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【中文期刊】 张极峰 白晓轩  等 《生物学杂志》 2024年41卷5期 20-25页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 为充分解析草酸青霉SG-4的遗传信息,利用二代Illumina测序和三代PacBio测序相结合的方法对SG-4的全基因组进行测序,经过基因组组装、基因预测和功能注释后,对全基因组进行共线性分析和次级代谢产物合成基因簇预测.结果表明,草酸青霉...

【关键词】 草酸青霉； SG-4； 基因组；

【中文期刊】 彭乔木 范诗秋  等 《吉首大学学报（自然科学版）》 2024年45卷5期 52-60页

【摘要】 为了阐明前列腺增生患者术前和术后尿液菌群特征,探究差异微生物类群发挥作用的机理,采用宏基因组鸟枪法对健康人群(对照)、前列腺增生患者术前和术后尿液样品进行测序,并利用相关软件进行生物信息学分析.结果表明:尿液微生物多样性呈现出术前组明显低于...

【关键词】 前列腺增生； 尿液菌群； 宏基因组测序；

【中文期刊】 刘芳 舒志强  等 《食品科学》 2024年45卷22期 73-84页

【摘要】 为了详细解析从仿刺参肠道中分离出1 株具有较高酶活力高产褐藻胶裂解酶菌株S10的基因组序列信息,进而深入挖掘与褐藻胶裂解酶相关的基因资源,本研究通过形态学观察和16S rRNA序列分析对菌株S10进行菌种鉴定,然后利用Illumina二代测...

【关键词】 褐藻胶裂解酶； 溶藻弧菌； 全基因组测序；

【中文期刊】 陈志娜 尹琳琳  等 《食品科学》 2024年45卷22期 43-50页

【摘要】 为了深入挖掘对耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(methicillin-resistant Staphylococcus aureus,MRSA)具有显著抑制作用的植物乳植杆菌CHEN1细菌素基因簇,使用PacBio RS和Illumina测序平台...

【关键词】 植物乳植杆菌； 全基因组； 功能注释；

【中文期刊】 马浩天 李杨  等 《中国畜牧兽医》 2024年51卷12期 5117-5127页

【摘要】 [目的]贝莱斯芽孢杆菌(Bacillus velezensis)CM7-4是从海水中分离的具有良好抗菌活性的芽孢杆菌.本试验旨在探究贝莱斯芽孢杆菌CM7-4的抗菌机理,并对其全基因组序列进行分析,以期挖掘其抗菌等功能特性基因.[方法]通过酸...

【关键词】 芽孢杆菌； 全基因组测序； 细菌素；

【中文期刊】 罗婷 韩著  等 《畜牧兽医学报》 2024年55卷5期 2154-2167页

【摘要】 旨在进一步完善牛支原体全基因组数据库,阐明其生物学功能和遗传进化关系,对西藏牦牛源牛支原体T10株进行了全基因组测序及其序列分析.使用Nanopore和Illumina PE150测序平台对T10株进行全基因组序列测定,利用生物信息学对其进...

【关键词】 牦牛； 牛支原体； 全基因组测序；

【中文期刊】 陈冠益 陈红云  等 《生物学杂志》 2023年40卷1期 34-39,45页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 从天津市大港油田附近土壤中分离的新型细菌Falsochrobactrum TDYN1.基于lllumina Hiseq 2000平台对TDYN1进行de novo测序分析,用GO、COG、KEGG、NR以及Swiss-Prot数据库进行基因...

【关键词】 石油降解菌； Falsochrobactrum TDYN1； 基因组测序；

【中文期刊】 周魏 余金凤  等 《微生物学杂志》 2023年43卷6期 42-53页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 地衣芽胞杆菌(Bacillus licheniformis)NWMCC0046是从西藏日喀则地区屠宰场废弃血污放置土壤中分离得到的一株益生菌,产生的碱性蛋白酶在低温下有作为洗涤剂添加酶的潜力.深入分析菌株NWM-CC0046的基因组序列信息...

【关键词】 地衣芽胞杆菌； 碱性蛋白酶； 全基因组；

【中文期刊】 许楠 杨旭东  等 《现代检验医学杂志》 2023年38卷3期 58-64页 ISTICCA

【摘要】 目的 应用全基因组测序及生物信息学分析方法 对一株分离自腹膜间皮瘤患者血液标本中的卡明斯假谷氨酸杆菌菌株进行基因测序和功能分析.方法 于2018年8月2日～8月15日,两次从临床患者血液中分离出的微生物经基质辅助激光解析电离-飞行时间质谱(...

【关键词】 卡明斯假谷氨酸杆菌； 全基因组测序； 基因注释；

【中文期刊】 石育弘 王鑫  等 《中国烧伤创疡杂志》 2023年35卷3期 178-184页 ISTIC

【摘要】 目的 基于网络药理学研究生肌玉红膏治疗糖尿病溃疡的作用机制.方法 以口服生物利用度(OB)≥30％和类药性(DL)≥0.18为标准通过中药系统药理学数据库与分析平台检索生肌玉红膏的活性化学成分及作用靶点,使用Uniprot蛋白质数据库进行标...

【关键词】 糖尿病溃疡； 生肌玉红膏； 网络药理学；