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            【中文期刊】 高亚男  朱凤妹  等 《菌物学报》 2021年40卷7期 1737-1750页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 黑曲霉3.316是一株耐热型丝状真菌,最高生长温度达47℃,在工业发酵中有着巨大的应用潜力.为了更加充分地在工业发酵中利用其耐热特性,需要对菌株信息进行全面了解.通过PacBio Sequel测序平台的CLR测序方式对黑曲霉3.316菌株进...

            【关键词】 黑曲霉基因组测序基因功能注释

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            【中文期刊】 《浙江大学学报(英文版)(B辑:生物医学和生物技术)》 2019年20卷6期 476-487页SCIMEDLINEISTICCSCDCABP

            【摘要】 越来越多证据表明RNA在生物系统中扮演着重要的角色,而这些发现支持了生命起源于RNA的假设.在人类基因组中,大部分的基因并不编码蛋白质,被称为非编码RNA基因.长非编码RNA(lncRNA)是其中最大的一类,其转录本长度大于200个核苷酸....

            【关键词】 长非编码RNA(lncRNA)功能注释基因组数据挖掘

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            【中文期刊】 闫倩倩  刘杏忠  等 《微生物学报》 2019年59卷2期 280-290页MEDLINEISTICPKUCSCDCABP

            【摘要】 [目的]鉴定洛斯里被毛孢OWVT-1菌株的线粒体基因组,验证公布的USA-87-5菌株线粒体基因组中的错误,对洛斯里被毛孢正确的线粒体基因组序列进行注释并开展不同被毛孢物种间的比较线粒体基因组学分析.[方法]借助DNA高通量测序数据并通过必...

            【关键词】 洛斯里被毛孢线粒体基因组校正

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            【中文期刊】 张博阳  朱天辉  等 《微生物学通报》 2018年45卷4期 805-818页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 [背景]桑氏链霉菌(Streptomyces sampsonii) KJ40是一株具有防病、促生多重功能的放线菌,有作为生物农药的潜力.目前还没有相关研究报道S. sampsonii全基因组序列,这限制了其功能基因、代谢产物合成途径及比较基...

            【关键词】 桑氏链霉菌基因组基因注释

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            【中文期刊】 陈军  郑华军  等 《中国生物工程杂志》 2018年38卷7期 21-28页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 开展雨生红球藻基因组测序研究,对于解读绿藻起源与进化及生物逆境胁迫响应机制,以及推动雨生红球藻产业发展都具有重要意义.利用Illumina Hiseq 2500对雨生红球藻(Haematococcus pluvialis)进行高通量测序,获...

            【关键词】 雨生红球藻基因组测序基因预测

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            【中文期刊】 刘伟  李立  等 《生物工程学报》 2017年33卷11期 1791-1801页MEDLINEISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 高通量生物监测方法可以同时检测同一样本的上千个参数,其在生物医学中的应用越来越广泛,但如何系统地分析并从高通量数据中挖掘有用信息,仍是一项重要的课题.网络生物学的出现使人们对复杂生物系统有了更深刻的理解,组织/细胞功能执行具有模块化特点.目...

            【关键词】 权重基因共表达网络分析高通量技术疾病

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            【中文期刊】 尹传林  李美珍  等 《环境昆虫学报》 2017年39卷1期 1-18页ISTICPKUCSCD

            【摘要】 基因组序列为昆虫分子生物学研究提供丰富的数据资源,推动系统生物学在古老的昆虫学中蓬勃发展.昆虫基因组学研究已经成为当前的研究热点,目前在NCBI登录注册的昆虫基因组测序计划有494项,其中已提交原始测序数据的昆虫有225种,完成基因组拼接的...

            【关键词】 昆虫基因组组装与注释数据挖掘与分析

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            【中文期刊】 王小婷  张玉娟  等 《昆虫学报》 2016年59卷10期 1058-1068页ISTICPKUCSCDCABP

            【摘要】 [目的]中华按蚊Anopheles sinensis是我国及东南亚重要的传疟媒介.本研究在全基因组上鉴定和分析中华按蚊微卫星并注释微卫星相关基因的功能,为遗传分子标记的筛选提供依据,也为昆虫微卫星比较基因组学进一步研究提供基础.[方法]用M...

            【关键词】 中华按蚊基因组微卫星

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            【中文期刊】 王晨  杜联明  等 《昆虫学报》 2015年58卷10期 1037-1045页ISTICPKUCSCDCABP

            【摘要】 [目的]分析德国小蠊Blattella germanica全基因组中微卫星的数量和分布规律,并对外显子中含有微卫星的基因进行功能注释.[方法]使用微卫星搜索软件查找德国小蠊基因组中微卫星的数量、重复次数以及所有微卫星的位置信息,编写Pyth...

            【关键词】 德国小蠊微卫星生物信息学

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            【中文期刊】 张长青  上官凌飞  等 《植物学报》 2015年50卷3期 388-393页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 目前,大量园艺植物基因组测序已经完成或接近尾声,它们的基因组序列和注释数据极大地促进了功能基因组学研究.为给科研人员提供批量下载特定的基因组区段序列和注释平台,笔者开发了一个称为OBRRP的生物信息学工具.OBRRP具有提取葡萄(Vitis...

            【关键词】 基因组序列提取注释提取

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