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            【中文期刊】 黎勇  孙明伟  等 《食用菌学报》 2022年29卷6期 1-13页

            【摘要】 对采集自四川省内江市东兴区高桥村灌木林的鸡(土从)菌(Termitomyces albuminosus)进行基因组测序、组装、基因功能注释、碳水化合物酶(carbohydrate-active enzyme,CAZy)预测、进化树构建、同源...

            【关键词】 鸡(土从)菌白蚁基因组组装

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            【中文期刊】 吴清发  《遗传》 2003年25卷6期 708-712页MEDLINEISTICPKUCSCDCABP

            【摘要】 基因组学是以一个物种的全部遗传信息为研究对象,在整体上研究遗传信息的分子组成、组织结构、表达调控和进化等内在机制的基础性学科.基因组学研究中海量数据的存储、管理和检索,以及对这些数据进行挖掘等过程,必须借助于生物信息学的方法.目前,大量成熟...

            【关键词】 基因组比对组装

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            【中文期刊】 徐晓蒙  康怀兴  等 《生物技术通讯》 2015年26卷3期 408-410页ISTICCA

            【摘要】 目的:探寻一种简单、经济的方法,解决基因组序列拼接中的重复序列问题.方法:选取序列拼接中遇到重复序列问题的质粒NDM-BTR,在其与重复序列相关的contigs两端设计引物,进行实时定量PCR,通过观察临界循环数来判断contig之间的位置...

            【关键词】 高通量测序重复序列基因组序列组装

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            【中文期刊】 林星桦  周大颜  等 《基因组学与应用生物学》 2023年42卷6期 610-619页ISTICPKUCSCDCA

            【关键词】 胡子鲇基因组Survey基因组组装

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            【中文期刊】 蒋明  王军峰  等 《中草药》 2020年51卷2期 461-468页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 目的 以药用植物三叶崖爬藤为材料,在利用高通量技术测定DNA序列的基础上,对叶绿体基因组进行组装和序列分析,为进一步开展群体遗传学和多样性研究奠定基础.方法 利用HiSeq XTen测定三叶崖爬藤的DNA序列,用NOVOPlasty组装叶绿...

            【关键词】 三叶崖爬藤叶绿体基因组组装

            OA
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            【中文期刊】 李萍  黄文丽  等 《微生物学通报》 2024年51卷5期 1583-1599页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 [背景]一些具有金属抗性的微生物被发现能降低土壤中金属的有效性,减少金属在植物中的转运和积累,同时具有促进植物生长的作用,表现出较低的成本效益和环境生态友好性,在农业、工业和环境领域具有广阔的应用前景.[目的]分离筛选并获得耐Cd(Ⅱ)优质...

            【关键词】 微小杆菌扫描电镜透射电镜

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            【学位论文】 作者:张春意导师:焦文标   华中农业大学   药学 生物与医药(硕士) 2023年

            【摘要】 单体型是个体中完全遗传自父母双方中一个亲本的一系列遗传变异位点的组合,又称单倍体型或者单倍型。单倍型基因组组装即获取两套同源染色体的DNA序列,以弥补常规基因组组装中被忽视的等位序列变异信息。单倍型信息在等位差异分析、连锁和关联分析、群体遗...

            【关键词】 人类基因组单体型

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            【中文期刊】 李伟  朱明玉  等 《世界科学技术-中医药现代化》 2025年27卷1期 36-55页ISTICPKUCSCD

            【摘要】 目的 使用混合组装技术对采集的5种黄精属植物叶绿体基因组进行组装,利用比较基因组方法分析其种内及种间差异,探究其密码子使用模式及影响因素,并解析黄精属的系统发育关系.方法 本研究使用Unicycler软件混合组装5种黄精属植物的叶绿体基因组...

            【关键词】 黄精属叶绿体基因组混合组装

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            【学位论文】 作者:古盛强导师:杨爽   范广益   中国科学院大学   生物学 生物工程(硕士) 2022年

            【摘要】 微生物与人类生活有着千丝万缕的联系,它们干扰不同的生理过程和生态环境,从而影响人类健康。过去,研究微生物仅限于可以在实验室培养的物种,但是对于大量无法分离培养的微生物,研究难以开展。宏基因组学为我们提供了研究微生物组的新途径,从研究单个物种...

            【关键词】 微生物群落基因组

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            【学位论文】 作者:吕梦娜导师:罗军伟   王硕   河南理工大学   软件工程 软件工程(硕士) 2021年

            【摘要】 从头序列组装的目的是获取完整的基因组,有助于后续的基因识别、基因组比对和结构变异检测等研究。Scaffolding方法是从头序列组装中一个重要步骤,主要目的是确定contigs的顺序和方向,使其更加连续和完整。但是,现有的组装工具还不能生成...

            【关键词】 Hi-C读数统计特征从头序列组装

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