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            【中文期刊】 傅东升  艾克热木江·木合热木  《中国组织工程研究》 2025年29卷20期 4379-4388页ISTICPKUCA

            【摘要】 背景:多指畸形患者中参与Heghog信号通路的一些转录因子发生异常表达,这些转录因子调控大量靶基因的表达,从而影响细胞的功能.目的:通过单细胞转录组分析多指畸形患者的转录组特征.方法:从GEO公共数据库中下载4例多指畸形患者细胞间质和上皮细...

            【关键词】 指畸形转录因子生物信息学

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            【中文期刊】 杜港  贾聪聪  等 《中国卫生统计》 2025年42卷2期 185-190页ISTICPKUCSCD

            【摘要】 目的 多组学数据的高噪稀疏性以及存在异常值,易导致多组学数据整合分型稳健性不足,本研究提出将深度学习中的自编码器与最优化稳健伪极大似然估计器(optimally tuned robust improper maximum likelihoo...

            【关键词】 稳健分型深度学习数据

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            【中文期刊】 王霈虹  何昆仑  等 《解放军医学院学报》 2025年46卷1期 22-27,36页ISTICCA

            【摘要】 生物大数据通常指包括基因组、转录组、蛋白质组、表观遗传组、代谢组、微生物组等在内的各类生命组学数据,其数字化记录了以双链DNA为遗传信息源头的多层次生命活动,并反映了生命系统对环境变化的响应.生物大数据的爆发性增长得益于高通量实验技术的快速...

            【关键词】 计算生物学数据精准医学

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            【中文期刊】 李炎夫  贾晓晴  等 《中国兽医杂志》 2025年61卷5期 65-72页

            【摘要】 为探索驱虫药耐药性产生的机制,本试验对捻转血矛线虫(Haemonchus contortus)的第3期幼虫(L3)以伊维菌素、阿苯达唑和左旋咪唑药物进行处理,采用数据非依赖性采集(DIA)蛋白质组测序技术对捻转血矛线虫L3经药物作用前后的蛋...

            【关键词】 药耐药性捻转血矛线虫数据非依赖性采集(DIA)

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            【中文期刊】 章子怡  王棨临  等 《遗传》 2024年46卷10期 820-832页MEDLINEISTICPKUCSCDCABP

            【摘要】 乳腺癌的高度异质性导致其治疗及预后评估较为复杂.治疗方案的选择受到肿瘤亚型、病变分级、基因型等多种因素的影响,因此需要制定个体化治疗策略.患者的预后效果因病情不同而产生显著差异.作为人工智能的一个重要分支,机器学习能高效处理海量数据,并实现...

            【关键词】 乳腺癌机器学习数据整合分析

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            【中文期刊】 杨品  任振华  等 《基因组学与应用生物学》 2024年43卷7期 1196-1213页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 多模态组学数据的联合运用在揭示细胞异质性和解析细胞命运调控机制方面具有重要意义,目前已有多种方法被开发,用于处理不同组学模态数据的整合.本研究通过对应用于不同整合任务的多种数据整合方法进行性能评测,为相关领域的研究提供有益参考.使用6个联合...

            【关键词】 单细胞空间转录模态

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            【中文期刊】 贾聪聪  杜港  等 《中国卫生统计》 2024年41卷5期 644-649页ISTICPKUCSCD

            【摘要】 目的 探讨将生存结局加权的多组学数据整合方法survClust应用于胶质瘤(glioma)数据,以识别具有显著分子异质性和预后差异的胶质瘤分子分型.方法 采用survClust方法对中国胶质瘤基因数据库(Chinese glioma ge-...

            【关键词】 生存结局加权聚类分子亚型数据整合

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            【中文期刊】 郭妮  贾亚春  等 《西安交通大学学报(医学版)》 2024年45卷2期 244-249页ISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 目的 研究视神经病变诱导反应蛋白(optineurin,OPTN)基因在多发性骨髓瘤(multiple myeloma,MM)中的表达情况,探讨OPTN基因参与MM发生发展的机制和临床价值.方法 利用3个基因表达数据库(gene expre...

            【关键词】 基因表达数据库(GEO)癌症基因图谱(TCGA)视神经病变诱导反应蛋白(OPTN)

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            【中文期刊】 田宇轩  阮明健  等 《北京大学学报(医学版)》 2024年56卷4期 567-574页MEDLINEISTICPKUCSCDCA

            【摘要】 目的:评估前列腺影像报告和数据评分系统(prostate imaging reporting and data system,PI-RADS)中将病灶最大径15 mm作为4分升级为5分标准的合理性并进行改良,以提升对临床有意义前列腺癌(cl...

            【关键词】 前列腺肿瘤参数磁共振成像织检查

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            【中文期刊】 师国京  李灵梅  等 《中国卫生统计》 2024年41卷3期 376-381页ISTICPKUCSCD

            【摘要】 目的 针对网络增强的相似网络融合(network enhancement fusion,ne-SNF)方法先融合不同组学网络,再对融合后的网络降噪,忽略了不同组学相似网络噪声对融合网络影响的问题,本文提出了改进的网络增强融合(im-prov...

            【关键词】 改进的网络增强融合乳头状肾细胞癌数据整合

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