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【中文期刊】 章子怡 王棨临  等 《遗传》 2024年46卷10期 820-832页 MEDLINEISTICPKUCSCDCABP

【摘要】 乳腺癌的高度异质性导致其治疗及预后评估较为复杂.治疗方案的选择受到肿瘤亚型、病变分级、基因型等多种因素的影响,因此需要制定个体化治疗策略.患者的预后效果因病情不同而产生显著差异.作为人工智能的一个重要分支,机器学习能高效处理海量数据,并实现...

【关键词】 乳腺癌； 机器学习； 多组学数据整合分析；

【中文期刊】 杨品 任振华  等 《基因组学与应用生物学》 2024年43卷7期 1196-1213页 ISTICPKUCSCDCA

【摘要】 多模态组学数据的联合运用在揭示细胞异质性和解析细胞命运调控机制方面具有重要意义,目前已有多种方法被开发,用于处理不同组学模态数据的整合.本研究通过对应用于不同整合任务的多种数据整合方法进行性能评测,为相关领域的研究提供有益参考.使用6个联合...

【关键词】 单细胞组学； 空间转录组学； 多模态组学；

【中文期刊】 贾聪聪 杜港  等 《中国卫生统计》 2024年41卷5期 644-649页 ISTICPKUCSCD

【摘要】 目的 探讨将生存结局加权的多组学数据整合方法survClust应用于胶质瘤(glioma)数据,以识别具有显著分子异质性和预后差异的胶质瘤分子分型.方法 采用survClust方法对中国胶质瘤基因数据库(Chinese glioma ge-...

【关键词】 生存结局加权聚类； 分子亚型； 多组学数据整合；

【中文期刊】 师国京 李灵梅  等 《中国卫生统计》 2024年41卷3期 376-381页 ISTICPKUCSCD

【摘要】 目的 针对网络增强的相似网络融合(network enhancement fusion,ne-SNF)方法先融合不同组学网络,再对融合后的网络降噪,忽略了不同组学相似网络噪声对融合网络影响的问题,本文提出了改进的网络增强融合(im-prov...

【关键词】 改进的网络增强融合； 乳头状肾细胞癌； 多组学数据整合；

【中文期刊】 张甜甜 赵庶旭  等 《计算机应用与软件》 2024年41卷6期 79-84页

【摘要】 肝癌是威胁人类健康的常见恶性肿瘤之一.通过对基因数据使用深度学习方法进行整合来系统地获取对肝癌的认知,使用多组学的疾病分析方法来探究各组学之间的相互关系,有助于更准确的临床决策.然而,由于多组学数据具有高维稀疏性,存在大量的冗余特征和较少的...

【关键词】 堆叠降噪； 自动编码器； 数据降维；

【中文期刊】 李灵梅 魏亿芳  等 《中国卫生统计》 2022年39卷4期 522-528页 ISTICPKUCSCD

【摘要】 目的 探讨局部保留投影的正则化多核学习(regularized multiple kernel learning with locality preserving projections,rMKL-LPP)在乳头状肾细胞癌(papillar...

【关键词】 局部保留投影的正则化多核学习； 多组学数据整合； 分子亚型；

【中文期刊】 徐臻旖 王策  等 《中国卫生统计》 2020年37卷6期 822-827页 ISTICPKUCSCD

【摘要】 目的 引入关联网络融合(affinity network fusion,ANF)方法对多组学数据进行整合分析,并应用于肿瘤分子分型研究.方法 模拟产生两组学数据,改变总体差异大小等情况比较多种多组学整合方法的效果.实例分析中目标人群选择TC...

【关键词】 ANF方法； 多组学数据整合； 免疫分型；

【中文期刊】 徐欢 宋微  等 《中国卫生统计》 2019年36卷5期 774-776页 ISTICPKUCSCD

【摘要】 目的 引入JIVE方法对多组学数据进行整合分析,并应用于肿瘤分子分型研究.方法 使用TCGA数据库中卵巢癌mRNA和miRNA的组学数据,应用JIVE方法整合分析两个组学数据,提取两不同组学数据的共同特征,然后通过对其具有共同结构的数据做主...

【关键词】 JIVE方法； 多组学数据整合； 特征提取；

【中文期刊】 黄涛 李立明  《中华流行病学杂志》 2018年39卷5期 694-699页 MEDLINEISTICPKUCSCDCA

【摘要】 医学大数据、转化医学、精准医学时代为慢性复杂疾病及其病因的研究带来新的契机.如何实现循证医学、科学转化、合理精准是我们目前面临的任务和挑战.系统流行病学是一种进行疾病危险因素风险识别的流行病学方法,是流行病学的新领域,其利用系统生物学、流行...

【关键词】 系统流行病学； 系统理论； 大数据；

【中文期刊】 刘伟 张阳  等 《国际检验医学杂志》 2018年39卷9期 1025-1028页 ISTICCA

【摘要】 随着多组学时代的到来,检验组学这一综合性科学应运而生.检验组学是综合基因组学、蛋白组学、代谢组学、免疫组学及药物基因组学等多组学的检验数据结果,并利用大数据的计算方法对各个组学的数据指标进行分析、筛选、分类、整合的多领域交叉学科.通过大数据...

【关键词】 检验组学； 临床检验数据； 大数据分析；