因表达谱特征及相关枢纽基因.结果 确定了7 844个差异基因,8个基因模...
- 概要：
- 方法：
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【中文期刊】 朱晶 沈晓沛 等 《遗传》 2010年32卷7期 694-700页MEDLINEISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 癌基因组的体细胞突变扫查数据为研究人员发现新的癌基因提供了大量的信息.已有的通过基因突变频率寻找候选癌基因的方法倾向于发现突变频率较高的癌基因,但是部分低频率突变的基因也可能在癌症发生过程中发挥重要作用.具有相似系统发生谱并且具有蛋白互作关...
- 概要：
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【中文期刊】 胡文良 郑艳秋 等 《海南医学》 2017年28卷22期 3613-3617页ISTICCA
【摘要】 目的 利用生物信息学模块化分析方法,筛选头颈部鳞癌中的功能性基因模块,为头颈部鳞癌的研究和治疗提供新的靶点.方法 获取GEO数据库中头颈部鳞癌的全基因组数据(GSE6631)后,利用R语言limma包筛选头颈部鳞癌中差异表达基因.通过STR...
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【中文期刊】 张姝 崔晓波 等 《局解手术学杂志》 2016年25卷11期 781-783,784页ISTIC
【摘要】 目的：基于蛋白质互作网络，筛选调节鼻咽癌的基因模块，为鼻咽癌的分子诊断和治疗提供新的靶点。方法利用 GEO 数据库中鼻咽癌的数据集（GSE12452）和 SAM软件，筛选鼻咽癌中差异表达基因。利用 String 数据库，建立鼻咽癌中差异表达...
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【中文期刊】 孙娟 王薇 等 《局解手术学杂志》 2016年25卷11期 789-792页ISTIC
【摘要】 目的：筛选下咽癌中发挥重要作用的基因功能模块和调节这些模块的潜在抗癌药物，为下咽癌的分子治疗提供新靶点。方法利用 GEO 数据库和 MeV 软件筛选下咽癌中差异表达的基因。利用 STRING 数据库，获得差异基因的蛋白质互作网络关系，然后利...
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【中文期刊】 张淑梅 张彬 等 《生物信息学》 2014年3期 189-195页ISTIC
【摘要】 肿瘤的发生受遗传学和表观遗传学修饰的共同影响。 DNA甲基化是一种重要的表观遗传修饰，在癌症的发生与发展中起着重大的作用。因此找到癌症的甲基化标记物在癌症的诊断和治疗中具有重大意义。本文利用权重基因共表达网络分析的方法（ WGCNA）筛选出...
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【中文期刊】 王一斌 程咏梅 等 《东南大学学报（自然科学版）》 2016年46卷2期 265-270页
【摘要】 为解决乳腺癌疾病模块挖掘方法中基因表达谱样本数量少、数据不完整、存在噪声和偏差的问题，提出了一种基于关键节点子团和局部适应度的候选疾病模块挖掘算法———KNGLF算法．该算法首先将候选基因与致病基因间的重叠相似性得分和功能相似性得分进行融合...
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- 结论：
【中文期刊】 齐红霞 古海博 等 《中国循环杂志》 2025年40卷5期 486-493页ISTICPKUCSCD
【摘要】 目的:建立钙化性主动脉瓣疾病(CAVD)相关基因调控网络,揭示基因之间的相互作用对CAVD的影响.方法:本研究提出一种基于共表达模式的启发式基因调控网络构建方法,以阐明CAVD相关基因之间的相互作用.首先,采用差异表达基因方法筛选基因,并采...
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