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【中文期刊】 陈泉 刘勇 等 《基因组学与应用生物学》 2024年43卷7期 1260-1274页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 为明确红胸黑翅萤(Luciola kagiana Matsumura,1928)(Coleoptera:Lampyridae)的线粒体基因组结构及熠萤亚科的分子系统发育关系,本研究对红胸黑翅萤的线粒体基因进行了测序、组装、注释和特征分析.结...
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【中文期刊】 段春燕 王晓凌 《湖南农业大学学报（自然科学版）》 2024年50卷3期 27-34页
【摘要】 采用Illumina HiSeq X Ten平台测序和生物信息法对唐古特扁桃叶绿体基因组序列特征进行解析.结果表明:唐古特扁桃叶绿体基因组为四分体式结构,完整叶绿体基因组序列全长158 166 bp,G+C含量 36.8%,注释131个基因...
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【中文期刊】 张倩 张德全 《广西植物》 2022年42卷10期 1750-1761页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 白花刺续断在中国西藏是一种常用的药用植物,但其叶绿体全基因组的相关研究较少.为揭示该物种叶绿体全基因组的基本特征并探讨其谱系遗传结构,该研究利用Illumina测序平台对来自5个野生居群的10个白花刺续断个体进行二代测序,经组装、注释,得到...
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【中文期刊】 王耀卓 张文强 等 《河北大学学报（自然科学版）》 2023年43卷2期 171-178页
【摘要】 为了筛选出最适合于超级保守元件(ultra-conserved elements,UCE)序列组装的软件,分别使用5款组装软件SPAdes、ABySS、Velvet、Trinity和Minia对17个UCE捕获测序文库进行组装.结果发现:5...
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【中文期刊】 赵玉芬 《生物学教学》 2022年47卷3期 83-85页PKU
【摘要】 叶绿体是植物把光能转化为化学能的重要细胞器,具有独立的基因组,随着基因测序技术的发展,叶绿体基因组在植物学研究中的应用越来越广泛.本文介绍了叶绿体基因组的结构并综述了其在光合作用机制、物种鉴定、系统发育、居群遗传学、谱系地理学、核质互作和叶...
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【中文期刊】 闫利平 裴文娅 等 《昆虫学报》 2021年64卷6期 757-768页ISTICPKUCSCDCABP
【摘要】 有瓣蝇类(Calyptratae)隶属于昆虫纲(Insecta)四大超适应辐射类群之一的双翅目(Diptera),占双翅目已知物种多样性的近20％.有瓣蝇类分布广泛,生物学习性极为多样,在维系生态系统稳定中发挥着重要作用,是媒介、法医、传粉...
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【中文期刊】 刘齐 杨世兴 等 《中国动物传染病学报》 2022年30卷1期 39-43页
【摘要】 利用病毒宏基因组学(viral metagenomics)方法,本研究从95份林麝粪便样品中检测到1株新型圆环病毒样(Circovirus-like)病毒,经过拼接获得其全基因组序列,该毒株命名为ls-cyc.其基因组全长约3552 nt,...
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【中文期刊】 张耀刚 马艳艳 等 《中国人兽共患病学报》 2019年35卷3期 271-277页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 目的 利用生物信息学技术分析棘球属绦虫线粒体基因组全序列碱基组成、基因的结构组成及排列、蛋白基因核苷酸序列变异位点、密码子使用情况及偏好性、系统发育等,为研究棘球绦虫系统起源、演化、分类及亲缘关系等提供理论基础.方法 从GenBank数据库...
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【中文期刊】 秦婧靓 杨超 等 《军事医学》 2021年45卷10期 757-761,765页ISTICCSCDCA
【摘要】 目的 明确1994年苏拉特鼠疫疫情中分离的鼠疫耶尔森菌系统发育地位及基因组特征,为进一步研究此次疫情暴发的起因提供线索.方法 利用比较基因组学方法,将已发表的两株苏拉特暴发株基因组与366个鼠疫全球代表菌株的基因组进行变异鉴定和系统发育重建...
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【中文期刊】 李红 唐炜 等 《江苏大学学报（医学版）》 2021年31卷5期 401-405,411页ISTICCA
【摘要】 目的:了解人双埃柯病毒(human parechovirus,HPeV)在新生儿中的流行情况.方法:采集新生儿血液、粪便及鼻咽分泌物样本各95份,共计285份样本.将其中45份新生儿粪便样本分为5组,利用病毒宏基因组学方法进行文库构建,再经...
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