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          【中文期刊】 张彦位  杨玲  等 《食品工业科技》 2022年43卷15期 444-450页

          【摘要】 乳酸菌在自然界中广泛存在,具有丰富的物种多样性,在食品、饲料和医药等领域广泛应用,目前市场上绝大多数的益生菌都是乳酸菌.近年来,全基因组测序技术蓬勃发展,大大促进了乳酸菌资源的开发与应用.基于乳酸菌的全基因组信息可以系统且全面地了解菌株的代...

          【关键词】 乳酸菌基因组安全性

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          【中文期刊】 高聪  袁炜佳  等 《食品与生物技术学报》 2025年44卷7期 21-30页

          【摘要】 [目的]构建并解析L-苹果酸高产菌株米曲霉(Aspergillus oryzae,A.oryzae)FMME-S-38的基因组规模代谢网络模型(GSMM).[方法]通过粗模型构建和模型精细优化2个步骤,构建L-苹果酸高产菌株米曲霉FMME-...

          【关键词】 米曲霉FMME-S-38基因组规模代谢网络模型L-苹果酸

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          【中文期刊】 虞思倩  夏建业  等 《中国生物工程杂志》 2022年42卷1期 128-138页ISTICPKUCSCDCA

          【摘要】 高通量组学技术为人们研究生命系统组件提供了细节数据,通过对基因组、转录组、蛋白质组及代谢组等不同生命层级间相互作用的研究,推动了生化反应网络的重建——基因组规模代谢网络模型(genome scale of metabolic network...

          【关键词】 基因组规模代谢网络模型热力学约束分析

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          【中文期刊】 李雪菲  郭超豪  等 《微生物学报》 2025年65卷10期 4374-4391页ISTICPKUCSCDCABP

          【摘要】 [目的]利用基因组尺度代谢网络模型指导大肠杆菌的遗传修饰,构建可积累丙酮酸的突变株.[方法]以基因组规模的代谢网络模型为指导,模拟大肠杆菌丙酮酸的积累过程,筛选代谢途径中的关键基因,并确定基因编辑策略.具体敲除乙酸激酶基因ackA、磷酸乙酰...

          【关键词】 大肠杆菌丙酮酸基因组规模代谢网络模型

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          【中文期刊】 刘立明  刘婷  等 《生物加工过程》 2012年10卷6期 70-77页ISTICCABP

          【摘要】 工业微生物是微生物制造的核心,而微生物制造过程中微生物的生产性能是提高微生物制造过程效率的关键.结合基于约束条件的优化算法的基因组规模代谢网络模型是全局规模上认识、调控和优化工业微生物生理功能的重要平台.本文在简述基因组规模代谢网络模型构建...

          【关键词】 基因组规模代谢网络模型基于约束的算法工业微生物

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          【中文期刊】 张晨阳  武耀康  等 《生物工程学报》 2021年37卷3期 860-873页MEDLINEISTICPKUCSCDCA

          【摘要】 基因组规模代谢网络(Genome-scale metabolic network model,GSMM)是工业微生物菌株定向改造过程中一种极为重要的指导性工具,有助于研究者快速获取特定性状的工业微生物,因此越来越受到人们的关注.文中回顾了 ...

          【关键词】 典型工业微生物基因组规模代谢网络模型模型构建

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          【中文期刊】 周静茹  刘鹏  等 《生物工程学报》 2021年37卷5期 1526-1540页MEDLINEISTICPKUCSCDCA

          【摘要】 基因组规模代谢网络模型(Genome-scale metabolic network model,GSMM)正成为细胞代谢特性研究的重要工具,经过多年发展相关理论方法取得了诸多进展.近年来,在基础GSMM模型基础上,通过整合基因组、转录组、...

          【关键词】 基因组规模代谢网络模型多组学热力学

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          【中文期刊】 孙伟康  张娟  等 《生物工程学报》 2020年36卷8期 1629-1639页MEDLINEISTICPKUCSCDCA

          【摘要】 随着后基因组时代的到来,工业微生物的代谢工程改造在工业生产上发挥着越来越重要的作用.而基因组规模代谢网络模型(Genome-scale metabolic model,GSMM)将生物体体内所有已知代谢信息进行整合,为全局理解生物体的代谢状...

          【关键词】 乳酸乳球菌NZ9000基因组规模代谢网络模型模型验证

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          【中文期刊】 叶超  徐楠  等 《生物工程学报》 2019年35卷10期 1901-1913页MEDLINEISTICPKUCSCDCA

          【摘要】 为了快速、高效地理解工业微生物胞内代谢特征,寻找潜在的代谢工程改造靶点,基因组规模代谢网络模型(GSMM)作为一种系统生物学工具越来越受到人们的关注.文中在回顾GSMM 20年发展历程的基础上,分析了当前GSMM的研究现状,总结了GSMM的...

          【关键词】 微生物胞内代谢生产性能基因组规模代谢网络模型

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          【中文期刊】 隋雨菲  欧阳立明  等 《生物工程学报》 2016年32卷8期 1010-1025页MEDLINEISTICPKUCSCDCA

          【摘要】 黑曲霉作为重要的工业发酵菌株,被广泛用于多种有机酸和工业用酶的生产.随着组学技术的日益发展和成熟,黑曲霉的基因组、转录组、蛋白质组、代谢组等组学数据不断增长,宣告着黑曲霉生物过程研究大数据时代的到来.从单一组学的数据分析、多组学的比较到以基...

          【关键词】 黑曲霉基因组转录组

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