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【中文期刊】 邹晶 高磊 等 《中国生物医学工程学报》 2010年29卷2期 212-219页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 挖掘特征基因是分析基因表达谱的一项基础工作,但众多的特征基因挖掘方法所挖掘的特征基因集合并不完全一致.本研究试图从生物功能和样本分类能力两个方面,分析比较不同方法所挖掘的特征基因的功能一致性,并对RankGene中的八种不同特征基因挖掘方法...
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【中文期刊】 刘亚杰 高莲 等 《生物医学工程与临床》 2020年24卷1期 75-80页ISTICCA
【摘要】 目的 基于分子生物学的微阵列基因表达数据和智能优化算法对白血病肿瘤样本进行分类研究.方法 给出基于粒子群优化(PSO)算法用于分类模型的训练和测试,选取含7 129个基因的72个白血病基因表达样本,从中选取包含50、100和200个特征基因...
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【中文期刊】 戴伟 张浩轩 等 《集成技术》 2025年14卷3期 87-101页
【摘要】 癌症是一种与基因密切相关的疾病,具有多种亚型,各亚型在遗传、表型和治疗反应上存在显著差异.准确的癌症亚型分类对个性化治疗至关重要,有助于提高治疗效果.然而,基于患者基因表达数据的癌症亚型分类方法在样本不均衡的情况下,往往难以有效区分稀有亚型...
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【学位论文】 作者:李珉导师:王树林 陈治平 湖南大学 计算机科学与技术 计算机技术(硕士) 2012年
【摘要】 基因芯片技术可以同时快速检测成千上万个基因的表达水平,但由于受采样成本的限制,由此获得的基因表达谱数据具有高维小样本的特点。基于基因表达谱,在分子水平上对肿瘤数据的分类具有重要的研究价值,然而,由于基因表达谱数据的“高维小样本”特性使得许多...
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【学位论文】 作者:杨昆导师:李建中 哈尔滨工业大学 计算机科学与技术 计算机软件与理论(博士) 2008年
【摘要】 基因表达水平是衡量基因功能活动的重要指标。基因表达的信息是理解基因功能和基因调控的潜在机制的一个重要线索。基因芯片(微阵列)具有在单一的实验中并行地检测任何细胞或组织类型中成千上万个基因的表达水平的能力,已经成为生物学和医学研究领域中常用的...
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【学位论文】 作者:李伍举导师:王升启 范明 中国人民解放军军事医学科学院 解放军军事医学科学院 生物学 生物化学与分子生物学(博士) 2003年
【摘要】 基于基因芯片技术,可以同时观察在某一生命现象中成千上万个基因的动态表达水平,使得人们能够在基因组水平上以系统的、全局的观念去研究生命现象及其本质;但是,通过基因芯片实验直接获得的是一个基因表达谱,其实际应用要通过对基因表达谱的生物信息学处理...
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【中文期刊】 秦喜文 王芮 等 《中国生物医学工程学报》 2022年41卷2期 177-185页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 乳腺癌基因数据的分类研究在临床医学上具有重要意义.针对基因数据的结构复杂、高维小样本等特点,提出一种最大相关最小条件冗余和深度级联森林结合的基因数据分类方法.选取博德基因研究所乳腺癌基因表达数据集,共98个数据作为样本,每个样本包含1 21...
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【中文期刊】 韩磊 黄瑞龙 等 《智慧健康》 2022年8卷17期 1-4页
【摘要】 肿瘤基因表达数据具有高维小样本、类别分布不平衡等特点,导致传统方法对其准确分类面临新的挑战.为此,本文提出一种基于Weka平台和代价敏感特征选择的基因表达数据分类方法.首先,对实验中所采用的6组肿瘤基因表达数据进行标准化预处理;然后,通过W...
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【中文期刊】 潘以红 范雪萌 等 《生物学杂志》 2019年36卷2期 22-27,40页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 为了识别肺癌发展过程中的关键基因,揭示其发展的潜在机制,得到肺癌的预测模型,从GEO(Gene Ex-pression Omnibus)数据库下载了基因芯片GSE19188和GSE40791进行研究.首先对基因表达数据分析得到805个同趋势...
【关键词】 肺癌;差异表达基因(DEGs);蛋白质交互(PPI)网络;
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【中文期刊】 王世祥 张飞 等 《中国生物医学工程学报》 2016年35卷3期 301-309页ISTICPKUCSCDCA
【摘要】 吸烟是导致肺癌的一个重要诱导因素,从全基因组基因甲基化水平出发,利用生物信息学方法,通过建立对当前吸烟/不吸烟样本的模式识别分类模型,识别甲基化特征基因,为揭示不吸烟肺癌患者的患病机理奠定基础.为避免甲基化微阵列数据超高维小样本、高噪声、高...
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